ミトコンドリアをもたない真核微生物群フォルニカータの多様性の解明

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23405013
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 海外学術
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 橋本 哲男 筑波大学, 生命環境系, 教授 (50208451)
• 研究分担者: 石田 健一郎 筑波大学, 生命環境系, 教授 (30282198) ; 稲垣 祐司 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (50387958)
• 研究期間 (年度): 2011-04-01 – 2014-03-31
• キーワード: フォルニカータ / 嫌気・微好気環境 / 退化型ミトコンドリア / 新奇真核微生物 / 培養株

研究概要

フォルニカータ生物群は嫌気環境に生育する鞭毛虫からなる系統群であり、環境DNA解析から多様な生物種の存在が示唆されている。これまでに調べられたいずれの生物も、酸素呼吸を行う典型的なミトコンドリアをもたず退化型のミトコンドリアをもっているため、ミトコンドリアの縮退進化を解明する上で適切なモデル系と考えられる。しかしながら、実際に単離・培養されているフォルニカータ生物の種類は必ずしも多くないため、自然環境中から新奇フォルニカータ生物を見出すことを目的として研究を行った。これまでに数種のフォルニカータ生物を含む10種以上の新規嫌気性真核微生物の単離・培養株化に成功し、一部については記載を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Palpitomonas bilix represents a basal cryptist lineage : Insight into the character evolution in Cryptista (2014)
  • 著者名/発表者名: Yabuki A, Kamikawa R, Ishikawa SA, Kolisko M, Kim E, Tanabe AS, Kume K, Ishida K, Inagaki Y
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 4 ページ: 4641
  • DOI: 10.1038/srep04641
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene-content evolution in discobid mitochondria deduced from the phylogenetic position and complete mitochondrial genome of Tsukubamonas globosa (2014)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Kolisko M, Nishimura Y, Yabuki A, Brown MW, Ishikawa SA, Ishida K, Roger AJ, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 雑誌名: Genome Biology and Evolution 巻: 6 ページ: 306-315
  • 査読あり
• [雑誌論文] Parallel re-modeling of EF-1α function in eukaryotic evolution : Divergent, low-expressed EF-1α genes co-occur with EFL genes in diverse distantly related eukaryotes (2013)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Brown MW, Nishimura Y, Sako Y, Heiss AA, Yubuki N, Gawryluk R, Simpson AGB, Roger AJ, Hahimoto T, Inagaki Y
  • 雑誌名: BMC Evol Biol 巻: 13 ページ: 131
  • DOI: 10.1186/1471-2148-13-131
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multigene phylogenies of diverse Carpediemonas-like organisms identify the closest relatives of 'amitochndriate' diplomonads and retortamonads (2012)
  • 著者名/発表者名: Takishita K, Kolisko M, Komatsuzaki H, Yabuki A, Inagaki Y, Cepicka I, Smejkalova P, Silberman JD, Hashimoto T, Roger AJ, Simpson AGB
  • 雑誌名: Protist 巻: 163 ページ: 344-355
  • 査読あり
• [雑誌論文] Separate origins of group I introns in two mitochondrial genes of the katablepharid Leucocryptos marina (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Y, Kamikawa R, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 7(5) ページ: e37307
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0037307
  • 査読あり
• [雑誌論文] RY-coding and non-homogeneous models can ameliorate the maximum-likelihood inferences from nucleotide sequence data with parallel compositional heterogeneity (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa SA, Inagaki Y, Hashimoto T
  • 雑誌名: Evolutionary Bioinformatics 巻: 8 ページ: 357-371
  • 査読あり
• [学会発表] 生命の樹-昔と今 (2013)
  • 著者名/発表者名: 橋本哲男
  • 学会等名: 日本進化学会第15回大会進化生物学夏の学校
  • 発表場所: つくば
  • 年月日: 2013-08-31
• [学会発表] A novel endomyxan amoeboflagellate isolated from Pasific ocean (2013)
  • 著者名/発表者名: Shiratori T, Ishida K
  • 学会等名: International Congress of Protistology (ICOP) XIV
  • 発表場所: Vancouver, Canada
  • 年月日: 2013-07-28
• [学会発表] 嫌気性寄生原虫におけるエネルギー代謝関連酵素の分子進化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 橋本哲男, 神川龍馬, 林奈々子, 稲垣祐司
  • 学会等名: 第82回日本寄生虫学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2013-03-29
• [学会発表] 嫌気環境に適応したフォルニカータ生物群におけるミトコンドリア関連オルガネラのトランスクリプトーム比較解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 神 川龍馬, Kolisko M, Andersson J, Simpson AGB, Roger AJ, 稲垣祐司, 橋本哲男
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] フォルニカータ生物群におけるミトコンドリア関連オルガネラの縮退進化-ハイドロジェノソームからマイトソームへ. (2012)
  • 著者名/発表者名: 神 川龍馬, Kolisko M, Andersson J, Simpson AGB, Roger AJ, 稲垣祐司, 橋本哲男
  • 学会等名: 第72回日本寄生虫学会東日本支部会・第10回分子寄生虫マラリアフォーラム合同大会
  • 発表場所: 前橋
  • 年月日: 2012-10-12
• [学会発表] A new strategy of organellar genome sequencing incorporating rolling circle amplification : protist mitochondria genomes (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Y, Kamikawa R, Inagaki Y, Hashimoto T
  • 学会等名: Protist 2012
  • 発表場所: Oslo
  • 年月日: 2012-07-29