進化計算アプローチによる創薬標的ＧＰＣＲの立体構造予測法の開発

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23500376
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生体生命情報学
• 研究機関: 山口大学
• 研究代表者: 石野 洋子 山口大学, 大学院技術経営研究科, 准教授 (90373266)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• キーワード: 生命分子計算 / 進化計算 / バイオインフォマティクス

研究概要

本研究で対象とするGタンパク質共役型受容体（GPCR）は重要な創薬ターゲットであるにもかかわらず，これまで結晶構造解析で立体構造が解明されたものは数種類しかない．さらにGPCRは構造の揺らぎが大きいため、コンピュータによる構造予測の精度に限界がある．
そこで本研究では、GPCR特有の構造の揺らぎを考慮した新しい構造予測方法を開発した．具体的には、GPCRとその既知のリガンドとの結合シミュレーションをモジュール化して進化計算に組み入れることで，揺らぎによって起こる様々な構造のなかから最良構造を探索できる手法を提案した．ロイコトリエン受容体を例として，本手法の効果は実証された．

研究成果

• [雑誌論文] Research Trend of Technology Management (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoko Ishino
  • 雑誌名: Journal on Innovation and Sustainability 巻: Vol.5, No.2 ページ: 78-86
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel Computational Methodologies for Structural Modeling of Spacious Ligand Binding Sites of G-Protein-Coupled Receptors : Development and Application to Human Leukotriene B4 Receptor (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoko Ishino and Takanori Harada
  • 雑誌名: The Scientific World Journal 巻: Vol.2012 ページ: ID 691579(11)
  • DOI: 10.1100/2012/691579
  • 査読あり
• [学会発表] 消費者調査データに基づいたエージェントの内部モデルの検討 (2014)
  • 著者名/発表者名: 石野洋子
  • 学会等名: 計測自動制御学会(SICE)システム・情報部門・第5回社会システム部会研究会
  • 発表場所: 大濱信泉記念館(沖縄県石垣市)
  • 年月日: 20140305-07
• [学会発表] Research Trend of Technology Management (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoko Ishino
  • 学会等名: Proc. of the 10th International Conference on Innovation and Management (ICIM2013)
  • 発表場所: Sao Paulo, Brazil
  • 年月日: 20131202-04
• [学会発表] 医療保険における製品普及への口コミ効果 (2013)
  • 著者名/発表者名: 宮崎真志, 石野洋子, 高橋真吾
  • 学会等名: 計測自動制御学会(SICE)システム・情報部門学術講演会2013(SSI2013)
  • 発表場所: ピアザ淡海(滋賀県大津市)
  • 年月日: 20131118-20
• [学会発表] A Comprehensive Calibration Method for Improving Protein Identification Accuracy in Proteomics with ESI-TOF-MS (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoko Ishino
  • 学会等名: Proc. of the 2013 Annual Convention of Japanese Society for Bioinformatics (JSBi2013)
  • 発表場所: タワーホール船堀(東京都江戸川区), Japan
  • 年月日: 20131029-31
• [学会発表] Effects of Word-of-Mouth Communication on Product Diffusion : A Case of Medical Insurance Product (2013)
  • 著者名/発表者名: Masashi Miyazaki, Yoko Ishino and Shingo Takahashi
  • 学会等名: Proc. of the 8th International Workshop on Agent-Based Approach in Economic and Social Complex Systems (AESCS 2013)
  • 発表場所: 芝浦工業大学(東京都江東区), Japan
  • 年月日: 20130911-13
• [学会発表] Knowledge Extraction of Consumers' Attitude and Behavior : A Case Study of Private Medical Insurance Policy in Japan (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoko Ishino
  • 学会等名: Proc. of the 8th International Knowledge Management in Organizations Conference (KMO2013)
  • 発表場所: Kaohsiung, Taiwan
  • 年月日: 20130909-13
• [学会発表] テキストマイニングによる技術経営の潮流分析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 石野洋子
  • 学会等名: 第19回社会情報システム学シンポジウム
  • 発表場所: 電気通信大学(東京都調布市)
  • 年月日: 2013-01-23
• [学会発表] An Approach towards Medical Insurance Business Innovation Based on Japanese Customer Survey Data (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoko Ishino
  • 学会等名: Proc. of the 9th International Conference on Innovation and Management (ICIM 2012)
  • 発表場所: Eindhoven, Netherlands
  • 年月日: 20121114-16
• [学会発表] Analysis and Modeling of Customer-Perceived Value of Medical Insurance Products (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoko Ishino
  • 学会等名: Proc. of the 7th International Workshop on Agent-Based Approaches in Economic and Social Complex Systems (AESCS 2012)
  • 発表場所: 関西大学(大阪府吹田市), Japan
  • 年月日: 20120617-19
• [学会発表] Impact of the Novel Protein Structure Prediction on R&D Process in Drug Discovery and Development (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoko Ishino
  • 学会等名: Proc. of the 8th International Conference on Innovation and Management (ICIM 2011)
  • 発表場所: リーガロイヤルホテル小倉(福岡県北九州市), Japan
  • 年月日: 20111130-1202
• [図書] Analysis and Modeling of Customer-Perceived Value of Medical Insurance Products, in T. Murata, T. Terano, S. Takahashi (eds.) : Agent-Based Approaches in Economic and Social Complex Systems VII (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoko Ishino
  • 総ページ数: 262(115-127)
  • 出版者: Springer