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2013 年度 実施状況報告書

オキサゾロン連続クラスター損傷に関する突然変異および修復反応の解析

研究課題

研究課題/領域番号 23510069
研究機関徳島文理大学

研究代表者

喜納 克仁  徳島文理大学, 薬学部, 准教授 (70360534)

キーワード連続クラスター損傷 / グアニン酸化損傷
研究概要

本課題の研究目的は、「グアニン連続配列を酸化することで、オキサゾロン(Oz)連続クラスター損傷を作成する。このOz連続クラスター損傷を用いて、DNAポリメラーゼによる塩基取り込み解析と伸長効率の解析などを行う。」ことである。昨年度は、一昨年度で検討した方法を変更し、Oz連続配列を含む6merと13mer、11merと相補鎖30merを混合した状態でライゲーションを行い、目的の30merを合成することに成功した。本年は、目的の実験を行うため、量を増やすことを検討した。しかしながら不幸なことに、原料を合成するためのDNA合成機が故障し、研究を遂行することができなかった。3月末にようやく修理され、次年度に延長申請することで、引き続き研究を遂行する。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

4: 遅れている

理由

研究に必要なDNA合成機が8月に故障し、点検したが原因は判明せず、一旦研究室に機器を戻して合成を再開した。しかし、10月に再び故障した。研究遂行に必要な量に満たなかったので、受託合成の依頼を検討したが、他の必要経費が支出できなくなるほど非常に高額となった。そのため、修理を再度依頼した。ようやく故障原因が判明し、3月に納品された。原料を用いる実験の経費の支出があまりなかったので、未使用額が生じた。

今後の研究の推進方策

研究実績の概要でも述べたように、一昨年度にライゲーション法による30merオリゴマーの構築に成功した。DNA合成機の故障により、昨年度に行うことができなかったOzOz入りオリゴマーを次年度作成し、種々のDNAポリメラーゼ反応を行う予定である。

次年度の研究費の使用計画

本年度は不幸なことに、原料を合成するためのDNA合成機が故障し、研究を遂行することができなかった。3月末にようやく修理され、次年度に延長申請することで、引き続き研究を遂行することとなった。このような状況であるので、消耗品の支出がほとんど必要なかった。なお、DNA合成機の修理費用は科研費ではなく、大学から支給された研究費でまかなった。
HPLCに関わる溶媒とHPLCカラム、DNAポリメラーゼ作成のための試薬類、細胞培養試薬、放射性同位体元素の購入、論文出版のための費用や学会発表費用の支出計画を項目ごとに見直した上で、目的達成を加速するため、次年度前半で得られたデーターによっては新たな機器や分子設計用のソフトウェアの購入を検討する可能性も考える。

  • 研究成果

    (24件)

すべて 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (19件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Direct analysis of guanine oxidation products in double-stranded DNA and proposed guanine oxidation pathways in single-stranded, double-stranded or quadruplex DNA.2014

    • 著者名/発表者名
      Morikawa M., Kino K.*, Oyoshi T., Suzuki M., Kobayashi T., Miyazawa H.
    • 雑誌名

      Biomolecules

      巻: 4 ページ: 140-159

    • DOI

      10.3390/biom4010140

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Product analysis of photooxidation in isolated quadruplex DNA; 8-oxo-7,8-dihydroguanine and its oxidation product at 3′-G are formed instead of 2,5-diamino-4H-imidazol-4-one.2013

    • 著者名/発表者名
      Morikawa M., Kino K.*, Oyoshi T., Suzuki M., Kobayashi T., Miyazawa H.
    • 雑誌名

      RSC Adv,

      巻: 3 ページ: 25694-25697

    • DOI

      10.1039/C3RA44290J

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The stability of an oxidative guanine damages pairing with guanine in DNA polymerases.2013

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, M., Ohtsuki, K., Morikawa, M., Watanabe, T., Kobayashi, T., Miyazawa, H., Kino, K.*
    • 雑誌名

      Photomed. Photobiol.

      巻: 35 ページ: 17-18

  • [雑誌論文] The oxidation of single-strand, double-strand, or quadruplex DNA by UVA radiation with riboflavin.2013

    • 著者名/発表者名
      Morikawa, M., Oyoshi, T., Suzuki, M., Kobayashi, T., Miyazawa, H., Kino, K.*
    • 雑誌名

      Photomed. Photobiol.

      巻: 35 ページ: 19-20

  • [学会発表] 4本鎖DNAにおけるグアニン光酸化生成物の解析2014

    • 著者名/発表者名
      森川雅行、大吉崇文、鈴木雅代、小林隆信、小森理絵、宮澤宏、喜納克仁
    • 学会等名
      日本化学会 第94春季年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      20140327-20140330
  • [学会発表] P19細胞の神経分化過程におけるTal2遺伝子の発現調節2014

    • 著者名/発表者名
      小林隆信,中平佑甫,岡本奈々,森啓朗,喜納克仁,宮澤宏
    • 学会等名
      日本薬学会 第134年会
    • 発表場所
      熊本
    • 年月日
      20140327-20140330
  • [学会発表] グアニン酸化損傷とグアニンの塩基対を含む二本鎖DNAの安定性2014

    • 著者名/発表者名
      鈴木雅代,喜納克仁,森川雅行,渡邊泰平,浅田恵理子,小林隆信,宮澤宏
    • 学会等名
      日本薬学会 第134年会
    • 発表場所
      熊本
    • 年月日
      20140327-20140330
  • [学会発表] Analysis of guanine photooxidation in quadruplex DNA.2013

    • 著者名/発表者名
      森川雅行・喜納克仁、大吉崇文・鈴木雅代、小林隆信・宮澤宏
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      20131203-20131206
  • [学会発表] The calculated stability of DNA duplees containing oxazolone pairing with guanine.2013

    • 著者名/発表者名
      鈴木雅代・浅田恵理子、渡邊泰平・喜納克仁、森川雅行、小林隆信、宮澤宏
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      20131203-20131206
  • [学会発表] Analysis of nucleotide incorporations opposite an oxidative guanine damage by Y family DNA polymerases.2013

    • 著者名/発表者名
      鈴木雅代・浅田恵理子、渡邊泰平・喜納克仁、森川雅行、小林隆信、宮澤宏
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      20131203-20131206
  • [学会発表] The effects of base pairs containing an oxidative guanine damage on translesion synthesis2013

    • 著者名/発表者名
      渡邊泰平、鈴木雅代、喜納克仁・浅田恵理子、森川雅行、小林隆信、宮澤宏
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      20131203-20131206
  • [学会発表] The expression and regulation of TAL2 gene during neural differentiation of P19 cells.2013

    • 著者名/発表者名
      小林隆信、中平佑甫、岡本奈々、森啓朗、喜納克仁、宮澤宏
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      20131203-20131206
  • [学会発表] Analysis of the site reactivity and the kinds of guanine photooxidation products in quadruplex DNA.2013

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Morikawa, Takayuki Oyoshi, Masayo Suzuki, Takanobu Kobayashi, Hiroshi Miyazawa, Katsuhito Kino
    • 学会等名
      環境変異原学会24回大会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      20131129-20131130
  • [学会発表] Photooxidation of guanine in quadruplex DNA by UVA radiation with riboflavin.2013

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Morikawa, Takayuki Oyoshi, Masayo Suzuki, Takanobu Kobayashi, Hiroshi Miyazawa, Katsuhito Kino
    • 学会等名
      ISNAC 2013
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      20131113-20131115
  • [学会発表] The calculated stability of DNA duplexs containing DNA damages pairing with guanine.2013

    • 著者名/発表者名
      Masayo Suzuki, Eriko Asada, Katsuhito Kino, Taihei Watanabe, Masayuki Morikawa, Takanobu Kobayashi, Hiroshi Miyazawa
    • 学会等名
      ISNAC 2013
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      20131113-20131115
  • [学会発表] Formation of a flavin-linked cysteine2013

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Morikawa, Takeshi Senda, Masayo Suzuki, Takanobu Kobayashi, Hiroshi Miyazawa, Katsuhito Kino
    • 学会等名
      2013ECSOC (17th)
    • 発表場所
      Electronic conferences
    • 年月日
      20131101-20131130
  • [学会発表] The calculated stability of DNA duplexes containing an oxidized guanine lesion pairing with guanine.2013

    • 著者名/発表者名
      Masayo Suzuki, Katsuhito Kino, Masayuki Morikawa, Taihei Watanabe, Eriko Asada, Takanobu Kobayashi, Hiroshi Miyazawa
    • 学会等名
      2013ECSOC (17th)
    • 発表場所
      Electronic conferences
    • 年月日
      20131101-20131130
  • [学会発表] グアニン酸化損傷を含む塩基対のDNA ポリメラーゼ中における安定性2013

    • 著者名/発表者名
      大槻和也、鈴木雅代、喜納克仁、渡邊泰平、小林隆信、宮澤宏
    • 学会等名
      第52回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
    • 発表場所
      松山
    • 年月日
      20131026-20131027
  • [学会発表] Y family polymerase のグアニン酸化損傷に対する乗り越え反応2013

    • 著者名/発表者名
      渡邊泰平、鈴木雅代、喜納克仁、小林隆信、宮澤宏
    • 学会等名
      第52回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
    • 発表場所
      松山
    • 年月日
      20131026-20131027
  • [学会発表] 4 本鎖DNAの形成により引き起こされるグアニン光酸化損傷の種類、および酸化位置の変化2013

    • 著者名/発表者名
      森川雅行・大吉崇文・鈴木雅代・小林隆信・宮澤宏・喜納克仁
    • 学会等名
      日本化学会秋期事業 第3回 CSJ化学フェスタ2013
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      20131021-20131023
  • [学会発表] DNAポリメラーゼ中におけるグアニン酸化損傷とグアニンの塩基対安定性2013

    • 著者名/発表者名
      鈴木雅代・大槻和也、渡邊泰平・小林隆信・小森理絵・宮澤宏・喜納克仁
    • 学会等名
      第35回日本光医学・光生物学会
    • 発表場所
      浜松
    • 年月日
      20130712-20130713
  • [学会発表] リボフラビンを用いたグアニン光酸化損傷の解析2013

    • 著者名/発表者名
      森川雅行・大吉崇文・小林隆信・小森理絵・宮澤宏・喜納克仁
    • 学会等名
      第35回日本光医学・光生物学会
    • 発表場所
      浜松
    • 年月日
      20130712-20130713
  • [学会発表] ビタミンとDNA損傷42013

    • 著者名/発表者名
      喜納克仁
    • 学会等名
      新世代の生物有機化学研究会2013(第9回)
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      20130622-20130622
  • [備考] 徳島文理大学 香川薬学部 分子生物学講座

    • URL

      http://kp.bunri-u.ac.jp/kph04/index.html

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公開日: 2015-05-28  

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