河川流域におけるアクチノバクテリアの多様性解析と遺伝子資源としての保全

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23510291
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 資源保全学
• 研究機関: 山梨大学
• 研究代表者: 早川 正幸 山梨大学, 医学工学総合研究部, 教授 (30126651)
• 研究分担者: 山村 英樹 山梨大学, 医学工学総合研究部, 助教 (70516939)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• キーワード: 遺伝資源 / アクチノバクテリア / 生態学 / 分類学 / 微生物

研究概要

アクチノバクテリアはグラム陽性・高GC細菌の一群である。本研究では河川流域におけるこの菌群の分離法を確立し、その多様性を調査することを目的とした。選択分離培地としては5%NaCl含有1/5 NBRC 802培地を用いて、沖縄県西表島の河川と海岸から底泥を採取し、希釈平板法にて分離を試みた。総計194株を分離し16S rDNA相同性検索をすると、Microbacterium thalassiumを優占種として含む6科10属23種に分群された。また、分離株の内48株は新種と推定された。以上の結果から、河川流域は多様かつ新規なアクチノバクテリアの遺伝資源として重要な存在意義があることが示された。

研究成果

• [雑誌論文] Agromyces iriomotensis sp. nov. and Agromyces subtropicus sp. nov., isolated from soil (2014)
  • 著者名/発表者名: Hamada, M., Shibata, C., Ishida, Y., Tamura, T., Yamamura, H., Hayakawa, M. & Suzuki, K.
  • 雑誌名: Int J Syst Evol Microbioll. 巻: 64 ページ: 833-838
  • 査読あり
• [雑誌論文] Janibacter cremeus sp. nov., an actinobacterium isolated from sea sediment (2013)
  • 著者名/発表者名: Hamada, M., Shibata, C., Tamura, T., Yamamura, H., Hayakawa, M. & Suzuki, K.
  • 雑誌名: Int J Syst Evol Microbiol. 巻: 63 ページ: 3687-3690
  • 査読あり
• [雑誌論文] Paraoerskovia sediminicola sp. nov., an actinobacterium isolated from sea sediment, and emended description of the genus Paraoerskovia (2013)
  • 著者名/発表者名: Hamada, M., Tamura, T., Shibata, C., Yamamura, H., Hayakawa, M., Schumann, P. & Suzuki, K.
  • 雑誌名: Int J Syst Evol Microbiol. 巻: 63 ページ: 2637-2641
  • 査読あり
• [雑誌論文] Lysinimicrobium mangrovi gen. nov., sp. nov., an actinobacterium isolated from the rhizosphere of a mangrove (2012)
  • 著者名/発表者名: Hamada, M., Tamura, T., Yamamura, H., Suzuki, K. & Hayakawa, M.
  • 雑誌名: Int J Syst Evol Microbiol. 巻: 62 ページ: 1731-1735
  • 査読あり
• [学会発表] マングローブ域土壌からのLysinimicrobium属放線菌の分離と分類学的研究 (2013)
  • 著者名/発表者名: 浜田盛之、柴田千代、田村朋彦、小牧久幸、市川夏子、小口晃央、山村英樹、早川正幸、藤田信之、鈴木健一朗
  • 発表場所: メルパルク広島
  • 年月日: 20130905-06
• [学会発表] 河川流域及び海洋環境からのアクチノバクテリアの分離 (2013)
  • 著者名/発表者名: 石黒圭、山村英樹、中川洋史、浜田盛之、乙黒美彩、田村朋彦、早川正幸
  • 学会等名: 日本農芸化学会関東支部2013年度支部大会
  • 発表場所: 慶応義塾大学日吉キャンパス
  • 年月日: 2013-11-22
• [学会発表] 海洋堆積物からのDemequinaceae科放線菌の分離と分類学的研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 浜田盛之、田村朋彦、山村英樹、早川正幸、鈴木健一朗
  • 学会等名: 日本放線菌学会大会
  • 発表場所: 府中の森芸術劇場
  • 年月日: 20120906-07
• [備考]
  • URL: http://www.ccn.yamanashi.ac.jp/~hyamamura/index.html