巨大古代湖は最上川水系の魚類のレフュージアだったのか？

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23570105
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 山形大学
• 研究代表者: 半澤 直人 山形大学, 理学部, 教授 (40292411)
• 研究分担者: 佐々木 剛 東京農業大学, 農学部, 准教授 (00581844) ; 千葉 悟 独立行政法人国立科学博物館, 分子生物多様性研究センター, 特定非常勤研究員 (80599431)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• キーワード: 遺伝的集団構造 / 最上川水系 / 淡水魚類 / 古代湖 / 氷河期 / レフュージア / 人為的撹乱

研究概要

約600万年前から400万年前にかけて上・下流側に２つの巨大淡水湖があったとされる最上川水系周辺で、独自の進化を遂げた可能性のある魚類の集団解析を行い、古代湖が進化に及ぼした影響について考察した。調べた7種のうち、2種は固有の新規分類群と見られ、古代湖周辺で分化が進んだことが示唆された。別の3種では、最上川と近隣水系間、最上川の上・下流の集団間で異なる遺伝的構造が認められ、古代湖に流入する異なる河川水系間での地理的隔離の影響が示唆された。他の2種では特徴的な集団構造は認められなかった。比較対象とした相模川水系では、他水系からの移入個体の影響が大き過ぎて、明確な集団解析はできなかった。

研究成果

• [雑誌論文] Phylogeny and biogeography of highly diverged freshwater fish species (Leuciscinae, Cyprinidae, Teleostei) inferred from mitochondrial genome analysis (2013)
  • 著者名/発表者名: Imoto, JM, Saitoh, K, Sasaki, T, Yonezawa, T, Adachi, J, Kartavtsev, YP, Miya, M, Nishida, M and Hanzawa N.
  • 雑誌名: Gene 巻: 514 ページ: 112-124
  • DOI: 10.1016/j.gene.2012.10.19
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of comparative genome-derived simple sequence repeats for acanthopterygian fishes (2013)
  • 著者名/発表者名: Gotoh, RO, Tamate, S, Yokoyama, J, Tamate, HB and Hanzawa, N.
  • 雑誌名: Molecular Ecology Resources 巻: 13 ページ: 461-472
  • DOI: 10.1111/1755-0998.12070
  • 査読あり
• [学会発表] ミトコンドリアおよびマイクロサテライトマーカーに基づくウケクチウグイTribolodonnakamurai とその近縁種の集団解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 井元順一, 伊藤-関本綾, 柴田清孝, 佐々木剛, 玉手英利, 半澤直人
  • 学会等名: 2013年度日本魚類学会年会
  • 発表場所: 宮崎
  • 年月日: 2013-10-04
• [学会発表] 相模川水系と金目川水系におけるアブラハヤの集団構造とその撹乱の可能性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 大井章豊, 住倉英孝, 勝呂尚之, 半澤直人, 安藤元一, 小川博, 佐々木剛
  • 学会等名: 2013年度日本魚類学会年会
  • 発表場所: 宮崎
  • 年月日: 2013-10-04
• [学会発表] 比較ゲノムによる汎用的マイクロサテライトマーカーの開発 (2013)
  • 著者名/発表者名: 後藤亮, 半澤直人
  • 学会等名: 日本動物学会第84回大会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 2013-09-26
• [学会発表] 比較ゲノムによる相同的マイクロサテライト座位の同定および進化的考察 (2013)
  • 著者名/発表者名: 後藤亮, 半澤直人
  • 学会等名: 第14回日本進化学会大会
  • 発表場所: つくば
  • 年月日: 2013-08-29
• [学会発表] Population structure of Tribolodon nakamurai inferred from mitochondrial and microsatellite DNA analysis (2013)
  • 著者名/発表者名: Imoto, J, Ito-Sekimoto,A, Sekimoto H, Shibata K, Takahama M, Sasaki T, Tamate HB and Hanzawa, N.
  • 学会等名: Symposium on Systematics and Diversity of Fishes
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2013-07-06
• [学会発表] ジュズカケハゼ種群の分布 (2012)
  • 著者名/発表者名: 千葉悟・渋川浩一・向井貴彦・半澤直人.
  • 学会等名: 2012 年度日本魚類学会年会
  • 発表場所: 下関
  • 年月日: 2012-09-22
• [学会発表] 遺伝的多様性を指標とした河川改修による魚類地域集団への影響の評価 (2012)
  • 著者名/発表者名: 大井章豊・安藤元一・小川 博・佐々木剛.
  • 学会等名: 2012年度日本魚類学会年会
  • 発表場所: 下関
  • 年月日: 2012-09-22
• [学会発表] ミトコンドリア遺伝子に基づく山形県産イワナSalvelinus leucomaenis の遺伝的集団構造 (2012)
  • 著者名/発表者名: 後藤亮太・河内正行・荒木康男・後藤亮・白熊拓也・上遠野拓也・桂和彦・半澤直人.
  • 学会等名: 日本動物学会東北支部大会
  • 発表場所: 山形
  • 年月日: 2012-07-21
• [学会発表] ジュズカケハゼ種群の分布と遺伝的多様性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 千葉悟・渋川浩一・向井貴彦・半澤直人.
  • 学会等名: 2011年度日本魚類学会年会
  • 発表場所: 弘前
  • 年月日: 20110929-1002
• [学会発表] ミトゲノム解析に基づくコイ科ウグイ亜科魚類の系統地理 (2011)
  • 著者名/発表者名: 井元順一・斉藤憲治・佐々木剛・足立淳・Kartavtsev, Y. P.・宮正樹・西田睦・半澤直人
  • 学会等名: 日本魚類学会年会.2011 年度日本魚類学会年会
  • 発表場所: 弘前
  • 年月日: 20110929-1002
• [学会発表] ゲノム情報を用いた汎用的マイクロサテライトマーカーの開発とその利用 (2011)
  • 著者名/発表者名: 後藤亮・半澤直人.
  • 学会等名: 2011年度日本魚類学会年会
  • 発表場所: 弘前
  • 年月日: 20110929-1002
• [学会発表] 核遺伝子解析による極東産ウグイ亜科魚類の系統進化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 大井章豊・井元順一・Y.P. Kartavtsev・足立淳・半澤直人・佐々木剛.
  • 学会等名: 第13回日本進化学会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 20110730-31
• [備考]
  • URL: http://yudb.kj.yamagata-u.ac.jp/html/632_ja.html