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2013 年度 実績報告書

大腸菌複製再開始複合体におけるDnaBヘリケース導入の構造基盤

研究課題

研究課題/領域番号 23570140
研究機関九州大学

研究代表者

阿部 義人  九州大学, 薬学研究科(研究院), 准教授 (60315091)

研究分担者 片山 勉  九州大学, 薬学研究科(研究院), 教授 (70264059)
キーワード複製再開始 / タンパク質-DNA複合体 / タンパク質構造 / DnaT / PriC / PriB
研究概要

大腸菌においてはチミン飢餓状態や紫外線照射などで生じるDNA損傷が原因で一時的にDNA複製が停止することがある。その後DNA損傷の修復が起こり、複製再開始DNA-タンパク質複合体を起点にしてDnaBヘリカーゼの導入が起こることによって、DNA複製は再開始される。本研究ではDNA複製再開時に必要な再開始複合体構成因子の構造機能解析を中心に行った。特に我々はそれら因子の中で一本鎖DNAタンパク質であるPriB、DnaBヘリカーゼと直接相互作用すると考えられるDnaTおよびPriCに関して研究を行った。すなわちPriBと一本鎖DNAとの相互作用をNMRを用いて調べ、その相互作用が2段階に起こることを証明した(Fujiyama et al 2014, BBA)。また、PriCの一本鎖DNA結合、構造に関しての報告も行った(Aramaki et al 2013, Protein Science, Aramaki et al 2013, Genes to Cells)。さらにPriCと一本鎖DNAおよびSSBとの相互作用を23種類の変異体を作成することで解析し、その相互作用部位を調べた(論文投稿中、major revision)。またDnaTの構造と機能に関しても、NMRで解析した立体構造を元にした機能解析についてまとめ、現在論文投稿中である。また、DnaBヘリカーゼとの相互作用解析に関しては現在進行中であり、今後も複製再開始がどのように起こるのかを構造生物学的見地から解明して行く予定である。

  • 研究成果

    (9件)

すべて 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (4件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Involvement of histidine in complex formation of PriB and single-stranded DNA2014

    • 著者名/発表者名
      Fujiyama S, Abe Y, Takenawa T, Aramaki T, Shioi S, Katayama T, Ueda T
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta

      巻: 1844 ページ: 299-307

    • DOI

      10.1016/j.bbapap.2013.10.015

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Solution structure of the N-terminal domain of a replication restart primosome factor, PriC, in Escherichia coli.2013

    • 著者名/発表者名
      Aramaki T, Abe Y, Katayama T, Ueda T
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 22 ページ: 1279-1286

    • DOI

      10.1002/pro.2314

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Domain separation and characterization of PriC, a replication restart primosome factor in Escherichia coli2013

    • 著者名/発表者名
      Aramaki T, Abe Y, Ohkuri T, Mishima T, Yamashita S, Katayama T, Ueda T
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 18 ページ: 723-732

    • DOI

      10.1111/gtc.12069

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The DnaA N-terminal domain interacts with Hda to facilitate replicase clamp-mediated inactivation of DnaA2013

    • 著者名/発表者名
      Su'etsugu M, Harada Y, Keyamura K, Matsunaga C, Kasho K, Abe Y, Ueda T, Katayama T
    • 雑誌名

      Environmental Microbiology

      巻: 15 ページ: 3183-3195

    • DOI

      10.1111/1462-2920.12147

    • 査読あり
  • [学会発表] 大腸菌複製再開始因子PriCのSSB結合およびDNA結合に関する変異体解析

    • 著者名/発表者名
      荒牧峻彦, 阿部 義人, 古谷香織, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      日本生化学会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 大腸菌細胞分裂再活性化因子CedAの機能解析

    • 著者名/発表者名
      藤崎尚規, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      日本生化学会九州支部例会
    • 発表場所
      佐賀
  • [学会発表] DNA複製再開始に関わる大腸菌プライモソーム構成因子PriB・DnaTの相互作用解析

    • 著者名/発表者名
      藤山紗希, 阿部 義人, 谷純也, 浦辺大志, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      日本生化学会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] Domain separation and characterization of PriC, a replication restart primosome factor in Escherichia coli

    • 著者名/発表者名
      Takahiko Aramaki, Yoshito Abe, Takatoshi Ohkuri, Tomonori Mishima, Kaori Furutani, Shoji Yamashita, Tsutomu Katayama, Tadashi Ueda
    • 学会等名
      Protein Society 2013 symposium
    • 発表場所
      Boston, USA
  • [備考] 最近の研究室の論文

    • URL

      http://meneki.phar.kyushu-u.ac.jp/Protein/publications.html

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公開日: 2015-05-28  

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