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2011 年度 実施状況報告書

アンチセンスプローブを用いた生きた細胞のmRNAイメージング

研究課題

研究課題/領域番号 23570207
研究機関東京大学

研究代表者

岡部 弘基  東京大学, 薬学研究科(研究院), 助教 (20455398)

研究期間 (年度) 2011-04-28 – 2014-03-31
キーワードmRNA / 蛍光イメージング / アンチセンスプローブ
研究概要

本研究では、代表者がこれまでに開発したアンチセンスプローブを用いた生細胞内mRNAイメージング法を、細胞質におけるmRNAを介したダイナミックな翻訳活性調節機構の解析へと応用する。しかし、実際の生細胞内で種々の制御下にあるmRNAの振る舞いを記述するには、細胞内におけるプローブのキャラクタリゼーションや一般性の確立など実用性の課題がある。そこで、本年度は生細胞内におけるアンチセンスプローブの基礎特性を分析し、RNA研究の基盤技術としての確立に取り組んだ。 まず、アンチセンスプローブの細胞内における結合カイネティクスを検証した。プローブを生細胞内にマイクロインジェクション法により導入し、2種プローブのmRNAとの結合に伴うFRETを追跡することによりプローブとmRNAとの結合、解離の結合速度定数や解離定数を算出した。この結果、アンチセンスプローブは細胞内において、およそ1分という短時間で結合することが分かった。これはアンチセンスプローブを用いることにより、分オーダーで起こるmRNAの迅速な発現量、局在変化を追跡できる事を示している。 次に、検討したアンチセンスプローブの特性を活かし、迅速なmRNA局在変化のモニタリングへと応用した。ストレス環境にある細胞において、翻訳中のmRNAがストレス顆粒(SG)と呼ばれる細胞質の一時的な構造体に蓄積する現象を実時間でイメージング追跡した。また、SG形成と内における内在性mRNAの振る舞いを詳しく解析するために、アンチセンスプローブを用いて可視化された内在性mRNA(c-fos mRNA、poly(A)+ mRNA)の運動性を定量的イメージング解析により検討した。その結果、内在性mRNAはSG内において抑留されていることが分かった。本検討は、SGはmRNAの翻訳抑制としての機能を有することを示した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初、平成23年度はアンチセンスプローブの細胞内における結合カイネティクスの検証に加えて、任意のmRNAに対するアンチセンスプローブ設計のための標的配列の選択に関する検討を予定していた。しかしアンチセンスプローブが優れた結合カイネティクスを有していたため、迅速なmRNA局在変化のモニタリングの検討を優先した。

今後の研究の推進方策

任意のmRNAを標的としたプローブを開発するため、グリセルアルデヒド3-リン酸脱水素酵素(GAPDH)のmRNAを標的にしたアンチセンスプローブを開発する。プローブの標的配列を選択するため、GAPDH mRNAの翻訳配列のRNA二次構造を参考にしてアンチセンスプローブを設計する。標的と相補的な配列を持つ蛍光(Cy3)標識アンチセンスプローブを受託合成により調製し、生細胞内において内在性GAPDH mRNAとの結合能を蛍光相関分光法(FCS)や蛍光褪色後回復法(FRAP)により評価する。

次年度の研究費の使用計画

新規mRNAに対する有効なアンチセンスプローブの開発に必要な消耗品類の購入に充てる予定である。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (6件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Dynamic association-dissociation and harboring of endogenous mRNAs in stress granules2011

    • 著者名/発表者名
      J. Zhang, K. Okabe, T. Tani, T. Funatsu.
    • 雑誌名

      Journal of Cell Science

      巻: 124 ページ: 4087-4095

    • 査読あり
  • [学会発表] Temperature measurementin single living cells using a hydrophilic fluorescent nanogel thermometer2012

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      Biophysical Society 56th Annual Meeting
    • 発表場所
      サンディエゴ市(米国)
    • 年月日
      2012年2月27日
  • [学会発表] Real Time Imaging of Endogenous mRNA in Stress Granule Using Antisense Probe2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      日本バイオイメージング学会第20回学術集会
    • 発表場所
      千歳科学技術大学(千歳市)
    • 年月日
      2011年9月1日
  • [学会発表] Analysis on Dynamics of Endogenous mRNA in a Living Cells Using Linear Antisense Probe2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      6th Tokyo RNA Club(招待講演)
    • 発表場所
      東京大学(文京区)
    • 年月日
      2011年6月30日
  • [学会発表] Real Time Imaging of Endogenous mRNA in Stress Granule Using Antisense Probe2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第13回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      京都国際会館(京都市)
    • 年月日
      2011年6月17日
  • [学会発表] Dynamic association/dissociation and harboring of endogenous mRNAs in stress granules2011

    • 著者名/発表者名
      Junwei Zhang
    • 学会等名
      17th International Biophysics Congress
    • 発表場所
      北京(中国)
    • 年月日
      2011年11月3日
  • [学会発表] Real time imaging of endogenous mRNA using linear antisense probes in living cells2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      17th International Biophysics Congress
    • 発表場所
      北京(中国)
    • 年月日
      2011年11月2日
  • [図書] 実験医学2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      羊土社

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公開日: 2013-07-10  

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