大腸菌とＲＮＡファージＱβから成るモデル共進化系における宿主ゲノムの経時変化解析

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23570268
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 進化生物学
• 研究機関: 弘前大学
• 研究代表者: 柏木 明子 弘前大学, 農学生命科学部, 准教授 (40362652)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• キーワード: 実験進化学 / バクテリオファージ / 大腸菌 / 共進化

研究概要

寄生者であるウイルスと宿主は共進化の中で変化する。申請者は実験室内モデル共進化系を構築し、RNAウイルスと宿主がいかに共進化するのかを研究してきた。本研究では宿主大腸菌のゲノム変化に着目し、その経時変化を大規模シークエンス解析を用いて分析・評価する。それにより、宿主がどのようなゲノムの変化を伴って共進化したのかを明らかにした。さらに、得られたFプラスミド上のtraQ遺伝子上への1箇所の非同義変異が大腸菌の示すQβに対する部分抵抗性の責任遺伝子であることを強く示唆する結果を得た。

研究成果

• [雑誌論文] (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomonori Inomata, Hitomi Kimura, Haruki Hayasaka, Akinori Shiozaki, Yasuhiro Fujita, and Akiko Kashiwagi
  • 雑誌名: Archives of Virology 巻: Vol.157(11) ページ: 2163-2169
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2011)
  • 著者名/発表者名: Akiko Kashiwagi and Tetsuya Yomo
  • 雑誌名: PLoS Genetics 巻: Vol.7 (8) ページ: e1002188
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2011)
  • 著者名/発表者名: Saburo Tsuru, Nao Yasuda, Yoshie Murakami, Junya Ushioda, Kotaro Mori, Akiko Kashiwagi, Shingo Suzuki, Bei-Wen Ying, and Tetsuya Yomo
  • 雑誌名: Molecular Systems Biology 巻: Vol.7 ページ: 493
  • 査読あり
• [学会発表] (2013)
  • 著者名/発表者名: 柏木明子,菅原竜,熊谷知史,對馬(佐野)文恵,熊坂直也,四方哲也
  • 学会等名: 第65回日本生物工学会大会
  • 発表場所: 広島国際会議場(広島県)
  • 年月日: 20130918-20
• [学会発表] (2013)
  • 著者名/発表者名: 柏木明子,菅原竜,對馬(佐野)文恵,熊谷知史,四方哲也
  • 学会等名: 日本進化学会第15回筑波大会
  • 発表場所: 筑波大学(茨城県)
  • 年月日: 20130828-31
• [学会発表] (2012)
  • 著者名/発表者名: 菅原竜,對馬(佐野)文恵,熊谷知史,四方哲也,柏木明子
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡(福岡県)
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] (2012)
  • 著者名/発表者名: Akiko Kashiwagi and Tetsuya Yomo
  • 学会等名: 日本進化学会第14回東京大会
  • 発表場所: 首都大学東京(東京都)
  • 年月日: 20120821-24
• [学会発表] (2011)
  • 著者名/発表者名: 菅原竜,四方哲也,柏木明子
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • 年月日: 20111213-16
• [学会発表] (2011)
  • 著者名/発表者名: 柏木明子,四方哲也
  • 学会等名: 日本遺伝学会第83回大会
  • 発表場所: 京都大学(京都府)
  • 年月日: 20110920-23
• [学会発表] (2011)
  • 著者名/発表者名: Akiko Kashiwagi and Tetsuya Yomo
  • 学会等名: International Union of Microbiological Societies 2011 Congress (IUMS 2011)
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター(北海道)
  • 年月日: 20110906-10
• [学会発表] (2011)
  • 著者名/発表者名: 柏木明子,四方哲也
  • 学会等名: 日本進化学会第13回大会
  • 発表場所: 京都大学(京都府)
  • 年月日: 20110729-31
• [学会発表] (2011)
  • 著者名/発表者名: Akiko Kashiwagi and Tetsuya Yomo
  • 学会等名: SMBE (Annual congerence of society for molecular biology and evolution)
  • 発表場所: 京都大学(京都府)
  • 年月日: 20110726-30
• [備考]
  • URL: http://nature.cc.hirosaki-u.ac.jp/public/akiko-kashiwagi/