研究課題/領域番号 |
23580011
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研究機関 | 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構 |
研究代表者 |
秋山 征夫 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 東北農業研究センター畜産飼料作研究領域, 主任研究員 (70403160)
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研究期間 (年度) |
2011-04-28 – 2014-03-31
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キーワード | 国際情報交流 |
研究概要 |
1)Yamada-Akiyama, H. et al. (2009) によって得られた3つのアポスポリー特異的EST(P0165, P0195 または P2574)をプライマーに用いて、46,080個の平均サイズ120 kbpのギニアグラス・BACクローンライブラリーについてPCRスクリーニングを行った。その結果、アポスポリー特異的EST P0165を含むBACが4クローン、P195が2クローン、P2574が5クローン得られた。これらのBACクローンをFISHのプローブに利用することによって、ESTの物理的マッピングが可能となった。2)ギニアグラス・アポスポリー品種ナツカゼ、ナツユタカおよび有性生殖系統のGR297のゲノムDNAを抽出し、Pennisetum属アポミクシス植物のASGR-BBM を検出するプライマー(BBM-like p779:TATGTCACGACAAGAATATG、BBM-like p780:TGTAACCATAACTCTCAGCT)を用いてPCRを行った。得られたPCR産物のクローニング行った。その結果、Pennisetum属アポスポリー植物と同サイズのASGR-BBMのPCR産物が、ギニアグラス・アポスポリー品種ナツカゼ、ナツユタカで得られた。一方、有性生殖系統のGR297においてはPCR産物が得られなかった。これらの結果は、ギニアグラスとPennisetum属のASGRの相似性を示唆している。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
予定通り、ESTを含むBACのスクリーニングが完了した。ASGRの相似性については、ASGR-BBMによって明らかにすることが出来た。また、ギニアグラスBACクローンの物理的マッピングは現在進行中である。
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今後の研究の推進方策 |
1)得られたアポスポリー特異的EST を含むBACクローンをプローブに用いてFISH解析を行い、アポスポリー特異的ESTがギニアグラスのASGR染色体に座乗するかどうか明らかにする。2)ギニアグラスのASGR-BBMのシークエンスを行い、Pennisetum属のアポスポリー植物におけるASGR-BBMとの比較解析を行う。3)Ebina et al. (2005) によって得られた分子マーカーを含むギニアグラスのアポスポリー特異的BACクローンのうち、FISH解析によってギニアグラスのASGR染色体にマッピングされたASGR-BACクローンをプローブとして、Pennisetum属植物にFISHを行う。
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次年度の研究費の使用計画 |
本研究課題の推進のため、次年度の研究費は、交付申請時の計画どおり、物品費・旅費に使用する。なお、次年度使用額194,944円は、研究費を効率的に使用して発生した残額であり、次年度に請求する研究費と合わせて研究計画遂行のために使用する。
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