次世代シーケンサデータを活用した新規好塩性細菌利用基盤技術の開発

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23580117
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 応用微生物学
• 研究機関: 琉球大学
• 研究代表者: 松井 徹 琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 准教授 (90372812)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• キーワード: 好塩性細菌 / オキシゲナーゼ / シデロフォア

研究概要

チュニジア乾燥地、緑地帯より分離した中等度好塩性細菌を用いて環境浄化機能（特に石油系化合物分解）を発現させるために基盤技術について検討した。多様な好塩性細菌分離条件最適化、次世代シーケンサによるゲノム情報取得、ベクター構築、形質転換系確立、遺伝子破壊株ライブラリー構築、石油系化合物分解遺伝子の収集などを達成した。今後、好塩濃度条件下での石油分解菌構築・評価を進める予定である。

研究成果

• [雑誌論文] High cell density cultivation of Pseudomonas putida strain HKT554 and its application for optically active sulfoxide production (2013)
  • 著者名/発表者名: S. H. Ramadhan, T. Matsui, K. Nakano, H. Minami
  • 雑誌名: Appl. Microbiol. Biotechnol 巻: 97 ページ: 1903-1907
  • 査読あり
• [学会発表] Halophilic bacteria isolated from Tunisia and Okinawa.,Tunisia-Japan Symposium on Society (2013)
  • 著者名/発表者名: T.Matsui, T.Uezu, L. El Bassi, N. Nugara, H. Abdennaceur, H. Isoda
  • 学会等名: Science and Technology
  • 発表場所: Hammamet, Tunisia
  • 年月日: 20131100
• [学会発表] E.coli-Halomonas sp.シャトルベクターの構築とその性質 (2013)
  • 著者名/発表者名: 松井徹, Nilushi Nugara,東江菜都美,上江洲敏子,磯田博子
  • 学会等名: 生物工学会
  • 発表場所: 広島
  • 年月日: 20130900
• [学会発表] チュニジア環境試料からの好塩性細菌分離と454GSJrによるドラフトゲノム解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松井徹、青山洋昭、斎藤星耕、新里尚也、松崎吾朗、磯田博子、Hassen Abd-Ennasser、Nilushi Nugara
  • 学会等名: 農芸化学会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 20120300