法医ＤＮＡ多型検査における３対立遺伝子性ＳＮＰｓの有用性に関する検討

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23590846
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 法医学
• 研究機関: 信州大学
• 研究代表者: 太田 正穂 信州大学, 医学部, 准教授 (50115333)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• キーワード: Tri allelic SNP / Gene Frequency / Criminal Investigation / Identify Testing / Discrimination Power / DNA Mixtures

研究概要

一塩基多型（SNP）は法医DNA鑑定で利用価値が高い。本研究は識別能の高い3対立遺伝子性(Tri-allelic) SNPｓを25種類選出し、ダイレクトシーケンスにより各アリルの遺伝子頻度を求めた。多型情報はPDが0.99999999999997、PEは0.99885を示し、高度な鑑定能力を示した。SNaPShot法によるmultiplex を用いた検出では、判定の条件設定、エレクトロフェログラムの判読の煩雑さから、法医実務での実用性が得られなかった。また次世代シーケンサーを用いた混合試料のTri SNPs解析は、定性・定量性において精度の高い結果を示し、混合試料解析における有効性を示唆した。

研究成果

• [雑誌論文] Analysis of Y chromosome haplogroups in Japanese population using short amplicons and its application in forensic analysis (2014)
  • 著者名/発表者名: Harayama Y, Kamei S, Sato N, Hayashi T, Shiozaki T, Ota M, Asamura H
  • 雑誌名: Leg Med (Tokyo) 巻: 16 ページ: 20-25
• [雑誌論文] Development of multiplex assay with 16 SNPs on X chromosome for degraded samples (2012)
  • 著者名/発表者名: Oki T, Hayashi T, Ota M, Asamura H
  • 雑誌名: Leg Med 巻: 14 ページ: 11-16
• [学会発表] 日本人における3対立遺伝子性SNPs遺伝子頻度 (2013)
  • 著者名/発表者名: 太田正穂, 林徳多郎, 塩崎哲也, 佐藤紀子, 布谷美弥, 原山雄太, 浅村英樹
  • 学会等名: 第97次日本法医学会学術集会
  • 発表場所: roitロイトン札幌, 札幌
  • 年月日: 20130626-28
• [学会発表] KCNQ1 SNP may pose sudden death risk for patients administered psychoactive medication (2013)
  • 著者名/発表者名: 亀井佐矢子, 佐藤紀子, 原山雄太, 布谷美弥, 林徳多郎, 塩崎哲也, 太田正穂, 浅村英樹
  • 学会等名: 第97次日本法医学会学術集会
  • 発表場所: ロイトン札幌, 札幌
  • 年月日: 20130626-28
• [学会発表] 個人識別における3対立遺伝子性SNPs有用性の検討 (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田正穂, 沖貴仁, 林徳多郎, 浅村英樹
  • 学会等名: 第96次日本法医学会学術集会
  • 発表場所: アクトシティ浜松, 浜松
  • 年月日: 20120607-09
• [学会発表] Short ampliconに基づいたSNP解析法によるY染色体系統分類-Haplogroup D,Oの細分化- (2012)
  • 著者名/発表者名: 亀井佐矢子, 佐藤紀子, 原山雄太, 林徳多郎, 太田正穂, 浅村英樹
  • 学会等名: 第96次日本法医学会学術集会
  • 発表場所: アクトシティ浜松, 浜松
  • 年月日: 20120607-09
• [学会発表] 法医DNA検査における3対立遺伝子性SNPs解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田正穂, 沖貴仁, 林徳多郎, 浅村英樹
  • 学会等名: 第95次日本法医学会学術集会
  • 発表場所: コラッセ福島, 福島
  • 年月日: 20110615-17
• [学会発表] 性染色体上のSNPs解析法に関する比較検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 原山雄太, 塚田和彦, 沖貴仁, 林徳多郎, 太田正穂, 浅村英樹
  • 学会等名: 第95次日本法医学会学術集会
  • 発表場所: コラッセ福島, 福島
  • 年月日: 20110615-17
• [図書] Short ampliconに基づいたSNP解析によるY染色体系統分類法と法医実務試料への応用,DNA多型, 21 (2013)
  • 著者名/発表者名: 原山雄太, 亀井佐矢子, 佐藤紀子, 林徳多郎, 塩崎哲也, 太田正穂, 浅村英樹
  • 総ページ数: 193-196
• [図書] 性染色体上SNPs解析法に関する比較検討, DNA多型, 20 (2012)
  • 著者名/発表者名: 原山雄太, 沖貴仁, 塚田和彦, 林徳多郎, 太田正穂, 浅村英樹
  • 総ページ数: 187-189
• [図書] Y染色体系統分類へのMiniPCR-SNPs法の応用(第2法), DNA多型, 19 (2011)
  • 著者名/発表者名: 沖貴仁, 林徳多郎, 太田正穂, 浅村英樹
  • 総ページ数: 221-222