リシークエンシングによる自己免疫性肝疾患のＨＬＡゲノム多様性解析

2013 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 23590969
• 研究機関: 信州大学
• 研究代表者: 梅村 武司 信州大学, 医学部, 准教授 (30419345)
• キーワード: HLA / 自己免疫性肝炎 / 原発性胆汁性肝硬変 / 次世代シークエンサー / DNAタイピング

研究概要

本研究は次世代シークエンサーを用いて、HLA領域に遺伝要因が存在すると考えられている自己免疫性肝炎(AIH)、原発性胆汁性肝硬変(PBC)患者のHLA領域のリシークエンシングを行い、真の疾患感受性遺伝子とその部位、変異を特定し、臨床応用へと展開することが目的である。
日本人PBC患者における疾患感受性・抵抗性、さらには疾患進行と関連のあるHLAハプロタイプを同定しHepatologyに報告した。
さらに、日本人AIH患者ではHLA-DRB1*04:05-DQB1*04:01ハプロタイプが疾患感受性とDRB1*15:01-DQB1*06:02ハプロタイプは疾患抵抗性と関連がある事を同定した。肝癌発生、肝不全進行例においてそれぞれDRB1*15:01-DQB1*06:02、DRB1*08:03-DQB1*06:01ハプロタイプが関連する事を明らかとした。
次世代シークエンサーを用いてHLAクラスIとクラスII遺伝子全領域を増幅して解析する事により8桁レベルの超高解像度DNAタイピング法を開発した。この方法を用いて本研究で同定した疾患、病態に関連したHLAについて解析中である。この結果については解析でき次第報告する予定である。

研究成果

• [雑誌論文] STAT4 gene polymorphisms are associated with susceptibility and ANA status in primary biliary cirrhosis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Joshita S, Umemura T, Nakamura M, Katsuyama Y, Shibata S, Kimura T, Morita S, Komatsu M, Matsumoto A, Yoshizawa K, Ishibashi H, Tanaka E, Ota M.
  • 雑誌名: Disease Markers 巻: Epub ページ: 727393
  • DOI: doi: 10.1155/2014/727393
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association analysis of Toll-like receptor 4 polymorphisms in Japanese primary biliary cirrhosis. (2013)
  • 著者名/発表者名: Morita S, Joshita S, Umemura T, Katsuyama Y, Kimura T, Komatsu M, Matsumoto A, Yoshizawa K, Kamijo A, Yamamura N, Tanaka E, Ota M.
  • 雑誌名: Human Immunology 巻: 74 ページ: 219-222
  • DOI: 10.1016/j.humimm.2012.10.022
  • 査読あり
• [学会発表] SS-SBT法によるAIHおよびPBC疾患感受性遺伝子HLA-DRB1、-DQB1の遺伝子タイピング (2013)
  • 著者名/発表者名: 梅村武司、勝山善彦、山崎麻美、赤羽由紀、田中榮司、鈴木進悟、尾崎有紀、椎名隆、猪子英俊、太田正穂
  • 学会等名: 第22回 日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: コラッセふくしま（福島県福島市）
  • 年月日: 20130914-20130916
• [学会発表] SS-SBT法によるAIHおよびPBC疾患感受性遺伝子HLA-DRB1の遺伝子タイピングの検討 (2013)
  • 著者名/発表者名: 梅村武司、城下智、田中榮司
  • 学会等名: 第49回日本肝臓学会総会
  • 発表場所: 京王プラザホテル（東京都）
  • 年月日: 20130606-20130607