研究概要 |
本研究では、D-Threoninol に色素などの機能性分子を導入したヌクレオチド・アナログ=Threoninol-Nucleotide (TN)を導入した DNA(TN-DNA)と、通常の未修飾のPNA を組み合わせた新たなストランドインベーダーの開発を目指した。DNA 二重鎖へのインベージョン活性を示すためには、二重鎖の安定性の序列が DNA/PNA, TN-DNA/DNA > DNA/DNA > TN-DNA/PNA を満たす必要がある。そこでこのような安定性の序列を満たすための機能性分子と TN の導入方法を検討した。その結果、電子吸引性基を導入した平面構造のインターカレーターが DNA 二重鎖を大きく安定化することを見出した。また TN を天然のヌクレオチド 2 残基毎に導入すると、PNA の二重鎖を阻害しつつ DNA との二重鎖形成を促進することも明らかにした。これらの結果に基づき、PNA と機能性分子としてアントラキノンを導入した TN-DNA の組み合わせることで、実際に DNA 二重鎖にストランドインベージョンすることを明らかにした。
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