2011 年度研究成果報告書

新規ポリA鎖長決定法を用いた概日リズムが見られるmRNAのゲノムワイド検索

研究課題

研究課題/領域番号	23651184
研究種目	挑戦的萌芽研究
配分区分	基金
研究分野	ゲノム生物学
研究機関	金沢大学
研究代表者	程肇金沢大学, 自然システム学系, 教授 (00242115)
研究期間 (年度)	2011
キーワード	概日リズム / 時計遺伝子 / 視交叉上核 / Periodl / poly(A) / 翻訳制御
研究概要	mRNAのポリA鎖長を決定する、PACHINCO(Poly(A) Capture by Hairpin ChimericOligonucleotide)-RT-PCR法を構築した。本年度は本方法を全自動型DNA分析用マイクロチップ電気泳動装置(Shimadzu社)に適用するための条件の最適化を実施した。その結果、poly(A-T)鎖を効率的に検出する泳動条件を決定し、さらに、自動電気泳動装置からの出力データを用いたpoly(A)鎖長分布解析プログラムを開発した。

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