2012 年度研究成果報告書

塩基修飾と次世代シーケンサを用いたクロマチン構造のゲノムワイド単一分子解像度解析

研究課題

研究課題/領域番号	23651199
研究種目	挑戦的萌芽研究
配分区分	基金
研究分野	システムゲノム科学
研究機関	東京大学
研究代表者	伊藤隆司東京大学, 大学院・理学系研究科, 教授 (90201326)
研究期間 (年度)	2011 – 2012
キーワード	クロマチン構造 / 次世代シーケンサ
研究概要	クロマチン動態の理解を深めるには、ヌクレオソームや転写因子とDNAの相互作用イベント間の連鎖・相関を把握することが重要である。そのために、我々はDNA切断ではなくて塩基修飾の導入と次世代シーケンサによるその網羅的検出を基盤とするゲノムワイドクロマチン解析法の開発を試みた。同様の手法NOME-Seqが報告されたが、我々独自のバイサルファイトシーケンス技術PBATの併用によって、実用的で高感度な解析を実現できる目途が立った。