| 研究課題/領域番号 |
23654177
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
遠藤 一佳 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (80251411)
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| 研究分担者 |
高尾 敏文 大阪大学, たんぱく質研究所, 教授 (10197048) [辞退]
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| 研究期間 (年度) |
2011-04-28 – 2015-03-31
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| キーワード | バイオミネラリゼーション / 貝殻基質タンパク質 / 腕足動物 / 化石タンパク質 / 質量分析 / 外套膜 / 殻体プロテオーム |
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| 研究実績の概要 |
今年度は、現世腕足動物の殻体プロテオームのデータの確度を高めるため、Laqueus rubellusとCoptothyris grayiの2種について、Illumina HiSeq次世代シーケンサーを用いた外套膜トランスクリプトームの解析を行った。その結果、これまでにIon PGMにより得ていたトランスクリプトームデータよりも桁違いに深いデータを得ることに成功し、これらの新しいデータを用いてプロテオームデータを再解析することによって、より精度と確度の高いプロテオームデータを得ることができた。この新しいデータセットを用いて、既知のタンパク質やタンパク質ドメインとの類似性の検索を行い、これらの腕足動物が他の動物門とはタンパク質レベルではまったく異なる殻体タンパク質を持っていること、一方でドメインレベルでは、分解酵素ドメインや分解酵素阻害ドメインなど、いくつか他の動物門の殻体タンパク質とも共通するドメインが見られることも分かった。さらに、膜結合ドメイン、NAD(P)結合ドメイン、ABC型輸送体ドメイン、アスパラギン酸に富むドメインなどが一つのタンパク質配列の中に組み合わされた、これまでに知られていない全く新しいタイプの殻体タンパク質が発見された。このタンパク質はLaqueus rubellusとCoptothyris grayiの2種がいずれも持っていることから、少なくともテレブラチュラ目の中で保存されている重要なタンパク質であることも明らかとなった。
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