2012 年度研究成果報告書

バクテリオファージの宿主域は正しく評価できているのか?:新規宿主域評価法の開発

研究課題

研究課題/領域番号	23657025
研究種目	挑戦的萌芽研究
配分区分	基金
研究分野	生態・環境
研究機関	独立行政法人海洋研究開発機構
研究代表者	井町寛之独立行政法人海洋研究開発機構, 海洋・極限環境生物圏領域, 主任研究員 (20361933)
連携研究者	久保田健吾東北大学, 工学研究科, 助教 (80455807)
研究期間 (年度)	2011 – 2012
キーワード	ファージ / 宿主域 / 16S rRNA 遺伝子 / FISH 法
研究概要	本研究課題では、以下の4 つのステップから構成される新規なファージの宿主域同定技術を開発した。(i) EdU (5-ethynyl-2'-deoxyuridine) で標識したファージを微生物叢に感染させ、宿主微生物を光らせる。(ii) 宿主微生物細胞をFACS で回収する。(iii) 回収した微生物細胞の16S rRNA 遺伝子を決定し、宿主微生物の同定をおこなう。(iv) その確認として、宿主微生物の16S rRNA に特異的なDNA プローブを用いたFISH 法とEdU によるファージ標識による2 重染色を行う。