SRP経路を介した膜局在化による熱ショック転写因子シクマ32の分解機構

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23657128
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 細胞生物学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 森 博幸 京都大学, ウイルス研究所, 准教授 (10243271)
• 連携研究者: 秋山 芳展 京都大学, ウイルス研究所, 教授 (10192460) ; 伊藤 伊藤 京都産業大学, 総合生命科学部, 教授 (90027334)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• キーワード: 生体膜

研究概要

大腸菌の熱ショック応答転写因子シグマ32は、短寿命であり、膜結合型ATP依存性プロテアーゼFtsHによって主に分解を受けることが知られているが、そのメカニズムは不明な点が多い。最近、研究協力者の由良は、遺伝学的解析から、膜タンパク質の生合成に関わるSRP経路が、シグマ32の分解に関与するとの知見を得ていた。本研究では、シグマ32を対象として、部位特異的in vivo光架橋法を用い、シグマ32とSRPの構成因子Ffhが、生きた細胞内で直接近接していることを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] 細菌のタンパク質分泌を促進する膜タンパク質SecDF の構造と機能 (2013)
  • 著者名/発表者名: 森 博幸、塚崎智也
  • 雑誌名: 化学と生物 巻: 51巻 ページ: 28-35
  • 査読あり
• [雑誌論文] PDZ domains of RseP are not essential for sequential cleavage of RseA or stress-induced σ^E activation in vivo. (2012)
  • 著者名/発表者名: Hizukuri, Y. & Akiyama, Y.
  • 雑誌名: Mol. Microbiol. 巻: 86 ページ: 1232-1245
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure and functionof a membrane component SecDF that enhances protein export. (2011)
  • 著者名/発表者名: Tsukazaki, T.*, Mori, H.*, Echizen, Y., Ishitani, R., Fukai, S., Tanaka, T., Perederina, A., Vassylyev, D. G., Kohno, T.,Matsurana, A. D., Ito, K. &Nureki O.
  • 雑誌名: Nature 巻: 474 ページ: 235-238
  • DOI: doi:10.1038/nature09980.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Post liberation cleavage of signal peptides is catalyzed by the S2P protease in bacteria. (2011)
  • 著者名/発表者名: Saito, A., Hizukuri, Y., Matsuo, E.-i., Chiba, S., Mori, H., Nishimura, O.,Ito, K., & Akiyama, Y.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 108 ページ: 13740-13745
  • DOI: doi:10.1073/pnas.1108376108.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nascentome analysis uncovers futile protein synthesis in Escherichia coli. (2011)
  • 著者名/発表者名: Ito, K., Chadani, Y., Nakamori, K., Chiba, S., Akiyama, Y., &Abo, T.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 6 ページ: e28413
  • 査読あり
• [雑誌論文] Recruitment of a species-specific translational arrest module to monitor different cellular processes. (2011)
  • 著者名/発表者名: Chiba, S., Kanamori, T., Ueda, T., Akiyama, Y., Pogliano, K. & Ito, K.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 巻: 108 ページ: 6073-6078
  • 査読あり
• [学会発表] Structure and functionof SecDF, a membrane integrated protein translocation enhancing facor. (2013)
  • 著者名/発表者名: 森 博幸、塚崎智也、町田裕紀子、三登一八、濡木理、伊藤維昭、秋山芳展
  • 学会等名: 第86回日本細菌学会ワークショップ「細胞構造研究の新展開」
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 2013-03-19
• [学会発表] ビブリオ菌のタンパク質分泌マシナリー:SecDFパラログの発現制御機構 (2012)
  • 著者名/発表者名: 森 博幸、橋本成祐、小嶋誠司、本間道夫、秋山芳展
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会シンポジウム「運動超分子マシナリーの機能メカニズム」
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-15
• [学会発表] 細菌の蛋白質膜透過装置の構造・機能・病原性との関わり (2011)
  • 著者名/発表者名: 森 博幸
  • 学会等名: 第48回細菌学会中部支部会(特別講演)名古屋
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 20111021-22
• [学会発表] 蛋白質膜透過を促進する膜内在性因子SecDFの構造と機能 (2011)
  • 著者名/発表者名: 森 博幸、塚崎智也、越前友香、秋山芳展、濡木 理、伊藤維昭
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会シンポジウム「生体膜エネルギー変換装置の超分子科学」
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 20110921-24
• [学会発表] プロトン駆動力を用いたSecDF による蛋白質膜透過の昂進機構 (2011)
  • 著者名/発表者名: 森 博幸、塚崎智也、越前友香、濡木理、伊藤維昭
  • 学会等名: 第11回日本蛋白質科学会年会ワークショップ「細胞膜ダイナミクス:In vitro再構成系によるアプローチ」
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 20110607-09
• [備考]
  • URL: http://www.virus.kyoto-u.ac.jp/Lab/akiyama/index.html