ヒトでの構成的ヘテロクロマチンの消失:機構解明へ向けた痕跡部分の構造解析

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23657165
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 自然人類学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 古賀 章彦 京都大学, 霊長類研究所, 教授 (80192574)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• キーワード: 染色体 / 反復配列 / ヘテロクロマチン / セントロメア / テロメア

研究概要

大規模なヘテロクロマチンが短期間(種分化が起こる程度の時間)に増幅(生成を含む)あるいは縮小(消失を含む)する現象が、ヒト科やテナガザル科など、霊長類の多数のグループでみられる。その機構の解明につなげることを目指し、増幅や縮小を起こしたヘテロクロマチンの特性を調べた。反復配列が転移などでセントロメアやテロメアに入り込んだ際にこれが起こること、および増幅や縮小の効率は塩基配列に依存することが判明した。

研究成果

• [雑誌論文] Heterochromatin blocks constituting the entire short arms of acrocentric chromosomes of Azara's owl monkey: formation processes inferred from chromosomal locations(ヨザルのアクロセントリック染色体短腕を構成するヘテロクロマチン:染色体上の配置から推測される形成過程) (2013)
  • 著者名/発表者名: Prakhongcheep O, Chaiprasertsri N, Terada S, Hirai Y, Srikulnath K, Hirai H, *Koga A
  • 雑誌名: DNA Research
  • 査読あり
• [雑誌論文] In situ hybridization analysis of gibbon chromosomes suggests that amplification of alpha satellite DNA in the telomere region is confined to two of the four genera(テロメア領域でアルファサテライトDNAが増幅する現象はテナガザル科4属のうち2属のみで起こっていると推測される)
  • 著者名/発表者名: Baicharoen S, Arsaithamkul V, Hirai Y, Hara T, Koga A, *Hirai H
  • 雑誌名: Genome 巻: 55 (11) ページ: 809-812
  • DOI: DOI:10.1139/gen-2012-0123
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tandem repeat sequences evolutionarily related to SVA-type retrotransposons are expanded in the centromere region of the western hoolock gibbon, a small ape(類人猿のフーロックテナガサルのセントロメア近辺でSVAレトロトランスポゾンに関連した縦列反復配列が増幅している)
  • 著者名/発表者名: Hara T, Hirai Y, Jahan I, Hirai H, *Koga A
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 57 (12) ページ: 760-765
  • DOI: DOI:10.1038/jhg.2012.107
  • 査読あり
• [雑誌論文] Under-representation of repetitive sequences in whole-genome shotgun sequence databases: an illustration using a recently acquired transposable element(反復配列はホールゲノムショットガン塩基配列データベースには過小に反映されている:ゲノムに最近侵入したトランスポゾンを用いての例証)
  • 著者名/発表者名: *Koga A
  • 雑誌名: Genome 巻: 55 (2) ページ: 172-175
  • DOI: DOI:10.1139/G11-088
  • 査読あり
• [雑誌論文] Repetitive sequences originating from the centromere constitute large-scale heterochromatin in the telomere region in the siamang, a small ape(類人猿のフクロテナガザルで、セントロメア由来の反復配列がテロメア領域で大規模なヘテロクロマチンを形成している)
  • 著者名/発表者名: Koga A, Hirai Y, Hara T, *Hirai H
  • 雑誌名: Heredity 巻: 109 (3) ページ: 180-187
  • DOI: DOI:10.1038/hdy.2012.28
  • 査読あり
• [学会発表] テナガザルにみられるトランスポゾンのゲノムへの影響:セントロメアへのヘテロクロマチンの供給 (2012)
  • 著者名/発表者名: 古賀章彦・原暢・イスラト ジャハン・平井百合子・平井啓久
  • 学会等名: 第28回日本霊長類学会大会
  • 発表場所: 椙山女学園大学(名古屋市)
  • 年月日: 2012-07-06
• [学会発表] テナガザルの染色体端部にある大規模ヘテロクロマチンの主成分 (2012)
  • 著者名/発表者名: 平井啓久・原暢・平井百合子・古賀章彦
  • 学会等名: 第28回日本霊長類学会大会
  • 発表場所: 椙山女学園大学(名古屋市)
  • 年月日: 2012-07-06
• [学会発表] チンパンジーにあってヒトにない染色体端部ゲノム不毛地帯:(2) 培養細胞を用いた組換えの検出 (2011)
  • 著者名/発表者名: 古賀章彦・平井百合子・平井啓久
  • 学会等名: 第27回日本霊長類学会大会
  • 発表場所: 犬山国際観光センター(愛知県犬山市)
  • 年月日: 2011-07-18
• [学会発表] チンパンジーにあってヒトにない染色体端部ゲノム不毛地帯:(1) 存在様式変異から推測される非相同染色体間末端組換え (2011)
  • 著者名/発表者名: 平井啓久・平井百合子・古賀章彦・鵜殿俊史
  • 学会等名: 第27回日本霊長類学会大会
  • 発表場所: 犬山国際観光センター(愛知県犬山市)
  • 年月日: 2011-07-18
• [備考] 京都大学霊長類研究所
  • URL: http://www.pri.kyoto-u.ac.jp/index-j.html