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2012 年度 実施状況報告書

エタノール発酵責任遺伝子群の新規エピジェネティック制御機構の解明と応用展開

研究課題

研究課題/領域番号 23658281
研究機関東北大学

研究代表者

原田 昌彦  東北大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (70218642)

キーワード細胞核 / クロマチン / 遺伝子発現 / エピジェネティクス
研究概要

エピジェネティクスは、環境に適応した遺伝子発現において重要な役割を果たしている。出芽酵母のエタノール発酵能はグルコース濃度環境に応じて厳密に制御される。この現象に関連遺伝子群のエピジェネティクス制御が関与すると予想されているが、その詳細は不明であった。細胞核内の遺伝子空間配置がエピジェネティクス制御の分子基盤であることが明らかにされ、申請者はこの経路にArp6が必要であることを見出した。興味深いことに、出芽酵母のarp6変異株では、低グルコース環境下でもエタノール発酵能が抑制されないことが示された。Arp6による遺伝子の核内配置がエタノール発酵能に及ぼす影響を解析したところ、arp6変異株における遺伝子の空間配置の異常が観察された。またarp6変異株ではH2A.Zのクロマチンへの取り込みが低下し、この現象も当該遺伝子群の発現制御に関わることが示された。さらに、Arp6が核膜孔複合体と相互作用することを示し、Arp6による新規な遺伝子発現制御機構の存在が示唆された。本研究の遂行には、核内の遺伝子配置観察において先駆的な業績のあるProf. Susan Gasser(スイス)、および核内のアクチンファミリーの電子顕微鏡観察で実績のあるProf. Pavel Hozak(チェコ)を海外研究協力者とする研究体制をとった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

Arp6による遺伝子の核内配置がエタノール発酵能に及ぼす影響の解析が進み、その分子機構についての情報が得られた。例えば、arp6変異株ではH2A.Zのクロマチンへの取り込みが低下し、この現象も当該遺伝子群の発現制御に関わることが明らかにされた。さらに、Arp6が核膜孔複合体と相互作用することを示し、Arp6による新規な遺伝子発現制御機構の存在を示すことができた。

今後の研究の推進方策

これまでの解析から、Arp6が遺伝子の核膜近傍への空間配置に必要であることが明らかにされた。またArp6と核膜孔複合体との相互作用も示された。したがって、マイクロアレイで検出された発酵関連遺伝子の発現変化には、Arp6と核膜孔複合体との相互作用を基盤とした遺伝子の核内空間配置の変化が寄与している可能性がある。そこで、lacリプレッサー/オペレーターシステムを利用してこれらの遺伝子を可視化して観察することにより、グルコース濃度に依存したこれらの空間配置の変化や、arp6変異に伴う変化を解析する。

次年度の研究費の使用計画

Arp6と協調して機能するヒストンタンパク質解析を実施する過程で、Arp6がクロマチンに加えて核膜孔複合体と協調してアルコール発酵関連遺伝子の制御に関与するとの新規発見があった。これによって、出芽酵母変異株を作成・解析の追加実験を行う必要が生じた。次年度は、Arp6と核膜孔複合体との相互作用解析による遺伝子空間配置解析実験のための消耗品費(一般試薬類、講師試薬類、培養試薬類)として700,000円を、またこれに関連した研究成果報告のための国内旅費に100,000円を支出する。

  • 研究成果

    (25件)

すべて 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (20件) (うち招待講演 3件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Possible involvement of LKB1-AMPK signaling in non-homologous end joining2013

    • 著者名/発表者名
      Ui. A
    • 雑誌名

      oncogene

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 高次エピゲノムと核骨格2012

    • 著者名/発表者名
      北村大志, 原田昌彦
    • 雑誌名

      細胞工学

      巻: 31 ページ: 894-900

  • [雑誌論文] The actin family member Arp6 and the histone variant H2A.Z are required for spatial positioning of chromatin in chicken cell nuclei2012

    • 著者名/発表者名
      Ohfuchi-Maruyama, E.
    • 雑誌名

      Journal of Cell Science

      巻: 125 ページ: 3739-3743

    • DOI

      10.1242/jcs.103903.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 細胞核の構造とエピジェネティック制御2012

    • 著者名/発表者名
      尾間由佳子
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 50 ページ: 262-268

  • [学会発表] Roles of actin-related proteins in chromatin function and nuclear organization

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Harata
    • 学会等名
      The 64th Annual Meeting of the Japan Society for Cell Biology
    • 発表場所
      神戸
  • [学会発表] アクチンファミリーによって形成される核内構造とクロマチンのネットワーク

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      The 35th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
    • 発表場所
      福岡
    • 招待講演
  • [学会発表] Interaction Between the Actin-Related Protein Arp6 and Nuclear Myosin 1 and Their Contribution to the Nucleolus

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kitamura
    • 学会等名
      The 35th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] Functional Analyses of the Human INO80 Chromatin Remodeling Complex in Genome Integrity and Oxidative Stress Response Using Gene Knockout Cells for Human Actin Family Proteins

    • 著者名/発表者名
      Yuichiro Takahashi
    • 学会等名
      The 35th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] The Function of SWR1- and INO80 Chromatin Remodeling Complexes in the Spatial Positioning of DNA Double-strand Break

    • 著者名/発表者名
      Yukako Oma
    • 学会等名
      The 35th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] The Effect of Trichostatin A on the Dynamics of Histone H2A Variants in Mouse Somatic Cell Nuclear Transfer Embryos

    • 著者名/発表者名
      Masataka Nakaya
    • 学会等名
      The 35th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] Chromatin Remodeling That Take Advantage of Histone H2A.Z of Mouse Embryonic Stem Cells

    • 著者名/発表者名
      Tetsuya Emoto
    • 学会等名
      The 35th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] Cooperative functions of actin and myosin family members in nuclear organization

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kitamura
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Research Meeting “Dynamic organization of nuclear function”
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor、アメリカ
  • [学会発表] ヒストンファミリーとアクチンファミリー:クロマチン構造形成と核内空間配置におけるクロストーク

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      平成24年度遺伝研研究会「染色体ドメインの形成と機能発現機構」
    • 発表場所
      三島
    • 招待講演
  • [学会発表] DNA損傷部位の核内空間配置変化におけるクロマチンリモデリング複合体の寄与

    • 著者名/発表者名
      小西辰紀
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第45回研究報告会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] 遺伝子欠損細胞を用いたヒストンバリアントH2A.Z アイソフォームの解析

    • 著者名/発表者名
      日下部将之
    • 学会等名
      第30 回 染色体ワークショップ・第11 回 核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      淡路
  • [学会発表] ヒトH2A.Z を含むヌクレオソームの機能解析

    • 著者名/発表者名
      堀越直樹
    • 学会等名
      第30 回 染色体ワークショップ・第11 回 核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      淡路
  • [学会発表] ゲノム安定性維持における細胞核構造の寄与の解析

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      第30 回 染色体ワークショップ・第11 回 核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      淡路
  • [学会発表] エピジェネティック制御における核内アクチン骨格の関与の解析

    • 著者名/発表者名
      山崎 祥他
    • 学会等名
      第30 回 染色体ワークショップ・第11 回 核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      淡路
  • [学会発表] 細胞骨格および細胞核におけるアクチンファミリーの機能とがん細胞の特徴

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年度大会
    • 発表場所
      仙台
    • 招待講演
  • [学会発表] 遺伝子ノックアウト細胞を用いたヒトINO80複合体のゲノム安定性維持機構の解析

    • 著者名/発表者名
      高橋裕一朗
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年度大会
    • 発表場所
      仙台
  • [学会発表] アクチンのダイナミクスがエピジェネティック制御に及ぼす影響の解析

    • 著者名/発表者名
      山崎祥他
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年度大会
    • 発表場所
      仙台
  • [学会発表] DNA損傷部位の核内空間配置変化におけるクロマチンリモデリング複合体および核膜タンパク質の寄与

    • 著者名/発表者名
      小西辰紀
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年度大会
    • 発表場所
      仙台
  • [学会発表] Roles of actin-related proteins in chromatin function and nuclear organization

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Harata
    • 学会等名
      Gordon Research Conference “Chromatin Structure & Function”
    • 発表場所
      Lucca, Italy
  • [学会発表] Structural and Biochemical Analysis of Nucleosomes Containing H2A.Z

    • 著者名/発表者名
      Naoki Horikoshi
    • 学会等名
      The 35th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
    • 発表場所
      福岡
  • [図書] 染色体と細胞核のダイナミクス. (平岡泰、原口徳子編)2013

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 総ページ数
      印刷中
    • 出版者
      化学同人

URL: 

公開日: 2014-07-24  

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