エタノール発酵責任遺伝子群の新規エピジェネティック制御機構の解明と応用展開

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23658281
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 応用分子細胞生物学
• 研究機関: 東北大学
• 研究代表者: 原田 昌彦 東北大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (70218642)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• キーワード: エピジェネティック / クロマチン / 転写

研究概要

出芽酵母のアクチン関連タンパク質(Arp)であるARP6遺伝子を欠損させ、エタノール発酵関連遺伝子の遺伝子発現変化と、遺伝子の空間配置の変化を解析した。また、Arp6を人為的に結合したクロマチンが核膜孔複合体に結合すること、ヒストンバリアントH2A.Zを人為的に結合したクロマチンが核膜タンパク質Mps3に結合することを明らかにし、これらの核膜タンパク質が遺伝子の細胞核内の空間配置に関与することを示した。

研究成果

• [雑誌論文] Possible involvement of LKB1-AMPK signaling in non-homologous end joining (2014)
  • 著者名/発表者名: Ui A, Ogiwara H, Nakajima S, Kanno S, Watanabe R, Harata M, Okayama H, Harris CC, Yokota J, Yasui A, Kohno T
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 33 ページ: 1640-1648
  • DOI: 10.1038/onc.2013.125
  • 査読あり
• [雑誌論文] The actin family member Arp6 and the histone variant H2A.Z are required for spatial positioning of chromatin in chicken cell nuclei (2012)
  • 著者名/発表者名: Maruyama, E.O., Hori, T., Tanabe, H., Kitamura, H., Matsuda. R., Tone, S., Hozak, P., Habermann, F.A., von Hase, J., Cremer, C., Fukagawa, T., Harata, M
  • 雑誌名: J Cell Sci 巻: 125 ページ: 3739-3743
  • DOI: 10.1242/jcs.103903
  • 査読あり
• [雑誌論文] 高次エピゲノムと核骨格 (2012)
  • 著者名/発表者名: 北村大志, 原田昌彦
  • 雑誌名: 細胞工学 巻: 31 ページ: 894-900
• [雑誌論文] Actin-related proteins localized in the nucleus : from discovery to novel roles in nuclear organization (2011)
  • 著者名/発表者名: Oma, Y., Harata, M
  • 雑誌名: Nucleus 巻: 2 ページ: 38-46
  • DOI: 10.4161/nucl.2.1.14510
  • 査読あり
• [雑誌論文] Improvement of the transformation efficiency of Saccharomyces cerevisiae by altering carbon sources in pre-culture
  • 著者名/発表者名: Konishi, T. and Harata, M
  • 雑誌名: Bioscience, Biotechnology and Biochemistry 巻: (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] アクチン・ヒストン両ファミリーによる核・クロマチン機能制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 原田昌彦
  • 学会等名: 平成25年度遺伝研研究会「クロマチンによる遺伝情報のエピジェネティック制御機構」
  • 発表場所: 三島
  • 年月日: 20131017-18
  • 招待講演
• [学会発表] Actin family proteins involved in the functional organization of the nucleus (2013)
  • 著者名/発表者名: Masahiko Hatata
  • 学会等名: 23th Wilhelm Bernhard Workshop on the cell nucleus
  • 発表場所: Debrecen, Hungary
  • 年月日: 20130819-23
  • 招待講演
• [学会発表] ヒトINO80 クロマチンリモデリング複合体による遺伝子発現の酸化ストレス応答制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 原田昌彦
  • 学会等名: 第36回分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2013-12-03
• [学会発表] 「細胞核内構造体の構築原理と高次生命機能」アクチンファミリーによる細胞核・クロマチンの機能構造形成 (2013)
  • 著者名/発表者名: 原田昌彦
  • 学会等名: 第86回日本生化学会大会シンポジウム
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2013-09-11
  • 招待講演
• [学会発表] Interaction between the actin-related protein Arp6 and nuclearmyosin I and their contribution to the nuclear organization (2011)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Kitamura, Eri Ohfuchi, Chikashi Obuse, Hideyuki Tanabe, Tetsuya Hori, Tatsuo Fukagawa, Pavel Hozak, Masahiko Harata
  • 学会等名: Wenner-Gren Foundations International Symposium"Actin and actin-associated proteins from gene to polysomes"
  • 発表場所: Stockholm, Sweden
  • 年月日: 20111107-10
  • 招待講演
• [図書] 染色体と細胞核のダイナミクス. 第7 章「核タンパク質と核骨格」(平岡泰, 原口徳子編) (2013)
  • 著者名/発表者名: 原田昌彦
  • 総ページ数: 169-183
  • 出版者: 化学同人(印刷中)
• [図書] 農学生命科学を学ぶための入門生物学 (2011)
  • 著者名/発表者名: 豊水正昭, 牧野周, 原田昌彦, 金山喜則, 遠藤宣成, 中嶋正道
  • 総ページ数: 289-324
  • 出版者: 東北大学出版会
• [備考]
  • URL: http://www.harata-lab.org/