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2012 年度 実績報告書

タンパク質をコードしないRNAによる、精巣の幹細胞制御機構の解析

研究課題

研究課題/領域番号 23659099
研究機関横浜市立大学

研究代表者

大保 和之  横浜市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (70250751)

キーワード幹細胞 / 精巣 / Non-coding RNA / 細胞分化 / ゲノム修飾
研究概要

次世代シークエンサーの出現後、蛋白をコードしないNon-coding RNAが次々に明らかにされ、これらが遺伝子発現や蛋白質翻訳、DNAメチル化やヒストン修飾に密接に関与していることが明らかとなりつつある。しかし、精巣の幹細胞分化機構におけるNon-coding RNAの関与はほとんどその実体が明らかにされていなかった。そこで、精巣幹細胞、前駆細胞特異的に発現している遺伝子の遺伝子座にGFPをノックインしたマウスを用いて、精巣の幹細胞・前駆細胞を、蛍光細胞分取装置を用いて純化した。これを材料に精巣幹細胞、前駆細胞それぞれに発現しているNon-coding RNA、特に、既知のlong non-coding(lnc)RNAや、小分子RNAの中でも蛋白の翻訳に関与しているmiRNAに焦点を絞り探索した。
平成24年度は、昨年度まで回収細胞数が少なく達成できないでいた精巣幹細胞分画におけるlncRNA、miRNAの解析に成功し、その結果、既知のlncRNAは、幹細胞に比べ前駆細胞分画で多くの分子が発現していることが分った。一方、miRNAは、幹細胞、前駆細胞それぞれに高発現しているものをリストアップすることに成功した。精巣幹細胞に特異的に10倍以上高く発現してるmiRNAは25分子、逆に前駆細胞で10倍以上高く発現しているmiRNA分子は58個同定された。特に、前駆細胞において、幹細胞に比べ、100倍以上強く発現しているmiRNAが9分子同定された。
現在、これらlncRNAとmiRNAの候補分子のなかから、幹細胞で発現が高いもの、前駆細胞で高い発現を示すものをそれぞれ10分子選び、新たに調整したRNAを材料に定量的に正しいか否か確認を行っており、おおむね再現性が取れていることがわかった。現在、in silicoで標的となる下流遺伝子の同定などを順次行っているところである。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2012

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Splice variant HE4-V3 expression is associated with favorable prognosis in pulmonary adenocarcinoma2012

    • 著者名/発表者名
      K. Tokuishi, SI. Yamashita, K. Ohbo and K. Kawahara
    • 雑誌名

      Tumour Biol

      巻: 33 ページ: 103-109

    • DOI

      doi:10.1007/s13277-011-0252-8

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Serum level of HE4 is closely associated with pulmonary adenocarcinoma progression.2012

    • 著者名/発表者名
      Yamashita S, Tokuishi K, Moroga T, Yamamoto S, Ohbo K, Miyahara S, Yoshida Y, Yanagisawa J, Hamatake D, Hiratsuka M, Yoshinaga Y, Shiraishi T, Iwasaki A, Kawahara K.
    • 雑誌名

      Tumour Biol

      巻: 33 ページ: 2365-2370

    • 査読あり
  • [学会発表] Changing epigenetic modification and chromocenter formation associating with spermatogonia differentiation2012

    • 著者名/発表者名
      Ohbo K, Shirakawa T. Koseki H
    • 学会等名
      10th.EMBL Conference, Transcription and Chromatin
    • 発表場所
      ハイデルベルグ、ドイツ
    • 年月日
      20120825-20120828
  • [学会発表] Analysis of epigenetic changes associated with spermatogonia stem cell differentiation.2012

    • 著者名/発表者名
      Ohbo K.
    • 学会等名
      The 58th/60th NIBB Conference, Germline Specification, Sex, and Stem Cells.
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
    • 年月日
      20120717-20120721

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公開日: 2014-07-24  

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