ゲノム刷り込みに基づくｉＰＳ細胞分化能の指標作成

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23659181
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 人類遺伝学
• 研究機関: 佐賀大学
• 研究代表者: 副島 英伸 佐賀大学, 医学部, 教授 (30304885)
• 連携研究者: 小倉 淳郎 独立行政法人理化学研究所, 遺伝工学基盤技術室, 室長 (20194524)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• キーワード: エピジェネティクス / ゲノム刷り込み / iPS細胞 / 肝芽腫

研究概要

ゲノム刷り込みの観点からiPS細胞を評価するため、マウス・ヒトiPS細胞、刷り込み疾患Beckwith-Wiedemann症候群（BWS）患者由来iPS細胞、肝芽細胞を発生母地とする肝芽腫について、刷り込み関連メチル化可変領域（DMR）の網羅的DNAメチル化を解析した。マウスではiPS化すると大半のDMRが低メチル化すること、一部の刷り込みDMRは分化誘導により正常メチル化に回復することがわかった。ヒトiPS細胞では、特定のDMRで父性パターン（父性エピジェノタイプ）へのメチル化変化が生じることが示唆された。肝芽腫では、一部のDMRのメチル化は腫瘍化に先立って起こる可能性が示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Premature termination of reprogramming in vivo leads to cancer development through altered epigenetic regulation (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohnishi K, Semi K, Yamamoto T, Shimizu M, Tanaka A, Mitsunaga K, Okita K, Osafune K, Arioka Y, Maeda T, Soejima H, Moriwaki H, Yamanaka S, Woltjen K, Yamada Y
  • 雑誌名: Cell 巻: 156(4) ページ: 663-677
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel de novo point mutation of the OCT-binding site in the IGF2/H19-imprinting control region in a Beckwith-Wiedemann syndrome patient (2013)
  • 著者名/発表者名: Higashimoto K, Jozaki K, Kosho T, Matsubara K, Fuke T, Yamada D, Yatsuki H, Maeda T, Ohtsuka Y, Nishioka K, Joh K, Koseki H, Ogata T, Soejima H
  • 雑誌名: Clin Genet 巻: (published online)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comprehensive analyses of imprinted differentially methylated regions reveal epigenetic and genetic characteristics in hepatoblastoma (2013)
  • 著者名/発表者名: Rumbajan JM, Maeda T, Souzaki R, Mitsui K, Higashimoto K, Nakabayashi K, Yatsuki H, Nishioka K, Harada R, Aoki S, Kohashi K, Oda Y, Hata K, Saji T, Taguchi T, Tajiri T, Soejima H, Joh K
  • 雑誌名: BMC Cancer 巻: 13 ページ: 608
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ash1l methylates Lys36 of histone H3 independently of transcriptional elongation to counteract Polycomb silencing (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki H, Higashimoto K, Yada Y, A. Endo T¶, Sharif J¶, Komori T, Matsuda M, Koseki Y, Nakayama M, Soejima H, Handa H, Koseki H, Hirose S, Nishioka K
  • 雑誌名: PLoS Genet 巻: 9(11) ページ: e1003897
  • 査読あり
• [雑誌論文] Homozygous deletion of DIS3L2 exon 9 due to non-allelic homologous recombination between LINE-1s in a Japanese patient with Perlman syndrome (2013)
  • 著者名/発表者名: Higashimoto K, Maeda T, Okada J, Ohtsuka Y, Sasaki K, Hirose A, Nomiyama M, Takayanagi T, Fukuzawa R, Yatsuki H, Koide K, Nishioka K, Joh K, Watanabe Y, Yoshiura KI, Soejima H
  • 雑誌名: Eur J Hum Genet 巻: 21(11) ページ: 1316-1319
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epigenetic and genetic alterations of the imprinting disorder Beckwith-Wiedemann syndrome and related disorders (2013)
  • 著者名/発表者名: Soejima H, Higashimoto K
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 58(7) ページ: 402-409
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regional DNA methylation differences between humans and chimpanzees are associated with genetic changes, transcriptional divergence and disease genes (2013)
  • 著者名/発表者名: Fukuda K, Ichiyanagi K, Yamada Y, Go Y, Udono T, Wada S, Maeda T, Soejima H, Saitou N, Ito T, Sasaki H
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 58(7) ページ: 446-454
  • 査読あり
• [雑誌論文] Congenital hyperinsulinism in an infant with paternal uniparental disomy on chromosome 11p15 : Few clinical features suggestive of Beckwith-Wiedemann syndrome (2013)
  • 著者名/発表者名: Adachi H, Takahashi I, Higashimoto K, Tsuchida S, Noguchi A, Tamura H, Arai H, Ito T, Masue M, Nishibori H, Takahashi T, Soejima H
  • 雑誌名: Endocr J 巻: 60(4) ページ: 403-408
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel Mutations of CDKN1C in Japanese Patients with Beckwith-Wiedemann Syndrome (2013)
  • 著者名/発表者名: Yatsuki H, Higashimoto K, Jozaki K, Koide K, Okada J, Watanabe Y, Okamoto N, Tsuno Y, Yoshida Y, Ueda K, Shimizu K, Ohashi H, Mukai T, Soejima H
  • 雑誌名: Genes & Genomics 巻: 35(2) ページ: 141-147
  • 査読あり
• [雑誌論文] Beckwith-Wiedemann 症候群とSilver-Russell 症候群 (2013)
  • 著者名/発表者名: 前田寿幸, 東元健, 副島英伸
  • 雑誌名: 小児科臨床 巻: 66(増刊号) ページ: 1308-1314
• [雑誌論文] Beckwith-Wiedemann 症候群, Sotos 症候群 (2013)
  • 著者名/発表者名: 副島英伸
  • 雑誌名: 周産期医学 巻: 43(3) ページ: 377-382
• [雑誌論文] Characterization of DNA methylation errors in patients with imprinting disorders conceived by assisted reproduction technologies (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiura H, Okae H, Miyauchi N, Sato F, Sato A, Van De Pette M, John RM, Kagami M, Nakai K, Soejima H, Ogata T, Arima T
  • 雑誌名: Hum Reprod 巻: 27(8) ページ: 2541-2548
  • 査読あり
• [雑誌論文] Aberrant methylation of H19-DMR acquired after implantation was dissimilar in soma versus placenta of patients with Beckwith-Wiedemann syndrome (2012)
  • 著者名/発表者名: Higashimoto K, Nakabayashi K, Yatsuki H, Yoshinaga H, Jozaki K, Okada J, Watanabe Y, Aoki A, Shiozaki A, Saito S, Koide K, Mukai T, Hata K, Soejima H
  • 雑誌名: Am J Med Genet Part A 巻: 158A(7) ページ: 1670-1675
  • 査読あり
• [学会発表] Beckwith-Wiedemann 症候群と関連疾患におけるゲノム・エピゲノム異常 (2013)
  • 著者名/発表者名: 副島英伸
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第58回大会「シンポジウム8 先天異常とゲノム・エピゲノム」
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 20131120-23
• [学会発表] シスチン尿症を伴うゲノムワイド父性片親性ダイソミー症例の遺伝子解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 大塚泰史, 佐々木健作, 城崎幸介, 東元健, 岡本信彦, 高間勇一, 窪田昭男, 松本富美, 中山雅弘, 吉浦孝一郎, 副島英伸
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第58回大会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 20131120-23
• [学会発表] H19DMR メチル化異常で発症するインプリント疾患におけるH19DMR の変異解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 東元 健, 城崎幸介, 八木ひとみ, 古庄知己, 松原圭子, 山田大輔, 前田寿幸, 大塚泰史, 古関明彦, 緒方勤, 副島英伸
  • 学会等名: 第7回日本エピジェネティクス研究会年会
  • 発表場所: 奈良
  • 年月日: 20130530-31
• [学会発表] Beckwith-Wiedemann 症候群におけるインプリントDMR のマルチローカスメチル化解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 前田寿幸, 東元健, 中林一彦, 城崎幸介, 八木ひとみ, 緒方勤, 秦健一郎, 副島英伸
  • 学会等名: 第7回日本エピジェネティクス研究会年会
  • 発表場所: 奈良
  • 年月日: 20130530-31
• [学会発表] Ash1l methylates Lys36 of histone H3 independently of transcriptional elongation to counteract Polycomb silencing (2013)
  • 著者名/発表者名: 宮崎仁美, 東元 健, 矢田有加里, 遠藤高帆, Sharif Jafar, 小森敏治, , 松田正史, 古関庸子, 中山学, 副島英伸, 半田宏, 古関明彦, 広瀬進, 西岡憲一
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2013-03-06
• [学会発表] H19-DMR メチル化異常で発症するインプリント疾患におけるH19-DMR の変異解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 東元 健, 城崎幸介, 八木ひとみ, 古庄知己, 松原圭子, 山田大輔, 前田寿幸, 大塚泰史, 古関明彦, 緒方勤, 副島英伸
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] Genome-wide Screening of Aberrant Methylations of Imprinted DMRs in Hepatoblastomas (2012)
  • 著者名/発表者名: Rumbajan JM, Maeda T, Tajiri T, Higashimoto K, Souzaki R, Taguchi T, Soejima H, Joh K
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] Genome-wide quantitative DNA methylation analysis of imprinted DMRs in patients with Beckwith-Wiedemann Syndrome by MALDI-TOF MS technology (2012)
  • 著者名/発表者名: Maeda T, Jozaki K, Yatsuki H, Higashimoto K, Soejima H
  • 学会等名: The American Society of Human Genetics 62nd Annual Meeting (poster 3432T)
  • 発表場所: San Francisco, California, USA
  • 年月日: 20121106-10
• [学会発表] The relationship between paternal uniparental disomy and clinical features in patients with Beckwith-Wiedemann syndrome (2012)
  • 著者名/発表者名: Ohtsuka Y, Jozaki K, Maeda T, Yatsuki H, Higashimoto K, Soejima H
  • 学会等名: The American Society of Human Genetics 62nd Annual Meeting (poster 3519T)
  • 発表場所: San Francisco, California, USA
  • 年月日: 20121106-10
• [学会発表] Beckwith-Wiedemann 症候群における片親性父性ダイソミーの多様性と臨床症状との関連 (2012)
  • 著者名/発表者名: 大塚泰史, 城崎幸介, 前田寿幸, 八木ひとみ, 東元 健, 副島英伸
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第57回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20121024-27
• [学会発表] 肝芽腫におけるメチル化インプリントDMR のゲノムワイド検索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 副島英伸, 東元 健, 田尻達郎
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 札幌市
  • 年月日: 20120919-21
• [学会発表] 本邦Beckwith-Wiedemann 症候群の臨床像とゲノム・エピゲノム解析.180 超例の解析により明らかとなった本邦Beckwith-Wiedemann 症候群の臨床像とゲノム・エピゲノム変異 (2011)
  • 著者名/発表者名: 副島英伸, 城崎幸介, 八木ひとみ, 前田寿幸, 大塚泰史, 東元 健
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第56回大会 第11回東アジア人類遺伝学会
  • 発表場所: 幕張
  • 年月日: 20111109-12
• [学会発表] Acquisition of aberrant hypermethylation after implantation induces discordant hypermethylation at H19-DMR between bodies and placentas in Beckwith-Wiedemann syndrome patients (2011)
  • 著者名/発表者名: Soejima H, Nakabayashi K, Yatsuki H, Jozaki K, Hata K, Higashimoto K
  • 学会等名: Idibell Cancer Conferences on Imprinting and Beyond; "Mono-allelic expression in Health and Disease"
  • 発表場所: Barcelona, Spain
  • 年月日: 20110921-23
• [図書] Beckwith-Wiedemann症候群と小児腫瘍.遺伝子医学MOOK25エピジェネティクスと病気 第2 章エピジェネティクスと病気 4.不妊・先天異常(監修:佐々木裕之, 編集:中尾光善, 中島欽一) (2013)
  • 著者名/発表者名: 東元健, 副島英伸
  • 総ページ数: 195-201
  • 出版者: メディカルドゥ, 大阪
• [図書] ベックウィズ・ヴィーデマン症候群 第XIV 章 先天異常・奇形 症候群ハンドブック.(井村裕夫総編集, 福井次矢・辻省次編集.) (2011)
  • 著者名/発表者名: 副島英伸
  • 総ページ数: 679
  • 出版者: 中山書店
• [図書] シルバー・ラッセル症候群第XIV 章 先天異常・奇形 症候群ハンドブック.(井村裕夫総編集, 福井次矢・辻省次編集) (2011)
  • 著者名/発表者名: 副島英伸
  • 総ページ数: 685
  • 出版者: 中山書店
• [備考] ホームページ
  • URL: http://www.biomol.med.saga-u.ac.jp/mbg/index.htm