研究概要 |
本年度の研究計画に沿って、自殺予測のためのバイオマーカーの探索を目的とした、下記の研究を行った。 mRNA発現解析:末梢血由来のTotal RNAをもとに、本研究計画で自殺予測のためのバイオマーカーとなりうる可能性の高い5つの遺伝子{Brain-derived neurotrophic factor (BDNF), Receptor tyrosine kinase B (NTRK2), Glucocorticoid receptor (GR), Serotonin transporter (5-HTT), Trans-Golgi network protein 2 (TGOLN2)}のmRNA発現を、real-time PCR法を用いて計測する方法を開発した。 メチル化解析:末梢血由来のDNAを対象に、5-HTT遺伝子のエクソン1上流のプロモーター領域(799 bp)のメチル化解析をMassARRAYを用いて行う方法を開発した。5-HTT mRNA発現に重要な部位であるこの領域のメチル化解析を行う上で、最初に3つのプライマーセット(ゲノム上のprimer position; chr17:28562188-28562778, chr17:28562752-28563086, chr17:28563022-28563221)を用いて解析したが、本方法では第二増幅部分が逆鎖となり適した方法にならないため、新たに2つのプライマーセット(ゲノム上のprimer position; chr17:28562360-28562783, chr17:28562755-28563221)を用いて解析する方法を開発した。
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