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2011 年度 実績報告書

シンセティックバイオロジーを活用した細胞機能制御技術の開発

研究課題

研究課題/領域番号 23681042
研究機関京都大学

研究代表者

齊藤 博英  京都大学, 次世代研究者育成センター, 准教授 (20423014)

キーワードRNA / 合成生物学 / 翻訳 / RNP / バイオエンジニアリング / 遺伝子回路 / 細胞分化 / 遺伝子発現制御
研究概要

細胞機能を自在に制御する人工生体分子複合体や人工システムを創成することは、シンセティック・バイオロジー分野の研究目標の一つである。しかしながら、機能性分子のデザイン研究は端緒についたばかりであり、設計された分子やシステムが目的の挙動を示さない場合が多い。従って、機能性分子のデザインのための新しい戦略・技術の開発が期待されている。本研究では、生体内で多彩な機能を担うRNA-タンパク質複合体(RNP)をデザイン・創製する方法を活用し、細胞の機能や運命を自在に制御できる技術を開発する。具体的には、以下2つの課題の達成を目指す。
1、RNP相互作用に基づいた新しい遺伝子発現制御システム(RNPスイッチ)の確立。
2、RNPスイッチを活用した細胞運命制御システムの構築。
本年度は、siRNAやマイクロRNAの前駆体であるshRNAを人為的に改変し、哺乳類細胞内で特異的に発現するタンパク質に依存して、目的遺伝子の発現を活性化する、人工RNP-ONスイッチを作成することに成功した。shRNAのループ部分には、任意のタンパク質結合モチーフを導入することができる。このタンパク質結合モチーフに特定のタンパク質が結合することで、shRNAを切断するダイサー酵素のshRNAへの結合が阻害され、その機能を抑制できる。したがって、特定のタンパク質発現に応じて、目的遺伝子を活性化する「ONスイッチ」が構築できる。また標的タンパク質に結合するRNAアプタマーをmRNAに組み込み、哺乳類細胞内で発現する入力因子の発現に依存して、mRNAからの遺伝子発現を定量制御できる技術の開発に成功した。さらに、構築した人工RNPスイッチを活用して、フィードバック制御機構により、細胞内タンパク質の発現レベルを調節できるシステムの開発に成功した。これら技術から、目的タンパク質と自身のmRNAを相互作用させることで、細胞内環境に応じた、タンパク質発現量の精密な制御が期待できる。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本年度、研究目的に記載した、RNA-タンパク質相互作用に基づいた新しい遺伝子発現活性化システム(ONスイッチ)の確立に成功したため

今後の研究の推進方策

基盤技術としての開発に成功したRNAスイッチ技術を活用し、標的細胞の運命・分化制御システムへと展開する。

  • 研究成果

    (27件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (20件)

  • [雑誌論文] Feedback Control of Protein Expression in Mammalian Cells by Tunable Synthetic Translational Inhibition2012

    • 著者名/発表者名
      James A. Stapleton, Kei Endo, Yoshihiko Fujita, Karin Hayashi, Masahiro Takinoue, Hirohide Saito, and Tan Inoue
    • 雑誌名

      ACS Synth Biol

      巻: 1(3) ページ: 83-88

    • DOI

      10.1021/sb200005w

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 生物学史研究「生命システムの理解と制御を目指す合成生物学-その現状と課題-」2012

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 雑誌名

      生物学史研究2012年2月号

      巻: 86 ページ: 45-56

  • [雑誌論文] Synthetic RNA-protein complex shaped like an equilateral triangle2011

    • 著者名/発表者名
      Hirohisa Ohno, Tetsuhiro Kobayashi, Rinko Kabata, Kei Endo, Takuma Iwasa, Shige Yoshimura, Kunio , Tan Inoue, and Hirohide Saito
    • 雑誌名

      Nat Nanotechnol

      巻: 6(2) ページ: 116-120

    • DOI

      10.1038/nnano.2010.268

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthetic human cell fate regulation by protein-driven RNA swiches2011

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito, Yoshihiko Fujita, Shunnichi Kashida, Karin Hayashi, Tan Inoue
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 2 ページ: 160

    • DOI

      10.1038/ncomms1157

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Self-Eeplicalion Reactions Dependent on Tertiary Interaction Motifs in an RNA Ligase Ribozyme2011

    • 著者名/発表者名
      Rei Ohmori, Hirohide Saito, Yochiya Ikawa, Yoshihiko Fujita, Tan Inoue
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Evolution

      巻: 73 ページ: 221-229

    • DOI

      10.1007/s00239-011-9471-2

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Light-Regulated mRNA Condensation by a Photosensitive Surfactant Works as a Series Photoswitch of Translation Activity in the Presence of Small RNAs2011

    • 著者名/発表者名
      Sergii Rudiuk, Hirohide Saito, Tomoaki Hara, Tan Inoue Kenichi Yoshikawa, Damein Baigl
    • 雑誌名

      Biomacromolecules

      巻: 12 ページ: 3945-3951

    • DOI

      10.1021/bm200962s

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 翻訳をON/OFFする人工RNAスイッチ-シンセティック・バイオロジーの新技術2011

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英、井上丹
    • 雑誌名

      化学2011年5月号(Vo.66 No5)

      巻: 66 ページ: 46-50

  • [学会発表] 人工RNAを用いる新しい遺伝子操作技術2012

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 学会等名
      ヒト多機能性幹細胞の培養・解析の標準化レクチャーシリーズ第6回幹細胞の遺伝子操作の実践
    • 発表場所
      独立行政法人理化学研究所神戸研究所発生・再生科学総合研究センター(神戸市)(招待講演)
    • 年月日
      2012-02-02
  • [学会発表] 人工RNAスイッチ・ナノ構造体を活用した細胞運命制御システムの構築とイメージングへの可能性"Synthetic RNA switches and nanostructure for controlling sell function"2012

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 学会等名
      Center for Molecular Imaging Science Seminar
    • 発表場所
      独立行政法人理化学研究所神戸研究所分子イメージング科学研究センター(神戸市)(招待講演)
    • 年月日
      2012-02-01
  • [学会発表] iPSとYAC:両末端から生命-likeシステムの構築に迫る方法はあるか?2012

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 学会等名
      2011年度"Yet Another Artificial-Cells"研究会
    • 発表場所
      東京工業大学(横浜市)
    • 年月日
      2012-01-27
  • [学会発表] 人工RNA-タンパク質ナノ構造体を活用したバイオエンジニアリング2011

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 学会等名
      第8回分子複合医薬研究会
    • 発表場所
      産業技術総合研究所関西センター(大阪府池田市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-12-09
  • [学会発表] RNAシンセティックバイオロジーとアストロバイオロジーの接点2011

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 学会等名
      第4回アストロバイオロジーワークショップ
    • 発表場所
      神戸大学(神戸市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-27
  • [学会発表] 人工RNA-タンパク質複合型ナノシステムによる細胞機能制御2011

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 学会等名
      第17回創剤フォーラム若手研究会核酸工学・核酸医薬の新展開
    • 発表場所
      京都大学(京都市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-19
  • [学会発表] 人工RNAとiPS細胞を用いた精密な細胞運命制御にむけて2011

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 学会等名
      CiRA MINI-SYMPOSIUM 2011
    • 発表場所
      京都大学(京都市)
    • 年月日
      2011-11-17
  • [学会発表] Mammalian mRNA engineering for controlling transgene expression in response to an intracellular protein2011

    • 著者名/発表者名
      Kei Endo, Tan Inoue, Hirohide Saito
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会4.0
    • 発表場所
      千里ライフサイエンスセンター(大阪府豊中市)
    • 年月日
      2011-10-27
  • [学会発表] RNA/RNP molecular design and functional RNP nanostructure for controlling cell function2011

    • 著者名/発表者名
      Eriko Osada, Yoshihiko Fujita, Rie Furushima, Hirohisa Ohno, Tan Inoue, Hirohide Saito
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会4.0
    • 発表場所
      千里ライフサイエンスセンター(大阪府豊中市)
    • 年月日
      2011-10-27
  • [学会発表] Synthetic RNA/RNP biology-based approaches to regulate cellular functions2011

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito, Yoshihiko Fujita, Kei Endo, Hirohisa Ohno, Shunnichi Kashida, Eriko Osada, Tan Inoue
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会4.0
    • 発表場所
      千里ライフサイエンスセンター(大阪府豊中市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-10-27
  • [学会発表] Design and synthesis of RNA/RNP-based molecules and systems2011

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 学会等名
      ERATO International Symposium on Synthesizing life and biological systems
    • 発表場所
      千里ライフサイエンスセンター(大阪府豊中市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-10-24
  • [学会発表] 人工RNAスイッチ・ナノ構造体を基盤とする細胞操作・運命制御システムの開発2011

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 学会等名
      第5回物質科学フロンティアセミナー「新時代の物質創製を目指して-光、金属、生命を操る-」
    • 発表場所
      名古屋大学(名古屋市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-10-21
  • [学会発表] 生命の起源と宇宙の接点~生命は宇宙から降ってきた?2011

    • 著者名/発表者名
      大野博久、齊藤博英
    • 学会等名
      第7回お寺で宇宙学
    • 発表場所
      浄慶寺(京都市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-30
  • [学会発表] RNPシンセティック・バイオロジー2011

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英、藤田祥彦、樫田俊一、大野博久、遠藤慧、井上丹
    • 学会等名
      第63回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      東京農工大学(東京都小金井市)
    • 年月日
      2011-09-28
  • [学会発表] 分子デザイン型人工RNA-タンパク質複合体を活用した細胞機能制御技術の開発2011

    • 著者名/発表者名
      長田江里子、齊藤博英
    • 学会等名
      第10回産学官連携推進会議
    • 発表場所
      東京国際フォーラム(東京都)
    • 年月日
      2011-09-21
  • [学会発表] 分子ロボティクスにおけるRNA-タンパク質複合体の可能性2011

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英、大野博久、井上丹
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都国際会館(京都市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-21
  • [学会発表] 人工RNAスイッチを活用した細胞機能・運命制御2011

    • 著者名/発表者名
      斎藤博英
    • 学会等名
      遺伝子・デリバリー研究会第11回夏期セミナー
    • 発表場所
      三翠園ホテル(高知県高知市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-08-09
  • [学会発表] RNA-Protein複合体の分子デザインが拓く新世界2011

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 学会等名
      ERATO伊藤グライコトリロジープロジェクトシンポジウム
    • 発表場所
      独立行政法人理化学研究所和光研究所(埼玉県和光市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-07-27
  • [学会発表] 冷静と情熱のあいだ:RNAシンセティックバイオロジーの現状と未来2011

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 学会等名
      生化学若い研究者の会 初夏セミナー
    • 発表場所
      奈良女子大学(奈良県奈良市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-07-10
  • [学会発表] Synthetic approaches to construct RNA protein complexes-based nanostructures and translational regulatory system2011

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英、大野博久、樫田俊一、遠藤慧、James A Stapleton、藤田祥彦、井上丹
    • 学会等名
      第16回RNA Society Meeting
    • 発表場所
      京都国際会館(京都市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-06-17

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公開日: 2013-06-26  

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