次世代解析システムを駆使した疾患責任遺伝子の解明

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23689052
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 小児科学
• 研究機関: 横浜市立大学
• 研究代表者: 三宅 紀子 横浜市立大学, 医学部, 准教授 (40523494)
• 連携研究者: 加藤 光弘 山形大学, 医学部, 講師 (10292434) ; 岡本 信彦 大阪府立母子総合医療センター, 企画調査部, 参事 (30416242)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• キーワード: 遺伝 / 先天異常学

研究概要

本研究は、遺伝的要因が想定される希少な先天性疾患を対象に、次世代解析システムを駆使して疾患責任遺伝子を同定し、疾患発症メカニズムの解明と診断法・予防法・治療法を確立することを目的とする。従来の遺伝学的解析(連鎖解析およびコピー数異常解析等)とエクソーム解析を駆使し、Coffin-Siris 症候群、ミトコンドリア複合体 III欠損症、短体幹症における新規の責任遺伝子 8 個の同定に成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Mitochondrial complex III deficiency caused by a homozygous UQCRC2 mutation presenting with neonatal-onset recurrent metabolic decompensation (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyake N^<#>, Yano S^<#> (# denotes equal contribution), Sakai C, Hatakeyama H, Shiina M, Watanabe Y, Bartley J, Abdenur JE, Wang RY, Chang R, Tsurusaki Y, Doi H, Saitsu H, Ogata K, Goto Y, *Matsumoto N
  • 雑誌名: Hum Mut 巻: 34(3):446-452
  • DOI: doi: 10.1002/humu.22257
  • 査読あり
• [雑誌論文] The diagnostic utility of exome sequencing in Joubert syndrome related disorders (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsurusaki Y, Kobayashi Y, Hisano M, Ito S, Doi H, Nakashima M, Saitsu H, Matsumoto N, Miyake N
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 58(2):113-115
  • DOI: doi:10.1038/jhg.2012.117
  • 査読あり
• [雑誌論文] Exome sequencing identifies an OFD1 mutation in a family of X-linked lethal congenital malformation syndrome: delineation of male Oral-facial-digital syndrome type 1 (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsurusaki Y^<#>, *Kosho T^<#> (# denotes equal contribution), Hatasaki K, Narumi Y, Wakui K, Fukushima Y, Doi H, Saitsu H, Miyake N, *Matsumoto N (*: co-correspondence)
  • 雑誌名: Clin Genet 巻: 83(2):135-144
  • DOI: doi:10.1111/j.1399-0004.2012.01885.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phenotype spectrum of COL4A1 mutations : porencephaly to schizencephaly (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoneda Y, Haginoya K, Kato M, Osaka H, Yokochi K, Arai H, Kakita A, Yamamoto T, Otsuki Y, Shimizu S, Wada T, Koyama N, Mino Y, Kondo N, Takahashi S, Hirabayashi S, Takanashi J, Okumura A, Kumagai T, Hirai S, Nabetani M, Saitoh S, Hattori F, Yamazaki A, Su
  • 雑誌名: Ann Neurol 巻: 73(1):48-57
  • DOI: doi:10.1002/ana.23736
  • 査読あり
• [雑誌論文] Essential role of the IRF8-KLF4 transcription factor cascade in murine monocyte differentiation (2012)
  • 著者名/発表者名: Kurotaki D, Osato N, Nishiyama A, Yamamoto M, Ban T, Sato H, Nakabayashi J, Umehara M, Miyake N, Matsumoto N, Nakazawa M, Ozato K, Tamura T
  • 雑誌名: Blood 巻: 121(10):1839-1849
  • DOI: doi:10.1182/blood-2012-06-437863
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations affecting components of the SWI/SNF complex cause Coffin-Siris syndrome (2012)
  • 著者名/発表者名: Tsurusaki Y, Okamoto N, Ohashi H, Kosho T, Imai Y, Hibi-Ko Y, Kaname T, Naritomi K, Kawame H, Wakui K, Fukushima Y, Homma T, Kato M, Hiraki Y, Yamagata T, Yano S, Mizuno S, Sakazume S, Ishii T, Nagai T, Shiina M, Ogata K, Ohta T, Niikawa N, Miyatake S
  • 雑誌名: Nat Genet 巻: 44(4):376-378
  • DOI: doi:10.1038/ng.2219
  • 査読あり
• [雑誌論文] KDM6A point mutations cause Kabuki syndrome (2012)
  • 著者名/発表者名: Miyake N, Mizuno S, Okamoto N, Ohashi H, Shiina M, Ogata K, Tsurusaki Y, Nakashima M, Saitsu H, *Matsumoto N (*: co-corresponding)
  • 雑誌名: Hum Mut 巻: 34(1):108-110
  • DOI: doi:10.1002/humu.22229
  • 査読あり
• [雑誌論文] PAPSS2 mutations cause autosomal recessive brachyolmia (2012)
  • 著者名/発表者名: Miyake N^<#>, Elcioglu NH^<#> (# denotes equal contribution), Iida A, Isguven P, Dai J, Murakami N, Takamura K, Cho T-J, Kim O-H, Nagai T, Ohashi H, Nishimura G, Matsumoto N, Ikegawa S
  • 雑誌名: J Med Genet 巻: 49(8): 533-538
  • DOI: doi:10.1136/jmedgenet-2012-101039
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel SACS mutation in a Japanese family with atypical phenotype of autosomal recessive spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay (ARSACS) (2012)
  • 著者名/発表者名: Miyatake S, Miyake N, Doi H, Ogata K, Kawai M, Matsumoto N
  • 雑誌名: Intern Med 巻: 51: 2221-2226
  • URL: https://www.jstage.jst.go.jp/article/internalmedicine/51/16/51_51.7374/_article
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rapid detection of gene mutations responsible for non-syndromic aortic aneurysm and dissection using two different methods: resequencing microarray technology and next-generation sequencing (2012)
  • 著者名/発表者名: Sakai H, Suzuki S, Mizuguchi T, Imoto K, Doi H, Kikuchi M, Tsurusaki T, Saitsu H, Miyake N, Masuda M, Matsumoto N
  • 雑誌名: Hum Genet 巻: 131: 591-599
  • DOI: doi:10.1007/s00439-011-1105-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Homozygous c.14576G>A Variant of RNF213 Predicts Early-Onset and Severe Form of Moyamoya Disease (2012)
  • 著者名/発表者名: Miyatake S, Miyake N, Touho H, Nishimura-Tadaki A, Kondo Y, Okada I, Tsurusaki Y, Doi H, Sakai H, Saitsu H, Yamamoto T, Higurashi M, Kawahara N, Kawauchi H, Nagasaka K, Okamoto N, Mori T, Koyano S, Kuroiwa Y, Taguri M, Morita S, Matsubara Y, Kure S, Ma
  • 雑誌名: Neurology 巻: 78: 803-810
  • DOI: doi:10.1212/WNL.0b013e318249f71f
  • 査読あり
• [雑誌論文] De novo and inherited mutations in the gene encoding a type IV collagen α2 chain (COL4A2) cause porencephaly (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoneda Y, Haginoya K, Arai H, Tsurusaki Y, Doi H, Miyake N, Osaka H, Kato M, Matsumoto N, Saitsu H
  • 雑誌名: Am J Hum Genet 巻: 90 (1):86-90
  • DOI: doi:10.1016/j.ajhg.2011.11.016
  • 査読あり
• [雑誌論文] Whole exome sequenwcing identifies KCNQ2 mutations in Ohtahara syndrome. (2012)
  • 著者名/発表者名: Saitsu H, Kato M, Koide A, Goto T, Fujita T, Nishiyama K, Tsurusaki Y, Doi H, Miyake N, Hayasaka K, Matsumoto N
  • 雑誌名: Ann Neurol 巻: 72(2): 298-300
  • 査読あり
• [雑誌論文] CASK aberrations in males with Ohtahara syndrome and cerebellar hypoplasia (2012)
  • 著者名/発表者名: Saitsu H, Kato M, Osaka H, Moriyama N, Horita H, Nishiyama K, Yoneda Y, Kondo Y, Tsurusaki Y, Doi H, Miyake N, Hayasaka K, Matsumoto N
  • 雑誌名: Epilepsia 巻: 53(8): 1441-1449
  • DOI: doi:10.1111/j.1528-1167.2012.03548.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] CASK aberrations in male patients with Ohtahara syndrome and cerebellar hypoplasia (2012)
  • 著者名/発表者名: Saitsu H, Kato M, Osaka H, Moriyama N, Horita H, Nishiyama K, Yoneda Y, Kondo Y, Tsurusaki Y, Doi H, Miyake N, Hayasaka K, Matsumoto N
  • 雑誌名: Epilepsia 巻: 53(8):1441-1449
  • DOI: doi:10.1111/j.1528-1167.2012.03548.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel homozygous mutation of DARS2 may cause a severe LBSL variant (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyake N, Yamashita S, Kurosawa K, Miyatake S, Tsurusaki Y, Doi H, Saitsu H, Matsumoto N
  • 雑誌名: Clin Genet 巻: 80(3):293-296
  • DOI: doi:10.1111/j.1399-0004.2011.01644.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Expansion of the CHN1 strabismus phenotype (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyake N, Demer JL, Shaaban S, Andrews C, Chan WM, Christiansen SP, Hunter DG, Engle EC
  • 雑誌名: Invest Ophthalmol Vis Sci 巻: 52(9):6321-6328
  • DOI: doi:10.1167/iovs.11-7950
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rapid detection of a mutation causing X-linked leucoencephalopathy by exome sequencing (2011)
  • 著者名/発表者名: Tsurusaki Y, Osaka H, Hamanoue H, Shimbo H, Tsuji M, Doi H, Saitsu H, Matsumoto N, Miyake N*
  • 雑誌名: J Med Genet 巻: 48(9):606-9
  • DOI: doi:10.1136/jmg.2010.083535
  • 査読あり
• [雑誌論文] A response to: loss of dermatan-4-sulfotransferase 1 (D4ST1/CHST14) function represents the first dermatan sulfate biosynthesis defect, dermatan sulfate-deficient Adducted Thumb-Clubfoot Syndrome. Which name is appropriate, Adducted Thumb-Clubfoot Synd (2011)
  • 著者名/発表者名: Kosho T, Miyake N, Mizumoto S, Hatamochi A, Fukushima Y, Yamada S, Sugahara K, Matsumoto N
  • 雑誌名: Hum Mutat 巻: 32(12):1507-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] A homozygous mutation in RNU4ATAC as a cause of microcephalic osteodysplastic primordial dwarfism type I (MOPD I) with associated pigmentary disorder (2011)
  • 著者名/発表者名: Abdel-Salam GM, Miyake N, Eid MM, Abdel-Hamid MS, Hassan NA, Eid OM, Effat LK, El-Badry TH, El-Kamah GY, El-Darouti M, Matsumoto N
  • 雑誌名: Am J Med Genet A 巻: 155A(11):2885-2896
  • DOI: doi:10.1002/ajmg.a.34299
  • 査読あり
• [雑誌論文] Two novel CHN1 mutations in 2 families with Duane retraction syndrome (2011)
  • 著者名/発表者名: Chan WM^<#>, Miyake N^<#> (# denotes equal contribution), Zhu-Tam L, Andrews C, Engle EC
  • 雑誌名: Arch Ophthalmol 巻: 129(5):649-52
  • DOI: doi:10.1001/archophthalmol.2011.84
  • 査読あり
• [雑誌論文] A founder mutation of CANT1 common in Korean and Japanese Desbuquois dysplasia (2011)
  • 著者名/発表者名: Dai J, Kim OH, Cho TJ, Miyake N, Song HR, Karasugi T, Sakazume S, Ikema M, Matsui Y, Nagai T, Matsumoto N, Ohashi H, Kamatani N, Nishimura G, Furuichi T, Takahashi A, Ikegawa S
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 56(5):398-400
  • DOI: doi:10.1038/jhg.2011.28
  • 査読あり
• [雑誌論文] Delineation of dermatan 4-O-sulfotransferase 1 deficient Ehlers-Danlos syndrome: observation of two additional patients and comprehensive review of 20 reported patients (2011)
  • 著者名/発表者名: Shimizu K, Okamoto N, Miyake N, Taira K, Sato Y, Matsuda K, Akimaru N, Ohashi H, Wakui K, Fukushima Y, Matsumoto N, Kosho T
  • 雑誌名: Am J Med Genet A. 巻: 155A(8):1949-1958
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations in POLR3A and POLR3B encoding RNA Polymerase III subunits cause an autosomal-recessive hypomyelinating leukoencephalopathy (2011)
  • 著者名/発表者名: Saitsu H, Osaka H, Sasaki M, Takanashi J, Hamada K, Yamashita A, Shibayama H, Shiina M, Kondo Y, Nishiyama K, Tsurusaki Y, Miyake N, Doi H, Ogata K, Inoue K, Matsumoto N.
  • 雑誌名: Am J Hum Genet 巻: 89(5):644-651
  • DOI: doi: 10.1016/j.ajhg.2011.10.003
  • 査読あり
• [雑誌論文] Exome sequencing reveals a homozygous SYT14 mutation in adult-onset, autosomal-recessive spinocerebellar ataxia with psychomotor retardation (2011)
  • 著者名/発表者名: Doi H, Yoshida K, Yasuda T, Fukuda M, Fukuda Y, Morita H, Ikeda S, Kato R, Tsurusaki Y, Miyake N, Saitsu H, Sakai H, Miyatake S, Shiina M, Nukina N, Koyano S, Tsuji S, Kuroiwa Y, Matsumoto N
  • 雑誌名: Am J Hum Genet 巻: 89(2):320-327
  • DOI: doi: 10.1016/j.ajhg.2011.07.012
  • 査読あり
• [学会発表] X連鎖性を疑われたがミトコンドリア遺伝病であった一難聴家系の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 三宅紀子、鶴崎美徳、Desheng Liang、Lingqian Wu、松本直通
  • 学会等名: 人類遺伝学会第57回大会・一般口演・臨床遺伝学3
  • 発表場所: 日京王プラザホテル(東京)
  • 年月日: 2012-10-27
• [学会発表] CHST14 mutations in Ehlers-Danlos syndrome (2011)
  • 著者名/発表者名: Noriko Miyake, Tomoki Kosho, Shuji Mizumoto, Tatsuya Furuichi, Atsushi Hatamochi, Shiro Ikegawa, Shuhei Yamada, Kazuyuki Sugahara, Naomichi Matsumoto
  • 学会等名: The 11th East Asia Union of Human Genetics Annual meeting (oral oresentation)
  • 発表場所: 幕張メッセ (千葉県)
  • 年月日: 2011-11-10
• [学会発表] 新型 Ehlers-Danlos 症候群(D4ST1 欠損症)の遺伝学的検索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 三宅紀子、古庄知己、水本秀二、松本直通
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第56回大会(一般口演)
  • 発表場所: 幕張メッセ (千葉県)
  • 年月日: 2011-11-10
• [学会発表] Loss-of-function mutations of CHST14 cause a new type of autosomal recessive Ehlers-Danlos syndrome (2011)
  • 著者名/発表者名: Noriko Miyake, Tomoki Kosho, Shuji Mizumoto, Tatsuya Furuichi, Atsushi Hatamochi, Shiro Ikegawa, Shuhei Yamada, Kazuyuki Sugahara, Naomichi Matsumoto
  • 学会等名: Europian Human Genetics Conference 2011 (poster session)
  • 発表場所: Amsterdam, The Netherlands
  • 年月日: 2011-05-30
• [産業財産権] ミトコンドリア複合体 III 欠乏症の確定診断法 (2012)
  • 発明者名: 松本直通/三宅紀子
  • 権利者名: 横浜市立大学
  • 産業財産権番号: 2012-180356
  • 出願年月日: 2012-08-16
• [産業財産権] コフィン-シリス症候群の検出方法 (2012)
  • 発明者名: 松本直通/鶴崎美徳/三宅紀子
  • 権利者名: 横浜市立大学
  • 産業財産権番号: 2012-136
  • 出願年月日: 2012-01-04