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2013 年度 実施状況報告書

細胞密度に依存した細胞の集団的応答の分子ネットワーク設計

研究課題

研究課題/領域番号 23700350
研究機関大阪大学

研究代表者

藤本 仰一  大阪大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (60334306)

キーワード細胞間コミュニケーション / 数理モデル / 合成生物学 / 細胞集団
研究概要

本研究課題のタイトルとほぼ同等の「細胞集団レベルの意思欠点の設計原理」というタイトルの論文を出版した。出版した雑誌の当該号の注文論文として紹介され、大きな反響をよんだ。この論文は、細胞の集団的応答の基盤となる機構として、拡散性因子を介した細胞間相互作用に焦点をしぼった。
さらに、細胞接着などの物理的接触を介した細胞間相互作用による集団的応答を解析するために、あらたに数理モデルの構築を進めてきた。具体的には、組織中の上皮細胞の形態を多角形で近似し、細胞間の力学的な相互作用を通じた細胞変形を記述できるCell vertex modelを用いた。我々は、分裂速度が異なる2種類のクローン細胞集団をCell vertex modelに導入し、増殖させた。分裂速度の差異が与える影響を調べた。その結果、分裂速度の差異が増大するほど、クローンの境界がより丸くなることを見いだした。この形態は、ショウジョウバエの細胞競合の実験的知見と一致する。そこで、境界における細胞の形や細胞の接着面にかかる張力を調べたところ、分裂速度の差異に依存して異常が現れていた。分裂速度の差異は、細胞にかかる力、さらには、組織レベルの形態にまで波及することがわかった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究課題のタイトルとほぼ同等の「細胞集団レベルの意思決定の設計原理」というタイトルの論文を出版した。出版した雑誌の当該号の注文論文として紹介され、大きな反響をよんだ。この論文は、細胞の集団的応答の基盤となる機構として、拡散性因子を介した細胞間相互作用に焦点をしぼっている。
さらに、細胞接着などの物理的接触を介した細胞間相互作用による集団的応答を解析するために、新たに数理モデル構築を進めてきた。

今後の研究の推進方策

物理的接触を介した細胞間相互作用による集団的応答の研究で得られつつある理論的な予測の精度を高めるとともに、共同研究を通じて、実験的な検証を進める。

次年度の研究費の使用計画

当該年度後半において進行した研究成果を論文としてまとめる過程で、追加実験が新たに必要となった。
追加実験にはカスタマイズしたサーバーを用いた大規模な実験を行う必要があり、サーバーの納入には2ヶ月以上を要するために、次年度に購入することとなった。
サーバーの購入、論文の英文校閲料および投稿料

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (7件) (うち招待講演 4件)

  • [雑誌論文] A Design Principle of Group-level Decision Making in Cell Populations2013

    • 著者名/発表者名
      Koichi Fujimoto, Satoshi Sawai
    • 雑誌名

      PLoS Comp. Biol.

      巻: 9 (6) ページ: e1003110

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1003110

    • 査読あり
  • [学会発表] Mechanical properties that regulate differential cell division rate during cell competition2014

    • 著者名/発表者名
      Arisu Tsuboi, Shizue Ohsawa, Tatsushi Igaki and Koichi Fujimoto
    • 学会等名
      Workshop on Mechanics and Growth of Tissues: From Development to Cancer
    • 発表場所
      Paris, France
    • 年月日
      20140113-20140116
  • [学会発表] 細胞競合の数理モデル2013

    • 著者名/発表者名
      藤本仰一
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会 ワークショップ
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      20131203-20131206
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞の集団的な意思決定の設計原理2013

    • 著者名/発表者名
      藤本仰一
    • 学会等名
      定量生物学の会 第6回年会
    • 発表場所
      大阪大
    • 年月日
      20131123-20131124
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞の集団的な応答の設計原理 1-双安定系2013

    • 著者名/発表者名
      藤本仰一
    • 学会等名
      日本物理学会 秋季大会
    • 発表場所
      徳島大
    • 年月日
      20130925-20130928
  • [学会発表] 細胞の集団的な応答の設計原理 2 興奮振動系2013

    • 著者名/発表者名
      藤本仰一
    • 学会等名
      日本物理学会 秋季大会
    • 発表場所
      徳島大
    • 年月日
      20130925-20130928
  • [学会発表] A design principle of group-level decision making in cell populations.2013

    • 著者名/発表者名
      Koichi Fujimoto
    • 学会等名
      2013 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications (NOLTA2013)
    • 発表場所
      Santa Fe, USA
    • 年月日
      20130908-20130911
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞社会の集団的な意思決定のデザイン2013

    • 著者名/発表者名
      藤本仰一
    • 学会等名
      生物リズム若手研究者の集い2013
    • 発表場所
      山梨県河口湖
    • 年月日
      20130826-20130827
    • 招待講演

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公開日: 2015-05-28  

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