2012 年度研究成果報告書

マルチスケールシミュレーションによる核酸立体構造予測

研究課題

研究課題/領域番号	23700359
研究種目	若手研究(B)
配分区分	基金
研究分野	生体生命情報学
研究機関	独立行政法人産業技術総合研究所
研究代表者	亀田倫史独立行政法人産業技術総合研究所, 生命情報工学研究センター, 主任研究員 (40415774)
研究期間 (年度)	2011 – 2012
キーワード	蛋白質 / RNA / 立体構造予測 / 分子動力学(MD)
研究概要	RNA1 塩基を 3 つの球(P:リン、S:糖鎖、B:塩基)で表現する粗視化モデルを構築した。このモデルを用いて分子動力学シミュレーションを行ったところ、初期構造に依らず、天然状態における立体構造に正しく巻き戻った。