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2012 年度 実績報告書

大腸癌臨床検体を用いたリン酸化プロテオーム解析およびSRM/MRM法による検証

研究課題

研究課題/領域番号 23701093
研究機関独立行政法人医薬基盤研究所

研究代表者

白水 崇  独立行政法人医薬基盤研究所, 創薬基盤研究部, 研究員 (00582678)

キーワード大腸癌 / プロテオミクス / バイオマーカー
研究概要

【研究の目的】本研究では、大腸癌患者組織を用いた大規模リン酸化プロテオーム解析により、バイオマーカー候補の探索を行う。バイオマーカー候補分子については、三連四重極型質量分析計を用いたSRM/MRM(Selected Reaction Monitoring/Multiple Reaction Monitoring)法による検証を行うとともに、細胞の増殖、浸潤、転移といった癌化と関連する機能についての解析を行う。
【最終年度の成果】大腸癌臨床検体のプロテオーム解析により得られた癌転移に関わるバイオマーカー候補について、候補分子の絞り込みを行った。マウス同所移植モデルにより樹立した、転移性ヒト大腸癌細胞株のプロテオーム解析の結果との比較から、両方で共通な変化が見られた分子をSRM/MRMによる検証の候補とした。また、癌転移との機能的な関連について調べるため、in vitroでの浸潤能試験を行った。siRNAによるスクリーニングにより、癌浸潤に関わる新規分子を同定した。また、プロテオーム解析の結果にはこれまで未同定であったタンパク及びリン酸化タンパクが多く含まれていたので、それらの結果をデータベースへ登録した(http://www.proteomexchange.org/)(ID:PXD000089)。
【期間全体での成果】進行度の異なる大腸癌の臨床検体を用いた大規模リン酸化プロテオーム解析により、バイオマーカー候補および悪性化に関わる分子の探索を行った。解析条件の最適化により、これまで同定されなかった多くの分子が同定された。転移性株の解析結果との比較とパスウェイ解析により、バイオマーカー候補分子の絞り込みを行った。またin vitro浸潤能試験により、癌浸潤に関わる新規機能分子を同定した。今後は臨床検体でのSRM/MRMにより、癌転移マーカーとしての有用性について検証していく。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Identification of Missing Proteins in the neXtProt Database and Unregistered Phosphopeptides in the PhosphoSitePlus Database As Part of the Chromosome-Centric Human Proteome Project.2013

    • 著者名/発表者名
      Takashi Shiromizu
    • 雑誌名

      Journal of Proteome Research

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • DOI

      10.1021/pr300825v

    • 査読あり
  • [学会発表] Proteomic analysis of highly metastatic colorectal cancer cells established from orthotopic metastatic mouse model.2012

    • 著者名/発表者名
      Takashi Shiromizu
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      北海道
    • 年月日
      20120919-20120921
  • [学会発表] Quantitative proteomic profiling of orthotopic xenograft mouse model of colorectal cancer metastasis.2012

    • 著者名/発表者名
      Takashi Shiromizu
    • 学会等名
      HUPO2012 11th World Congress
    • 発表場所
      Boston, MA in the United States
    • 年月日
      20120909-20120913
  • [学会発表] 同所性移植モデルによる大腸癌転移性株の定量的プロテオーム解析2012

    • 著者名/発表者名
      白水 崇
    • 学会等名
      日本プロテオーム学会2012年大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2012-07-26

URL: 

公開日: 2014-07-24  

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