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2013 年度 実績報告書

細胞内超分子機械の機能変調イメージング

研究課題

研究課題/領域番号 23710144
研究機関京都大学

研究代表者

西山 雅祥  京都大学, 白眉センター, 准教授 (10346075)

キーワードべん毛モーター / タンパク質 / 分子機械 / 高圧力 / 1分子計測 / バイオイメージング / 高圧力顕微鏡 / バクテリア
研究概要

本研究課題では、細胞内にある水分子を利用して、タンパク質分子機械の構造と機能をコントロールする新しい分析手法の開発に取り組んできた。研究代表者がこれまで開発してきた高圧力顕微鏡を利用して、生きた大腸菌内で駆動するべん毛モーターの回転運動の変調計測を行った。前年度までの取り組みにより、高圧力下ではべん毛モーターの回転方向が反時計方向から時計方向へと逆になることを明らかにしている。平成25年度は、モーターの回転方向の圧力依存性と温度依存性について詳細な解析を行った。実験結果から示された反時計方向と時計方向の2つの回転状態が平衡関係にあると仮定し、これらの状態間の自由エネルギー差を求めたところ、常温常圧力条件下(23 ºC, 1気圧)では、標準自由エネルギーは23 kJ mol-1、反応体積は-320 Å3と算出された。なお、標準エンタルピーは-310 kJ mol-1、標準エントロピーは-1.1 kJ K-1 mol-1であった。モーター回転状態の自由エネルギーについて、圧力と温度に関する相図を作成したところ、概ね、40 MPaの圧力変化と8℃の温度変化毎に、自由エネルギー値は10 kJ mol-1変化することが明らかになった。このように自由エネルギー差が温度変化や圧力変化に対してほぼ線形に変化することから、モーターの構造はきわめて複雑であるものの、熱力学的には簡単なモデルで記述できることを明らかにできた。

  • 研究成果

    (9件)

すべて 2013 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (3件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] 高圧力顕微鏡2013

    • 著者名/発表者名
      西山雅祥 &木村佳文
    • 雑誌名

      LTMセンター誌

      巻: 22 ページ: 18-27

    • 査読あり
  • [雑誌論文] High hydrostatic pressure induces CCW to CW reversals of the Escherichia coli flagellar motor.2013

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama M., Sowa Y., Kimura Y., Homma M., Ishijima A. & Terazima M.
    • 雑誌名

      Journal of Bacteriology

      巻: 195 ページ: 1809-1814

    • DOI

      10.1128/JB.02139-12

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Glycine insertion makes yellow fluorescent protein sensitive to hydrostatic pressure.2013

    • 著者名/発表者名
      Watanabe TM., Imada K., Yoshizawa K., Nishiyama M., Kato C., Abe F., Morikawa T., Kinoshita M., Fujita H. & Yanagida T.
    • 雑誌名

      Plos ONE

      巻: 105 ページ: e73212

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0073212

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Single-molecule analysis of the rotation of F1-ATPase under high hydrostatic pressure.2013

    • 著者名/発表者名
      Okuno D., Nishiyama M., Noji H.
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 105 ページ: 1635-1642

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2013.08.036

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 細胞内の水で生命活動を操る! -高圧力下で観るタンパク質水和変調イメージング-2013

    • 著者名/発表者名
      西山雅祥, 曽和義幸
    • 雑誌名

      化学

      巻: 68 ページ: 31-36

  • [雑誌論文] バクテリア・べん毛モーターが高圧力下で逆向きに回り出す!?2013

    • 著者名/発表者名
      西山雅祥
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 53 ページ: 264-265

    • DOI

      10.2142/biophys.53.264

    • 査読あり
  • [学会発表] 極限環境で駆動する生体ナノマシンの直接観察

    • 著者名/発表者名
      西山雅祥
    • 学会等名
      法政大学ナノテクセミナー
    • 発表場所
      法政大学
    • 招待講演
  • [学会発表] 高圧力を用いたタンパク質分子機械構造変化イメージング

    • 著者名/発表者名
      西山雅祥
    • 学会等名
      日本機械学会2013年度大会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 招待講演
  • [学会発表] 高圧力顕微鏡の開発と生体分子機械の運動変調

    • 著者名/発表者名
      西山雅祥, 曽和義幸
    • 学会等名
      第61回 応用物理学会 春期学術講演会
    • 発表場所
      青山学院大学

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公開日: 2015-05-28  

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