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タンパク質のシミュレーションが難しい理由は，自由エネルギー曲面に多くの極小状態があるからである．この問題を解決するために提案されてきた手法の1つがレプリカ交換法である．
本研究では狙った構造に近づくように力をかける「へリックス・ストランドレプリカ交換法」を提案し，ペプチドに応用した．その結果，この方法では通常のレプリカ交換法よりも天然構造により近づけ，折りたたみにより成功した．
さらに「レプリカ置換法」を提案した．この手法では２つのレプリカ間だけで温度を交換するのではなく，３つ以上のレプリカ間で温度を置換する．この方法を用いることでレプリカ交換法よりも効率的なサンプリングを実現できることを示した．
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