APサイト結合リガンドとRCA反応に基づく高感度アプタマーセンサーの開発

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23750074
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 分析化学
• 研究機関: 東北大学
• 研究代表者: 徐 志愛 東北大学, 大学院・理学研究科, 助教 (50562336)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• キーワード: アプタマー / モルキュラービーコン / 蛍光リガンド / L-アルギニアミド / アデ ノシン / DNA / RNA

研究概要

本課題の研究成果の一つとして、脱塩基部位(APサイト)含有DNA二重鎖、RNA二重鎖、およびDNA/RNAハイブリッド二重鎖に対して結合するリガンドの結合特性の評価が挙げられる。もう一つの研究成果としては上記のリガンドに基づいた新しい種類のAPサイト含有アプタマーの構築が挙げられる。

研究成果

• [雑誌論文] Base-Pairing at the Abasic Site in DNA Duplexes and Its Application for Adenosine Aptasensor (2012)
  • 著者名/発表者名: Pang, Z. Xu, Y. Sato, S. Nishizawa and N. Teramae
  • 雑誌名: ChemBioChem 巻: 13 ページ: 436-442
  • DOI: DOI:10.1002/cbic.201100666
• [雑誌論文] Fluorescent aptasensors based on conformational adaptability of abasic site-containing aptamers in combination with abasic site-binding ligands (2011)
  • 著者名/発表者名: Z. Xu, Y. Sato, S. Nishizawa, and N. Teramae
  • 雑誌名: Biosensors & Bioelectronics 巻: 26 ページ: 4733-4738
  • DOI: DOI:10.1016/j.bios.2011.05.051
• [学会発表] A signal-on ATP aptasensor based on nucleobase-specific fluorescent ligands (2011)
  • 著者名/発表者名: Z. Xu, Y. Sato, S. Nishizawa, N. Teramae
  • 学会等名: The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry (ISNAC 2011)
  • 発表場所: Sapporo, Japan
  • 年月日: 2011-12-09
• [学会発表] Label-free aptasensors based on abasic site-containing DNA and nucleobase-specific fluorescent ligands (2011)
  • 著者名/発表者名: 徐志愛
  • 学会等名: 第28回無機分析コロキュウム
  • 発表場所: 東北大学 川渡共同セミナーセンター
  • 年月日: 2011-06-10
• [学会発表] Adenosine sensor based on AP site-containing DNA duplex and fluorescent ligand (2011)
  • 著者名/発表者名: Z. Xu, Y. Pang, Y. Sato, S. Nishizawa, N. Teramae
  • 学会等名: IUPAC International Congress on Analytical Sciences 2011 (ICAS 2011)
  • 発表場所: Kyoto, Japan
  • 年月日: 2011-05-25
• [備考] (東北大学大学院理学研究科化学専攻分析化学研究室)
  • URL: http://www.anal.chem.tohoku.ac.jp/