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タンパク質立体構造予測問題は生物物理における最重要問題の一つである。本研究はフラグメントアセンブリ法というこれまでで最も優れた構造予測手法の本質と限界を見極め、その弱点を補うべく、既知構造の安定な二次構造の順列変異によって新規フォールドを生成し立体構造予測する手法を開発した。構造予測手法の開発に際し必要となった、構造アラインメント手法やループクロス判定法など多数の構造解析プログラムも開発した。構造予測ベンチマークテストの結果、従来法では全く予測できなかったものに対して優れた予測が出来た例もあり、従来法と全く異なるアプローチによる立体構造予測法の確立に向けて確かな進歩を遂げることができた。
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