一分子計測法による複製フォークDNA特異的モーター蛋白質の機能解析

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23770204
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 韓 龍雲 京都大学, 物質-細胞統合システム拠点, 助教 (50566297)
• 研究協力者: 岩佐 拓磨
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• キーワード: DNA複製

研究概要

高精度で蛋白質やDNAの動きを計測、制御できる一分子計測技術を用いて、大腸菌のUvrDというDNAヘリケースやHolliday構造DNAの分岐点移動を促進するモーター蛋白質であるRuvBの機能解析を行った。 またDNA塩基配列特異的にDNAと相互作用する小化合物Pyrrole-Imidazole polyamideの構造とDNAに対する結合解離速度との関連性を明らかにすることに成功しました。

研究成果

• [雑誌論文] ParA-mediated plasmid partition driven by protein pattern self-organization (2013)
  • 著者名/発表者名: Ling-Chin Hwang、Anthony G. Vecchiarelli、Yong-Woon Han、Michiyo Mizuuchi、Yoshie Harada、Barbara E. Funnell and Kiyoshi Mizuuchi
  • 雑誌名: The EMBO Journal 巻: 32巻 ページ: 1238-1249
  • DOI: doi:10.1038/emboj.2013.34
  • 査読あり
• [雑誌論文] Binding of hairpin pyrrole and imidazole polyamides to DNA: relationship between torsion angle and association rate constants (2013)
  • 著者名/発表者名: Yong-Woon Han、Tomoko Matsumoto、Hiroaki Yokota、Gengo Kashiwazaki、Hironobu Morinaga 、Kaori Hashiya 、Toshikazu Bando、Yoshie Harada、Hiroshi Sugiyama
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 40巻 ページ: 11510-11517
  • DOI: doi:10.1093/nar/gks897
  • 査読あり
• [雑誌論文] 環状ピロール-イミダゾールポリアミドの合成とDNA認識能 (2012)
  • 著者名/発表者名: 韓 龍雲
  • 雑誌名: ファルマシア 巻: 48巻 ページ: 795
• [学会発表] Characterization of SRA-mediated DNA complexes dynamics related to chromatin structure regulation (2013)
  • 著者名/発表者名: Yong-Woon Han、Hiroaki Yokota、Mariko Ariyoshi、Yasuo Tsunaka、Takuma Iwasa、Ryuji Yokokawa、Ryo Hiramatsu、Daichi Chiba、Teruo Ono、Yoshie Harada
  • 学会等名: The 2013 Biophysical Society 57th Annual Meeting
  • 発表場所: フィラデルフィア、米国
  • 年月日: 20130201-06
• [学会発表] ナノ開口基板を用いたSRAドメインのヘミメチルCpG認識機構の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 韓 龍雲、横田浩章、有吉真理子、津中康央、岩佐拓磨、平松亮、千葉大地、小野輝男、横川隆司、原田慶恵
  • 学会等名: 2013年生体運動研究合同班会議
  • 発表場所: 広島大学
  • 年月日: 20130112-14
• [学会発表] GCGC配列を認識するヘアピン型ピロール-イミダゾールポリアミドのDNAに対する親和性はピロールをβ-アラニンに置換することで向上する (2012)
  • 著者名/発表者名: 韓 龍雲、横田浩章、松本朋子、森永浩伸、柏崎玄伍、橋谷かおり、坂東俊和、原田慶恵、杉山 弘
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] Funnell、Plasmid partition and cell division control via ATP-driven protein distribution pattern self-organization on bacterial intracellular surfaces (2012)
  • 著者名/発表者名: Mizuuchi Kiyoshi、Anthony G. Vicchiarelli、Ling-Chin Hwang、Keir Neumann、Yong-Woon Han、Arianna Biesso、Vassili Ivanov、Yoshie Harada、Barbara E
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] Characterization of protein-DNA complexes dynamics related to chromatin structure regulation using single-molecule techniques (2012)
  • 著者名/発表者名: Yong-Woon Han、Yoshie Harada
  • 学会等名: 第50回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 名古屋大学
  • 年月日: 20120922-24
• [学会発表] DNA塩基配列特異的に結合する小化合物Pyrrole-Imidazole Polyamide におけるPyrrole と Imidazole の構造学的特徴 (2012)
  • 著者名/発表者名: 韓 龍雲、松本朋子、横田浩章、柏崎玄伍、森永浩伸、橋谷かおり、坂東俊和、杉山弘、原田慶恵
  • 学会等名: 2012年生体運動研究合同班会議
  • 発表場所: 筑波大学
  • 年月日: 20120106-08
• [学会発表] Vecchiarelli、Michiyo Mizuuchi, Barbara E. Funnell、Yoshie Harada、Kiyoshi Mizuuchi、Direct observation of P1 plasmid movement on an optical microscope (2011)
  • 著者名/発表者名: Yong-Woon Han、Ling-Chin Hwang, Anthony G
  • 学会等名: 第49回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 兵庫県立大学
  • 年月日: 20110916-18
• [学会発表] Single-molecule visualization of a AAA+ DNA recombination ATPase with zero-mode waveguides toward elucidation of its hexamer formation (2011)
  • 著者名/発表者名: Takuma Iwasa、Yong-Woon Han、Hiroaki Yokota、Ryuji Yokokawa、Yoshie Harada
  • 学会等名: 第49回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 兵庫県立大学
  • 年月日: 20110916-18
• [備考]
  • URL: http://www.harada.icems.kyoto-u.ac.jp/member/mem03_han.html