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2012 年度 実績報告書

内在性小分子siRNA前駆体の成熟化プロセスの解明

研究課題

研究課題/領域番号 23770210
研究機関新潟大学

研究代表者

三好 智博  新潟大学, 研究推進機構 超域学術院, 助教 (60534550)

キーワードsiRNA / 小分子RNA / RNAサイレンシング / non-coding RNA
研究概要

RNAサイレンシングは、小分子RNAが関与する塩基配列特異的な遺伝子発現制御機構であり、細胞の増殖、発生、分化といった種々の生命現象に関わる必須メカニズムである。本機構に関わる内在性小分子RNAの一つにendo-siRNAがある。endo-siRNAの前駆体は、核で転写され細胞質に輸送され成熟化すると考えられているが、そのメカニズムは不明である。
siRNAの前駆体が、どのような配列・構造をもつRNAなのかを同定するために、siRNAのプロセシングに関与しているタンパク質(Loqs-PD)を用いて、共免疫沈降とノーザンブロットにより検出を行った。その結果、約40bpと約80bp付近にsiRNA前駆体と考えられるバンドが検出することが出来た。このことから、Loqs-PD複合体によって、siRNA前駆体がプロセスされることを明確に示した。
さらに、これまで明らかになっていないendo-siRNA合成経路に関わる新規因子の探索を行った。ショウジョウバエのAgo2は、RNA切断活性を持っている。Ago2は2本鎖siRNAの片方鎖を切断することで、siRNAを合成している。この最終ステップである2本鎖siRNAを切断する前と後で、Ago2の複合体形成因子が異なると考えられている。そこで、pre-RISCを形成すると考えられるスライサー活性の無い変異体Ago2を用いて、WT-Ago2との結合因子の違いを共免疫沈降とショットガン分析により解析を行なった。その結果、2本鎖siRNAをもつAgo2にのみ結合していると考えられる新たなタンパク質を同定することが出来た。ショウジョウバエ培養細胞を用いて、このタンパク質をノックダウンするとmiRNAの量は変化しなかったが、明らかにendo-siRNAの量が増加した。この結果から、この因子がendo-siRNAの合成量を調節していると考えられる。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (2件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] Roles of R2D2, a cytoplasmic D2 body component, in the endogenous siRNA pathway in Drosophila.2013

    • 著者名/発表者名
      Nishida KM, Miyoshi K, Ogino A,Miyoshi T, Siomi H, Siomi MC.
    • 雑誌名

      Molecular Cell

      巻: 49(4) ページ: 680-691

    • DOI

      doi:10.1016/j.molcel.2012.12.024.

  • [雑誌論文] Analysis of chimeric ribosomal stalk complexes from eukaryotic and bacterial sources: structural features responsible for specificity of translation factors.2012

    • 著者名/発表者名
      Mochizuki M, Kitamyo M, Miyoshi T,Ito K, Uchiumi T.
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 17(4) ページ: 273-284

    • DOI

      doi:10.1111/j.1365-2443.2012.01586.x.

  • [学会発表] Evidence for Interaction of the C-terminal Region Shared by Human Ribosomal Stalk Proteins P0/P1/P2 with eEF-1A/eEF-22012

    • 著者名/発表者名
      Onozuka, M., Baba, K., Miyoshi, T., Ito, K., Uchiumi, T.
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場、マリンメッセ福岡(福岡市)
    • 年月日
      20121211-20121214
  • [学会発表] The Hinge Regions of Eukaryotic Ribosomal Stalk Proteins are Indispensable for Efficient Depurination of 28S rRNA by Ribotoxins2012

    • 著者名/発表者名
      Yusa, K., Ohno, M., Miyoshi, T., Ito, K., Uchiumi, T.
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場、マリンメッセ福岡(福岡市)
    • 年月日
      20121211-20121214
  • [学会発表] Construction of in vitro Translation Elongation System with Archaeal Elongation Factors and Hybrid Ribosomes: Control of Interaction aEF-1A and Stalk aP1 by aEF-1B2012

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, T., Honda, T., Sato, S., Miyoshi, T., Ito, k., Uchiumi,. T.
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場、マリンメッセ福岡(福岡市)
    • 年月日
      20121211-20121214
  • [学会発表] リボトキシンによるリボソーム不活性化作用への動物リボソームstalkタンパク質の関与2012

    • 著者名/発表者名
      遊佐 和之,三好 智博,Ka-Ming Lee,大野 萌,伊東 孝祐,Kam-Bo Wong,内海 利男
    • 学会等名
      新潟生化学懇話会
    • 発表場所
      新潟大学(新潟市)
    • 年月日
      20120630-20120630

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公開日: 2014-07-24  

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