孔形成タンパク質の多量体化機構の解明

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23780107
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 応用生物化学
• 研究機関: 長崎大学
• 研究代表者: 郷田 秀一郎 長崎大学, 大学院・工学研究科, 准教授 (00346587)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• キーワード: タンパク質工学

研究概要

孔形成タンパク質は細胞表面で多量体化することによって膜孔を形成し、細胞を破壊する。本研究では、X線小角散乱、X線結晶構造解析法によって、膜孔形成多量体の多量体化における構造変化及び多量体の構造を明らかとした。X線小角散乱測定より海産無脊椎動物グミ由来溶血性レクチンは、まず初めに最小単位である7量体を形成し、その後、さらに7量体が3分子会合することによって21量体を形成すること、また、界面活性剤によって7量体に解離することを見出した。これらのことから界面活性剤存在下での結晶化を試み、良好な回折点を生じる結晶を得ることに成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Crystallization and preliminary crystallographic study of oligomers of the hemolytic lectin CEL-III from a sea cucumber Cucumaria echinata (2013)
  • 著者名/発表者名: Hideaki Unno, Keigo Hisamatsu, Tomonao Nagao, Yuki Tateya, Naoki Matsumoto, Shuichiro Goda and Tomomitsu Hatakeyama
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section F 巻: 69 ページ: 416-420
  • DOI: DOI:10.1107/S1744309113004065
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effects of detergents on the oligomeric structures of the hemolytic lectin CEL-III as determined by small-angle X-ray scattering (2013)
  • 著者名/発表者名: Shuichiro Goda, Hitoshi Sadakata, Hideaki Unno, Tomomitsu Hatakeyama
  • 雑誌名: Biosci Biotechnol Biochem 巻: 77 ページ: 679-681
  • DOI: DOI:10.1271/bbb.120981
  • 査読あり
• [雑誌論文] An assay for Carbohydrate-Binding Activity of Lectins using PolyamidoamineDendrimer Conjugated with Carbohydrates (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomomitsu HATAKEYAMA, Ryota KARINO,Yasuaki TERAI, Masanari KIMURA, Hideaki UNNO, Shuichiro GODA
  • 雑誌名: Biosci Biotechnol Biochem 巻: 76 ページ: 1999-2001
  • DOI: DOI:10.1271/bbb.120520
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural and thermodynamic characterization of the self-adhesive properties of human P-cadherin (2012)
  • 著者名/発表者名: Shota Kudo, Jose M. M. Caaveiro, Takamitsu Miyafusa, Shuichiro Goda, Keisuke Ishii,Tadashi Matsuura, Yukio Sudou, Tatsuhiko Kodama, Takao Hamakubo and Tsumoto Kouhei
  • 雑誌名: Molecular Biosyst 巻: 8 ページ: 2050-2053
  • DOI: DOI:10.1039/c2mb25161b
  • 査読あり
• [雑誌論文] Substrate-induced change in the quaternary structure of type 2 isopentenyldiphosphate isomerase from Sulfolobus shibatae (2012)
  • 著者名/発表者名: Hitomi Nakatani, Shuichiro Goda, Hideaki Unno, Takuya Nagai, Tohru Yoshimura, Hisashi Hemmi
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 巻: 194 ページ: 3216-3224
  • DOI: DOI:10.1128/JB.00068-12
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural modeling of RNase P RNA of the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT3 (2011)
  • 著者名/発表者名: Christian Zwieb, Yuji Nakao, Takashi Nakashima, Hisanori Takagi, Shuichiro Goda, Ebbe S Andersen, Yoshimitsu Kakuta, Makoto Kimura
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun 巻: 414 ページ: 517-522
  • DOI: DOI:10.1016/j.bbrc.2011.09.098
  • 査読あり
• [雑誌論文] Alteration of the Carbohydrate-Binding Specificity of a C-type Lectin CEL-I Mutant with an EPN Carbohydrate-Binding Motif
  • 著者名/発表者名: Tomomitsu Hatakeyama, Tomohiro Ishimine, Tomohiro Baba, Masanari Kimura, Hideaki Unno, and Shuichiro Goda
  • 雑誌名: Protein and Peptide Letters in press
  • 査読あり
• [学会発表] 棘皮動物グミ由来溶血性レクチンCEL-IIIの細胞膜貫通オリゴマー構造 (2013)
  • 著者名/発表者名: 畠山智充
  • 学会等名: 日本農芸化学会2013年度大会
  • 発表場所: 東北大学川内北キャンパス
  • 年月日: 20130324-27
• [学会発表] 溶血性レクチンCEL-IIIオリゴマーの結晶構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 畠山 智充
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場、マリンメッセ福岡
  • 年月日: 20121214-19
• [学会発表] サンゴ由来溶血性レクチン相同性タンパク質の糖認識の解明 (2012)
  • 著者名/発表者名: 工藤 彰洋
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場、マリンメッセ福岡
  • 年月日: 20121214-17
• [学会発表] Analysis of the structural change of the pore forming toxin by stopped-flow small-angle X-ray scattering (2012)
  • 著者名/発表者名: Shuichiro Goda
  • 学会等名: 3rd International Workshop on Expression, Structure and Function of Membrane Proteins
  • 発表場所: University of Florence Florence イタリア
  • 年月日: 20120923-27
• [学会発表] Crystallization of the pore forming toxin CEL-III from marine invertebrate, Cucumaria echinata (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomonao Nagao
  • 学会等名: 3rd International Workshop on Expression, Structure and Function of Membrane Proteins
  • 発表場所: University of Florence Florence イタリア
  • 年月日: 20120923-27
• [学会発表] 溶血性レクチンCEL-IIIの膜孔形成複合体結晶構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 海野英昭
  • 学会等名: 第36回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
  • 発表場所: フェニックスシーガイアリゾートサンホテルフェニックス"
  • 年月日: 20120906-08
• [学会発表] サンゴ由来レクチン相同性タンパク質の糖特異性の解明 (2012)
  • 著者名/発表者名: 工藤彰洋
  • 学会等名: 第36回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
  • 発表場所: フェニックスシーガイアリゾートサンホテルフェニックス
  • 年月日: 20120906-08
• [学会発表] 溶血性レクチンCEL-IIIの多量体化機構のX線小角散乱測定による解明 (2012)
  • 著者名/発表者名: 郷田秀一郎
  • 学会等名: 第29回PFシンポジウム
  • 発表場所: つくば国際会議場
  • 年月日: 20120315-16