アコヤガイ幼生の貝殻形成関連遺伝子の探索

2012 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 23780209
• 研究機関: 沖縄科学技術大学院大学
• 研究代表者: 竹内 猛 沖縄科学技術大学院大学, その他の研究科, 研究員 (60599231)
• キーワード: アコヤガイ / バイオミネラリゼーション / ゲノム / トランスクリプトーム / プロテオーム

研究概要

アコヤガイ幼生の貝殻形成の仕組みを解明するために、貝殻形成に関わるタンパク質および遺伝子を同定した。アコヤガイゲノム情報、次世代シーケンサーを用いた遺伝子発現解析、アコヤガイ全遺伝子を対象としたマイクロアレイ解析、貝殻プロテオーム解析を行うことで、網羅的にタンパク質及び遺伝子の探索に成功した。成体と幼生でタンパク質の組成や遺伝子発現パターンを比較したところ、アコヤガイの幼生と成体の貝殻は、全く異なる仕組みで形成されていることが明らかになった。

研究成果

• [雑誌論文] Annotation of the pearl oyster genome (2013)
  • 著者名/発表者名: Kazuyoshi Endo
  • 雑誌名: Zoological Science 巻: in press ページ: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] The beginning of the annotation community of a mollusk genomics: Toward creating the curated complete gene-set of the Japanese pearl oyster, Pinctada fucata (2013)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Kawashima
  • 雑誌名: Zoological Science 巻: in press ページ: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] MarinegenomicsDB: An integrated genome viewer for community-based annotation of genomes (2013)
  • 著者名/発表者名: Ryo Koyanagi
  • 雑誌名: Zoological Science 巻: in press ページ: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] The diversity of shell matrix proteins: genome-wide investigation of the pearl oyster Pinctada fucata (2013)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Miyamoto
  • 雑誌名: Zoological Science 巻: in press ページ: in press
  • 査読あり
• [学会発表] Genome-wide survey for biomineralization genes in the Japanese pearl oyster Pinctada fucata (2013)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Takeuchi
  • 学会等名: International Symposium on Biomineralization
  • 発表場所: Freiberg, Germany
  • 年月日: 20130827-20130830
• [学会発表] バイオミネラリゼーション解明へのゲノムの貢献 (2013)
  • 著者名/発表者名: 竹内猛・遠藤一佳
  • 学会等名: マリンバイオテクノロジー学会
  • 発表場所: 沖縄県市町村自治会館
  • 年月日: 2013-06-01
• [学会発表] Pearl oyster genome provides insight into biomineralization (2012)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Takeuchi
  • 学会等名: Retreat Meetiog og the IMSUT & RCAST Global COE
  • 発表場所: 沖縄科学技術大学院大学
  • 年月日: 20121105-20121107
• [学会発表] 軟体動物のゲノム解読：アコヤガイゲノムを例に (2012)
  • 著者名/発表者名: 竹内 猛
  • 学会等名: 日本動物学会
  • 発表場所: 大阪大学
  • 年月日: 20120913-20120915
  • 招待講演
• [学会発表] トランスクリプトームによるアコヤガイ幼生貝殻形成関連遺伝子の探索
  • 著者名/発表者名: 竹内 猛
  • 学会等名: バイオミネラリゼーションワークショップ
  • 発表場所: 東京大学
• [備考] Marine genomics unit Genome Browser
  • URL: http://marinegenomics.oist.jp/genomes/gallery
• [備考] Marine genomics unit homepage
  • URL: https://groups.oist.jp/mgu