インフルエンザウイルスと抗体の相互作用の解析と抗原変異予測への応用

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23780305
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 応用獣医学
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 五十嵐 学 北海道大学, 人獣共通感染症リサーチセンター, 特任助教 (10374240)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• キーワード: インフルエンザ / ウイルス / 計算科学 / 分子動力学 / 抗体

研究概要

インフルエンザの流行を効率よく制御するためには、抗原変異の機序を理解し、予測することが必要である。本研究では、インフルエンザウイルスの主要抗原であるヘマグルチニン（HA）とそのモノクローナル抗体（mAb）に焦点をあて、ウイルスがmAbからエスケープする際に起こるHA上のアミノ酸置換の特徴を明らかにすることを目的とした。具体的には、アミノ酸置換に伴うHA-mAb複合体の相互作用変化、およびHAの機能や構造安定性への影響を分子シミュレーション等の計算科学的手法により解析し、実際にエスケープ変異株で観測されるアミノ酸と比較した。

研究成果

• [雑誌論文] Antiviral activity of stachyflin on influenza A viruses of different hemagglutinin subtypes (2013)
  • 著者名/発表者名: Motohashi Y, Igarashi M, Okamatsu M, Noshi T, Sakoda Y, Yamamoto N, Ito K, Yoshida R, Kida H
  • 雑誌名: Virol J 巻: 10 ページ: 118
  • DOI: 10.1186/1743-422X-10-118
  • 査読あり
• [雑誌論文] Resampling nucleotide sequences with closest-neighbor trimming and its comparison to other methods (2013)
  • 著者名/発表者名: Yonezawa K, Igarashi M, Ueno K, Takada A, Ito K
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 8 (10) ページ: e57684
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0057684
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel mutations in Marburg virus glycoprotein associated with viral evasion from antibody-mediated immune pressure (2013)
  • 著者名/発表者名: Kajihara M, Nakayama E, Marzi A, Igarashi M, Feldmann H, Takada A
  • 雑誌名: J Gen Virol 巻: 94(4) ページ: 876-883
  • DOI: 10.1099/vir.0.049114-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular mechanisms underlying oseltamivir resistance mediated by an I117V substitution in the neuraminidase of subtype H5N1 avian influenza A viruses (2013)
  • 著者名/発表者名: Takano R, Kiso M, Igarashi M, Le QM, Sekijima M, Ito K, Takada A, Kawaoka Y
  • 雑誌名: J Infect Dis 巻: 207(1) ページ: 88-97
  • DOI: 10.1093/infdis/jis633
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gnarled-Trunk Evolutionary Model of Influenza A Virus Hemagglutinin (2013)
  • 著者名/発表者名: Ito K, Igarashi M, Miyazaki Y, Murakami T, Iida S, Kida H, Takada A
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 6(10) ページ: e25953
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0025953
  • 査読あり
• [雑誌論文] An H5N1 highly pathogenic avian influenza virus that invaded Japan through waterfowl migration (2013)
  • 著者名/発表者名: Kajihara M, Matsuno K, Simulundu E, Muramatsu M, Noyori O, Manzoor R, Nakayama E, Igarashi M, Tomabechi D, Yoshida R, Okamatsu M, Sakoda Y, Ito K, Kida H, Takada A
  • 雑誌名: Jpn J Vet Res 巻: 59 ページ: 89-100
  • URL: http://hdl.handle.net/2115/47149
  • 査読あり
• [備考]
  • URL: http://www.czc.hokudai.ac.jp/bioinform/members/igarashi/index_j.html