二成分制御系における連鎖的シグナル伝達機構の構造生物学的解明

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23790042
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 物理系薬学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 上田 卓見 東京大学, 大学院・薬学系研究科, 助教 (20451859)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• キーワード: 構造生物学

研究概要

本研究では、申請者らの開発したNMR手法である交差飽和法を用いて、原核生物の走化性を制御する細胞内シグナル伝達タンパク質であるCheAとCheYの複合体が、反応部位同士が互いに近接した状態と、離れた状態の平衡状態にあることを明らかにした。これにより、CheAが、シグナル伝達に必要な二つの反応を、一つの反応部位で、両方とも効率よく進めているメカニズムが解明された。

研究成果

• [雑誌論文] Efficacy of the -2-adrenergic receptor is determined byconformational equilibrium in thetransmembrane region (2012)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Kofuku, Takumi Ueda, JunyaOkude, Yutaro Shiraishi, Keita Kondo,Masahiro Maeda, Hideki Tsujishita, andIchio Shimada
  • 雑誌名: Nature Commun. 巻: 3 ページ: 1045
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis of efficient electron transport between photosynthetic membrane proteins and plastocyanin in spinach revealed using nuclear magnetic resonance (2012)
  • 著者名/発表者名: Takumi Ueda, Naoko Nomoto, Masamichi Koga, Hiroki Ogasa, Yuuta Ogawa, Masahiko Matsumoto, Pavlos Stampoulis, Koji Sode, Hiroaki Terasawa, and Ichio Shimada
  • 雑誌名: Plant Cell 巻: 24 ページ: 4173-4186
  • 査読あり
• [雑誌論文] Segmental isotopic labeling of a 140 kDa dimeric multi-domain protein CheA from Escherichia coli by expressed protein ligation and protein trans-splicing (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuichi Minato, Takumi Ueda, Asako Machiyama, Ichio Shimada, and Hideo Iwai
  • 雑誌名: J.Biomol. NMR 巻: 53 ページ: 191-207
  • 査読あり
• [雑誌論文] Atypical membrane-embedded phosphatidylinositol3,4-bisphosphate (PI(3,4)P2)-binding site on p47phox Phox homology (PX) domain revealed by NMR. (2012)
  • 著者名/発表者名: Pavlos Stampoulis, Takumi Ueda, Masahiko Matsumoto, Hiroaki Terasawa, and Ichio Shimada
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 287 ページ: 17848-17859
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional Equilibrium of the KcsA Structure Revealed by NMR (2012)
  • 著者名/発表者名: Imai S., Osawa M., Mita K., Toyonaga S., Machiyama A., Ueda T., Takeuchi K., Oiki S., and Ichio Shimada
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 287 ページ: 39634-39641
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional dynamics of proteins revealed by NMR (2012)
  • 著者名/発表者名: Masanori Osawa, Koh Takeuchi, Takumi Ueda, Noritaka Nishida, and Ichio Shimada
  • 雑誌名: Curr. Opin. Struct. Biol. 巻: 22 ページ: 660-669
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Atmospheric Scanning Electron Microscope with open sample space observes dynamic phenomena in liquid or gas (2011)
  • 著者名/発表者名: Mitsuo Suga, Hidetoshi Nishiyama, Yuji Konyuba, Shinnosuke Iwamatsu, Yoshiyuki Watanabe, Chie Yoshiura, Takumi Ueda, andChikara Sato
  • 雑誌名: Ultramicroscopy 巻: 111 ページ: 1650-1658
• [学会発表] Development of interferogram extrapolation method for NMR experiments that requires accurate peakheight (2012)
  • 著者名/発表者名: Takumi Ueda, Masahiko Matsumoto, Ichio Shimada
  • 学会等名: ISNMR2011
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 20121115-1118
• [学会発表] Structural Elucidation of the AlternateSignal Transduction Mechanism of CheA (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuichi Minato, Takumi Ueda, AsakoMachiyama, Hideo Iwai, Ichio Shimada,
  • 学会等名: International Conference on MagneticResonance in Biological Systems
  • 発表場所: リヨン(フランス)
  • 年月日: 20120819-0824