腸管出血性大腸菌における志賀毒素耐性機構の解明

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23790478
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 細菌学(含真菌学)
• 研究機関: 宮崎大学
• 研究代表者: 小椋 義俊 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 助教 (40363585)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• キーワード: 病原性

研究概要

腸管出血性大腸菌O157の主要な病原因子である志賀毒素(Stx)は、真核生物の28SリボゾームRNAを切断し、タンパク質合成を阻害する。他方、Stxは大腸菌に対しても毒性を示し、大腸菌K-12株でStxを発現させると増殖が著しく阻害される。申請者は、O157がStxに対して抵抗性を示すことに着目し、O157のゲノムライブラリー中にK-12へのStx毒性を抑制するクローンを見いだし、それらがO157ゲノム上の3つの域に存在することを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Transcriptomic analysis of four developmental stages of Strongyloides (2013)
  • 著者名/発表者名: E. Nagayasu, Y. Ogura, T. Itoh, A. Yoshida, G. Chakraborty, T. Hayashi, H. Maruyama
  • 雑誌名: venezuelensis. Parasitol. Int. 巻: 62(1) ページ: 57-65
  • DOI: DOI:10.1016/j.parint.2012.09.006
  • 査読あり
• [雑誌論文] A human outbreak case associated with Escherichia albertii (2013)
  • 著者名/発表者名: T. Ooka, E. Tokuoka, M. Fukuhara, T. Nagamura, Y. Ogura, K. Aisawa, S. Harada, T. Hayashi
  • 雑誌名: Emerg. Infect. Dis 巻: 19(1) ページ: 144-146
  • DOI: DOI:10.3201/eid1901,120646
  • 査読あり
• [雑誌論文] Complete Genome Sequence of a Propionibacterium acnes Isolate from a Sarcoidosis Patient. (2013)
  • 著者名/発表者名: K.Minegishi, C. Aikawa, A. Furukawa, T. Watanabe, T. Nakano, Y. Ogura, Y. Ohtsubo, K. Kurokawa, T. Hayashi, F. Maruyama, I. Nakagawa, Y
  • 雑誌名: Genome Announc. 巻: 1(1) ページ: e00016-12
  • DOI: DOI:10.1128/genomeA.00016-12.
• [雑誌論文] Detection of diverse aquatic microbes in blood and organs of drowning victims: First metagenomic approach using high- throughput 454-pyrosequencing (2012)
  • 著者名/発表者名: E. Kakizaki, Y. Ogura, S. Kozawa, S. Nishida, T. Uchiyama, T. Hayashi, N. Yukawa
  • 雑誌名: Forensic Sci. Int. 巻: 220 ページ: 135-146
  • DOI: DOI:10.1016/j.forsciint.2012.02.010
  • 査読あり
• [雑誌論文] A sensitive and simple plaque formation method for the Stx2 phage of Escherichia coliO157:H7, which does not form plaques in the standard plating procedure (2012)
  • 著者名/発表者名: Md. R. Islam, Y. Ogura, Md. Asdulghani, T. Ooka, K. Murase, Y. Gotoh, T. Hayashi
  • 雑誌名: Plasmid 巻: 67(3) ページ: 227-235
  • DOI: DOI:10.1016/j-plasmid.2011.12.001
  • 査読あり
• [雑誌論文] Complete genome sequence of Helicobacter cinaedistrain PAGU611, isolated in a case of human bacteremia. (2012)
  • 著者名/発表者名: T. Goto, Y. Ogura, H. Hirakawa, J. Tomida, Y. Morita, T. Akaike, T. Hayashi, Y. Kawamura
  • 雑誌名: J. Bacteriol 巻: 194(14) ページ: 3744-3745
  • DOI: DOI:10.1128/JB.00645-12
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hemolysin E- and enterohemolysin-derived hemolytic activity of O55/O157 strains and other Escherichia colilineages. (2012)
  • 著者名/発表者名: K. Murase, T. Ooka, A. Iguchi, Y. Ogura, K. Nakayama, Md. Asadulghani, Md. R. Islam, H. Hiyoshi, T. Kodama, L. Beutin, T. Hayashi
  • 雑誌名: Microbiology 巻: 158 ページ: 746-758
  • DOI: DOI:10.1099/mic.0.054775-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Clinical significance of Escherichia albertii (2012)
  • 著者名/発表者名: T. Ooka, K. Seto, K. Kawano, H. Kobayashi, Y. Etoh, S. Ichihara, A. Kaneko, J. Isobe, K. Yamaguchi, K. Horikawa, T.A.T. Gomes, A. Linden, M. Bardiau, J. Mainil, L. Beutin, Y. Ogura, T. Hayashi
  • 雑誌名: Emerg. Infect. Dis 巻: 18(3) ページ: 488-492
  • 査読あり
• [雑誌論文] Is bile acid a determinant of the gut microbiota on a high-fat diet? (2012)
  • 著者名/発表者名: A. Yokota, S. Fukiya, T. Ooka, Y. Ogura, T. Hayashi, S. Ishizuka
  • 雑誌名: Gut Microbes 巻: 3(5) ページ: 455-459
  • DOI: DOI:10.4161/gmic.21216
  • 査読あり
• [雑誌論文] Whole-genome sequence of a hypervirulent clinical Mycobacterium intracellularestrain (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Tateishi, S. Kitada, K. Miki, R. Maekura, Y. Ogura, Y. Ozeki, Y. Nishiuchi, M. Niki, T. Hayashi, K. Hirata, K. Kobayashi, S. Matsumoto
  • 雑誌名: M.i.198. J. Bacteriol. 巻: 194(22) ページ: 6336
  • DOI: DOI:10.1128/JB.01439-12
  • 査読あり
• [雑誌論文] 腸管出血性大腸菌O111の進化と病原性 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小椋義俊, 大岡唯祐, 林哲也
  • 雑誌名: 神経内科 巻: 76(2) ページ: 155-163
• [雑誌論文] 腸管出血性大腸菌における病原性のゲノム進化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小椋義俊, 林哲也
  • 雑誌名: 感染・炎症・免疫 巻: 42 ページ: 182-195
• [雑誌論文] Bile acid is a host factor that regulates the composition of the cecal microbiota in rats (2011)
  • 著者名/発表者名: K.B. Islam, S. Fukiya, M. Hagio, N. Fujii, S. Ishizuka, T. Ooka, Y. Ogura, T. Hayashi, A. Yokota
  • 雑誌名: Gastroenterology 巻: 141(5) ページ: 1773-1781
  • DOI: DOI:10.1053/j.gastro.2011.07.046
  • 査読あり
• [雑誌論文] Wide distribution of O157-antigen biosynthesis gene clusters 1 in Escherichia coli (2011)
  • 著者名/発表者名: A. Iguchi, H. Shirai, K. Seto, T. Ooka, Y. Ogura, T. Hayashi, K. Osawa, R. Osawa
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 6(8) ページ: e23250
  • DOI: DOI:10.1371/journal.pone.0023250
  • 査読あり
• [雑誌論文] The lifestyle of the segmented filamentous bacterium: a nonculturable gut-associated immunostimulating microbe inferred by whole-genome sequencing (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Kuwahara, ,Y. O g u r a, K. Oshima, K. Kurokawa, T, Ooka, H. Hirakawa, T, Itoh. H. Nakayama-Imaohji, M. Ichimura, K. Itoh, C. Ishifune, Y. Maekawa, K. Yasutomo, M. Hattori, T. Hayashi
  • 雑誌名: DNA Res 巻: 18 ページ: 291-303
  • DOI: DOI:10.1093/dnares/dsr022
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterisation of the Porphyromonas gingivalisconjugative transposon CTnPg1:determination of the integration site and the genes essential for conjugal transfer (2011)
  • 著者名/発表者名: M. Naito, K. Sato, M. Shoji, H. Yukitake, Y. Ogura, T. Hayashi, K. Nakayama
  • 雑誌名: Microbiology 巻: 157 ページ: 2022-2032
  • DOI: DOI:10.1099/mic.0.047803-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] IS621-based multiplex PCR printing method of O26 enterohaemorrhagic and enteropathogenic Escherichia coliisolated from humans and cattle (2011)
  • 著者名/発表者名: J.G. Mainil, M. Bardiau, T. Ooka, Y. Ogura, K. Murase, Y. Etoh, S. Ichihara, K. Horikawa, G. Buvens, D. Pierard, T. Itoh, T. Hayashi
  • 雑誌名: J. Appl. Microbiol 巻: 111 ページ: 773-786
  • DOI: DOI:10.1111/j.1365-2672.2011.05089.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] The genome of Erysipelothrix rhusiopathiae,the causative agent of swine erysipelas, reveals new insights into the evolution of Firmicutesand the organism's intracellular adaptations (2011)
  • 著者名/発表者名: Y. Ogawa, T. Ooka, F. Shi, Y. Ogura, K. Nakayama, T. Hayashi, Y. Shimoji
  • 雑誌名: J. Bacteriol 巻: 193(12) ページ: 193(12)
  • DOI: DOI:10.1128/JB.01500-10
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome sequence of Photobacterium mandapamensisstrain svers.1.1, the bioluminescent symbiont of the cardinal fish Siphamia versicolor. (2011)
  • 著者名/発表者名: H. Urbanczyk, Y. Ogura, TA. Hendry, AL. Gould, N. Kiwaki, JT. Atkinson, T. Hayashi, PV. Dunlap
  • 雑誌名: J. Bacteriol 巻: 193(12) ページ: 3144-3145
  • DOI: DOI:10.1128/JB.00370-11
  • 査読あり
• [学会発表] 高解像度系統解析による腸管出血性大腸菌O157のStx2高産生性系統の同定 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小椋義俊, Md Rakibul Islam, 真子俊博, 大岡唯祐, 大西真, 林哲也
  • 学会等名: 第86回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 20130318-20
• [学会発表] 腸管出血性大腸菌O26におけるゲノムアダプテーション解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小椋義俊, 桂啓介, 伊藤武彦, Mainil Jacques , 吉野修司, 磯部順子, 勢戸和子, 江藤良樹, 黒木真理子, 木全恵子, 前田詠里子, 後藤恭宏, 大岡唯祐, 林哲也
  • 学会等名: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 長浜
  • 年月日: 20130308-10
• [学会発表] O157 Stx2 phageの包括的ゲノム比較・機能解析により明らかとなったStx2高産生型phagenの存在 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小椋義俊, Md. Rakibul Islam, 真子俊博, 大岡唯祐, 大西真, 林哲也
  • 学会等名: 第16回腸管出血性大腸菌感染症研究会
  • 発表場所: 秋田
  • 年月日: 20120719-20
• [学会発表] Comparative genomics of Stx2 prophages in O157:H7 (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Ogura, T. Mako, T. Ooka, M. Ohnishi, T. Hayashi
  • 学会等名: VTEC 2012: 8^th International Symposium on Shiga Toxin (Verocytotoxin) producing Escherichia coli infections
  • 発表場所: Amsterdam, The Netherlands.
  • 年月日: 20120506-09
• [学会発表] 既存のソフトウエアを駆使した実験研究者による微生物ゲノム情報解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小椋義俊
  • 学会等名: 第85回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 長崎
  • 年月日: 20120327-29
• [学会発表] 腸管侵入性大腸菌のゲノム解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小椋義俊,大岡唯祐,磯部順子,河野喜美子, 松本昌門, 勢戸和子, 岩出義人,緒方喜久代, 林哲也
  • 学会等名: 第6回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20120310-12
• [学会発表] Comparative analysis of STX2 prophages in enterohemorrhagic Escherichia coli O-157 (2011)
  • 著者名/発表者名: Y. O g u r a, M. Ohnishi, T. Mako, K. Kawano, T. Ooka, T. Hayashi
  • 学会等名: UMS 2011(第84回日本細菌学会総会)
  • 発表場所: Sapporo
  • 年月日: 20110906-10
• [学会発表] 腸管出血性大腸菌O157の志賀毒素ファージの比較解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小椋義俊
  • 学会等名: 第5回細菌学若手コロッセウム
  • 発表場所: 高知
  • 年月日: 20110808-10
• [学会発表] ゲノム解析から見えてきた腸管出血性大腸菌の病原性進化メカニズム (2011)
  • 著者名/発表者名: 小椋義俊
  • 学会等名: 日本細菌学会関東支部・ICD制度協議会共催「緊急セミナー:腸管出血性大腸菌の今」
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2011-08-02
• [図書] 第4章 新規ゲノム配列決定編 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小椋義俊, 林哲也
  • 総ページ数: 252
  • 出版者: 細菌ゲノム. 細胞工学別冊 次世代シークエンサー 目的別アドバンストメソッド, 監修 菅野純夫/鈴木穣
• [図書] 病原菌と常在菌の境界(第6 章腸内共生系の破綻と疾病) (2011)
  • 著者名/発表者名: 小椋義俊, 林哲也
  • 総ページ数: 292
  • 出版者: 丸善出版