定量プロテオミクスに基づく心筋症発症を規定する分子ネットワークの網羅的解析

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23790889
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 循環器内科学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 若林 真樹 京都大学, 大学院・薬学研究科, 助教 (70552024)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• キーワード: 心筋症 / リン酸化プロテオミクス / 定量プロテオミクス

研究概要

本研究では再現性、網羅性、定量性を担保し、組織中のタンパク質を抽出する手法を確立した。本手法を最適化したリン酸化ペプチド濃縮法と組み合わせ、LC-MS/MS 測定に供することで、2 種類の心筋症モデルマウスとその対照マウスの心臓組織から約 6000 のリン酸化ペプチドを同定することに成功した。 これらすべてのペプチドの定量比較を行ったところ、全体の約 20%程度のリン酸化ペプチドにおいて、2 倍以上の変化がみられることが明らかとなった。これらの情報から病態を誘発しうるシグナルネットワークの同定を進めている。

研究成果

• [雑誌論文] (2013)
  • 著者名/発表者名: Ryota Yamana, Mio Iwasaki, Masaki Wakabayashi, Masato Nakagawa, Shinya Yamanaka, Yasushi Ishihama
  • 雑誌名: Journal of Proteome Research 巻: 12 ページ: 214-221
  • DOI: DOI:10.1021/pr300837u
• [雑誌論文] Temporal Profiling of Lapatinib-suppressed Phosphorylation Signals in EGFR/HER2 Pathways (2012)
  • 著者名/発表者名: Koshi Imami, Naoyuki Sugiyama, Haruna Imamura, Masaki Wakabayashi, Masaru Tomita, Masatoshi Taniguchi, Takayuki Ueno, Masakazu Toi, Yasushi Ishihama
  • 雑誌名: Molecular and Cellular Proteomics 巻: 11 ページ: 1741-1757
  • DOI: DOI:10.1074/mcp.M112.019919
• [雑誌論文] A putative polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase/Williams-Beuren syndrome chromosome region 17 (WBSCR17) regulates lamellipodium formation and macropinocytosis (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshiaki Nakayama, Naosuke Nakamura, Sayoko Oki, Masaki Wakabayashi, Yasushi Ishihama, Ayumi Miyake, Nobuyuki Itoh, Akira Kurosaka.
  • 雑誌名: The Journal of Biological Chemistry 巻: 287 ページ: 32222-32235
  • DOI: DOI:10.1074/jbc.M112.370932
• [雑誌論文] Analytical strategies for shotgun phosphoproteomics: status and prospects (2012)
  • 著者名/発表者名: Haruna Imamura, Masaki Wakabayashi, Yasushi Ishihama
  • 雑誌名: Seminars in Cell & Developmental Biology 巻: 23 ページ: 836-842
  • DOI: DOI:10.1016/j.semcdb.2012.05.007
• [学会発表] リン酸化プロテオミクスを用いた分子標的薬プロファイリング (2013)
  • 著者名/発表者名: 若林真樹
  • 学会等名: 日本薬学会第133 年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川)
  • 年月日: 20130327-30
• [学会発表] ジメチル標識ペプチドのRP-LC における保持共同評価と定量プロテオミクスの高効率化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 若林真樹
  • 学会等名: 第23回クロマトグラフィー科学会議
  • 発表場所: 長良川国際会議場(岐阜)
  • 年月日: 20121115-16
• [学会発表] In-depth pharmaco-phosphoproteomics using meter-long monolithic columns to evaluate molecular-targeting drugs (2012)
  • 著者名/発表者名: Masaki Wakabayashi
  • 学会等名: 19th International Mass Spectrometry Conference
  • 発表場所: 京都国際会館(京都)
  • 年月日: 20120915-21
• [学会発表] Highly sensitive phosphoproteome profiling of various human cancers from minuscule amount of formalin-fixed and paraffin-embedded tissue sections on slides (2012)
  • 著者名/発表者名: Masaki Wakabayashi
  • 学会等名: HUPO 2012 11th Annual World Congress
  • 発表場所: Boston (USA)
  • 年月日: 20120909-13
• [学会発表] リン酸化修飾シグナル病の解明に向けた極微量臨床試料解析法の構築 (2012)
  • 著者名/発表者名: 若林真樹
  • 学会等名: 第25回バイオメディカル分析化学シンポジウム
  • 発表場所: 慶応大学薬学部(東京)
  • 年月日: 20120808-10
• [学会発表] リン酸化プロテオーム計測システムの高感度化と極微量組織試料への応用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 若林真樹
  • 学会等名: 第11回次世代を担う若手のためのフィジカルファマフォラム
  • 発表場所: ホテル平安の森京都(京都)
  • 年月日: 20120806-07
• [学会発表] 微量組織試料のリン酸化プロテオーム解析法 (2012)
  • 著者名/発表者名: 若林真樹
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2012 年大会
  • 発表場所: 日本科学未来館(東京)
  • 年月日: 20120726-27
• [学会発表] Enhanced identification of phosphopeptides by peptide dimethylation coupled with titania chromatography (2012)
  • 著者名/発表者名: Masaki Wakabayashi
  • 学会等名: 60th American Society for Mass Spectrometry Conference
  • 発表場所: Vancouver (Canada)
  • 年月日: 20120520-24
• [学会発表] Enhanced identification of phosphopeptides by peptide dimethylation coupled with titania chromatography (2012)
  • 著者名/発表者名: Masaki Wakabayashi
  • 学会等名: Asia Oceania Human Proteome Organization 6th Congress
  • 発表場所: Beijing (China)
  • 年月日: 20120505-07
• [学会発表] 高感度LC-MS/MS システムを用いた極微量組織試料のプロテオーム解析技術の確立 (2011)
  • 著者名/発表者名: 若林真樹、増田豪、石濱泰
  • 学会等名: 第22回クロマトグラフィー科学会
  • 発表場所: 東北大学(宮城)
  • 年月日: 20111020-22
• [学会発表] 微量組織試料に対する定量的リン酸化プロテオーム解析法の確立 (2011)
  • 著者名/発表者名: 若林真樹、塚原麻伊、吉原宏樹、増田豪、石濱泰
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会 2011 年大会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ(新潟)
  • 年月日: 20110728-30
• [図書] ナノバイオ技術と最新創薬応用研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 若林真樹、杉山直幸、石濱泰
  • 総ページ数: 102-108
  • 出版者: メディカルドゥ