| 研究課題/領域番号 |
23K05354
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| 研究機関 | 倉敷芸術科学大学 |
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研究代表者 |
柳下 直己 倉敷芸術科学大学, 生命科学部, 教授 (50434840)
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| 研究分担者 |
山野 ひとみ 倉敷芸術科学大学, 生命科学部, 准教授 (70811983)
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| 研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2027-03-31
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| キーワード | 大陸沿岸性遺存 / 瀬戸内海 / 有明海 / 水産資源管理 / 保全 |
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| 研究実績の概要 |
ヒラ，コウライアカシタビラメ，およびセトダイの 3 種について，瀬戸内海や有明海から標本を採集した。これら 3 種について，ミトコンドリア (mt) DNA 調節領域 (CR) 全塩基配列を決定するための PCR プライマーを開発し，塩基配列を決定した。ヒラでは，瀬戸内海から 38 個体，有明海から 46 個体，および八代海から 20 個体を採集した。本種のmtCR 全塩基配列を決定するための PCR プライマーはすでに開発されていたが (Wang et al. 2016)，PCRを数回に分けて行う必要があったため，1 度の PCR で全塩基配列を決定可能なプライマーセットを新たに開発した。開発したプライマーセットを用いて，瀬戸内海産 26 個体，有明海産 24 個体，および八代海産 8 個体の全58 個体について，mtCR 全塩基配列 (1146 bp) を決定した。Wang et al. (2016) における中国大陸沿岸の集団の塩基配列データを含めて予備解析した結果，遺伝的多様性（ハプロタイプ多様度）は中国大陸沿岸の集団に比べ有明海産集団で低く，八代海産集団と瀬戸内海産集団でやや低かった。コウライアカシタビラメでは，瀬戸内海から 25 個体と有明海から 30 個体を採集した。本種の mtCR 全塩基配列を決定するための PCR プライマーは開発されていなかったため新たに開発した。開発したプライマーセットを用いて，有明海産 24 個体について mtCR 全塩基配列 (662bp) を決定した。セトダイでは，瀬戸内海から 24 個体を採集した。本種についても mtCR 全塩基配列を決定するための PCR プライマーは開発されていなかったため新たに開発した。開発したプライマーセットを用いて，これら 24 個体の mtCR 全塩基配列 (734bp) を決定した。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
水揚げ量が少ない等の理由により，標本の入手が遅れている。コイチについては，まだ瀬戸内海産と有明海産の標本を入手できていない。セトダイについては，有明海産の標本を入手できていない。また，ヒラとコウライアカシタビラメを含む全 4 種について，他海域産の個体が入手できていない。全 4 種について，mtCR 全塩基配列を決定するための PCR プライマーの開発に成功しており，標本が入手できれば滞りなくデータ収集することができる。
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| 今後の研究の推進方策 |
コイチでは瀬戸内海産と有明海産の標本を，セトダイでは有明海産の標本を速やかに採集する。ヒラとコウライアカシタビラメを含む全 4 種について，他海域からも標本を採集する。新たに得られた標本について引き続き mtCR の全塩基配列を決定し，コウライアカシタビラメについてはマイクロサテライト遺伝子座 (SSR) の多型についての分析を開始する。データが揃った種から解析を行い，学会発表と論文出版を行う。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
十分な個体数を採集できなかったため，標本の採集と分析にかかる諸費用の一部を次年度に繰り越した。次年度は速やかに標本を採集し，mtCR 全塩基配列の決定を進める。また，コウライアカシタビラメについては，SSR の分析を進める。
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