Artificial Intelligence analysis of the immune-checkpoint and immuno-oncology in B-cell non-Hodgkin lymphoma

2023 年度 実施状況報告書

• 研究課題/領域番号: 23K06454
• 研究機関: 東海大学
• 研究代表者: カレーラス ジュアキム 東海大学, 医学部, 講師 (90637191)
• 研究期間 (年度): 2023-04-01 – 2026-03-31
• キーワード: lymphoma / targeted sequencing / immuno-oncology / immune microenvironment / immune checkpoint / molecular pathology / hematological neoplasia / NGS

研究実績の概要

BCL6-rearrangement (BCL6-R) is associated with a favorable prognosis of follicular lymphoma (FL), but the mechanism is unknown. We analyzed the clinicopathological, immune microenvironment (immune checkpoint, immuno-oncology markers), and mutational profiles of 10 BCL6-R-positive FL, and 19 BCL6-R-positive diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) cases (both BCL2-R and MYC-R negative). A custom-made panel included 168 genes related to aggressive B-cell lymphomas and FL. Both BCL6-R-positive FL and BCL6-R-positive DLBCL had a common mutational profile; but also, differences. DLBCL cases had a higher density of microenvironment markers.

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

The project is progressing well, and as expected.

今後の研究の推進方策

We will continue the evaluation of immuno-oncology markers in larger series of cases and plan next set of NGS analysis.

次年度使用額が生じた理由

Since NGS mutational profile is very expensive, some amount from first year was moved to second year.

備考

The following internet sites connect to the research outputs.
Most of the results are in Open Access Journals (DOAJ).

研究成果

• [雑誌論文] Mutational, immune microenvironment, and clinicopathological profiles of diffuse large B-cell lymphoma and follicular lymphoma with BCL6 rearrangement (2024)
  • 著者名/発表者名: Carreras Joaquim、Ikoma Haruka、Kikuti Yara Yukie、Miyaoka Masashi、Hiraiwa Shinichiro、Tomita Sakura、Kondo Yusuke、Ito Atsushi、Nagase Shunsuke、Miura Hisanobu、Kawada Hiroshi、Roncador Giovanna、Campo Elias、Hamoudi Rifat、Nakamura Naoya
  • 雑誌名: Virchows Archiv 巻: 484 ページ: 657～676
  • DOI: 10.1007/s00428-024-03774-z
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Artificial Intelligence, Lymphoid Neoplasms, and Prediction of MYC, BCL2, and BCL6 Gene Expression Using a Pan-Cancer Panel in Diffuse Large B-Cell Lymphoma (2024)
  • 著者名/発表者名: Carreras Joaquim、Nakamura Naoya
  • 雑誌名: Hemato 巻: 5 ページ: 119～143
  • DOI: 10.3390/hemato5020011
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Artificial Intelligence Analysis and Reverse Engineering of Molecular Subtypes of Diffuse Large B-Cell Lymphoma Using Gene Expression Data (2024)
  • 著者名/発表者名: Carreras Joaquim、Yukie Kikuti Yara、Miyaoka Masashi、Miyahara Saya、Roncador Giovanna、Hamoudi Rifat、Nakamura Naoya
  • 雑誌名: BioMedInformatics 巻: 4 ページ: 295～320
  • DOI: 10.3390/biomedinformatics4010017
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Tumor heterogeneity and immune-evasive T follicular cell lymphoma phenotypes at single-cell resolution (2023)
  • 著者名/発表者名: Suma S, Suehara Y, Fujisawa M, Abe Y, Hattori K, Makishima K, Sakamoto T, Sawa A, Bando H, Kaji D, Sugio T, Kato K, Akashi K, Matsue K, Carreras J, Nakamura N, Suzuki A, Suzuki Y, Ito K, Shiiba H, Chiba S, Sakata-Yanagimoto M
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 38 ページ: 340～350
  • DOI: 10.1038/s41375-023-02093-7
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Hepatic niche leads to aggressive natural killer cell leukemia proliferation through transferrin-transferrin receptor 1 axis (2023)
  • 著者名/発表者名: Kameda K, Yanagiya R, Miyatake Y, Carreras J, Higuchi H, Murayama H, Ishida T, Ito A, Iida S, Fukuhara N, Harigae H, Fujioka Y, Takahashi N, Wada H, Ishida F, Nakazawa H, Ishihara R, Murakami Y, Tagawa H, Matsuura T, Nakagawa S, Iwabuchi S, Hashimoto S, Imadome KI, Nakamura N, Ishizawa K, Kanda Y, Ando K, Kotani A
  • 雑誌名: Blood Journal 巻: 142 ページ: 352～364
  • DOI: 10.1182/blood.2022018597
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Mutational Profile and Pathological Features of a Case of Interleukin-10 and RGS1-Positive Spindle Cell Variant Diffuse Large B-Cell Lymphoma (2023)
  • 著者名/発表者名: Carreras Joaquim、Kikuti Yara Yukie、Miyaoka Masashi、Hiraiwa Shinichiro、Tomita Sakura、Ikoma Haruka、Kondo Yusuke、Ito Atsushi、Nagase Shunsuke、Miura Hisanobu、Roncador Giovanna、Colomo Lluis、Hamoudi Rifat、Campo Elias、Nakamura Naoya
  • 雑誌名: Hematology Reports 巻: 15 ページ: 188～200
  • DOI: 10.3390/hematolrep15010020
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] The pathobiology of follicular lymphoma (2023)
  • 著者名/発表者名: Carreras Joaquim
  • 雑誌名: Journal of Clinical and Experimental Hematopathology 巻: 63 ページ: 152～163
  • DOI: 10.3960/jslrt.23014
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [学会発表] My research life in Japan (2024)
  • 著者名/発表者名: Carreras Joaquim
  • 学会等名: 第113回日本病理学会総会
  • 招待講演
• [学会発表] Gene expression and mutational profile of PD-L1 positive diffuse large B-cel l lymphoma (2024)
  • 著者名/発表者名: Carreras Joaquim
  • 学会等名: 第113回日本病理学会総会
• [学会発表] High Expression of Caspase-8 Associated with Improved Survival in Diffuse Large B-Cell Lymphoma (2023)
  • 著者名/発表者名: Carreras Joaquim
  • 学会等名: 第112回日本病理学会総会
• [学会発表] P-44. High PD-L1 expression correlated with poor prognosis of diffuse large B-cell lymphoma (2023)
  • 著者名/発表者名: Carreras Joaquim
  • 学会等名: 第63回日本リンパ網内系学会学術集会・総会
• [学会発表] P-66. Surface CD3陰性Monomorphic epitheliotropic intestinal T-cell lymphoma 3例の遺伝子変異解析 (2023)
  • 著者名/発表者名: 冨田さくら, Joaquim Carreras, 菊池イアーラ幸江, 堂本英治, Edoardo Missiaglia, Justine Bouilly, Andrey Leourneau, Laurence de Leval
  • 学会等名: 第63回日本リンパ網内系学会学術集会・総会
• [学会発表] P-68. Nodal marginal zone lymphomaの遺伝子発現解析 (2023)
  • 著者名/発表者名: 生駒悠, Carreras Joaquim, 菊池イアーラ幸江, 中村直哉
  • 学会等名: 第63回日本リンパ網内系学会学術集会・総会
• [備考] Research Activities of Joaquim Carreras
  • URL: http://carreras.med.u-tokai.ac.jp/
• [備考] ORCID
  • URL: https://orcid.org/0000-0002-6129-8299
• [備考] Researchgate of Joaquim Carreras
  • URL: https://www.researchgate.net/profile/Joaquim-Carreras
• [備考] Loop Joaquim Carreras
  • URL: https://loop.frontiersin.org/people/956781/publications
• [備考] Scilit Joaquim Carreras
  • URL: https://www.scilit.net/scholars/9538763