| 研究課題/領域番号 |
23K14115
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| 研究機関 | 慶應義塾大学 |
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研究代表者 |
足立 晴彦 慶應義塾大学, 政策・メディア研究科(藤沢), 特任助教 (90965443)
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| 研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| キーワード | ゲノムシークエンス |
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| 研究実績の概要 |
本研究では、ライブイメージングをはじめとした、種々の細胞学的実験への応用が期待されている、カワリヌマエビにおいて、in vivo遺伝子発現系の確立を目指している。遺伝子発現系の確立に必要なゲノム情報を得るために、本年度は、ナノポアシークエンサーPromethION(Oxford Nanopore Technologies)を用いて、ロングリードシークエンスを行った。3回のシークエンスを行うことで、３０xに近いカバレッジのリードセットが得られ、それを用いてアセンブルを行うことで、ドラフトゲノムの獲得に成功した。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
1: 当初の計画以上に進展している
理由
今後の展開に重要なドラフトゲノムを獲得できたため。
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| 今後の研究の推進方策 |
今後は、これまで研究で獲得されたドラフトゲノム情報を用いて、特定の遺伝子の5'上流配列をクローニングし、蛍光レポーターとともにコンストラクトを作製、および個体への導入を行うことで、in vivo遺伝子発現系の確立を目指す。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
申請者は本年度より所属機関が異動になったが、異動先の機関にすでにいくつか解析に必要な機器が共通利用できる環境であり、予想以上にスムーズに計画が進行したため、次年度使用額が生じた。本年度得られた結果をさらに発展させるため次年度以降引き続き研究を進行させたい。
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