研究課題/領域番号 |
23K14127
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研究機関 | 沖縄科学技術大学院大学 |
研究代表者 |
佐古 博皓 沖縄科学技術大学院大学, 細胞シグナルユニット, ポストドクトラルスカラー (80793570)
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研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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キーワード | タンパク質分解 / protein truncation / プロテアソーム / タンパク質の多様性 |
研究実績の概要 |
今年度は、当初の想定を上回る興味深いデータが得られた。転座調節と翻訳に関するタンパク質を検討していたところ、あるタンパク質のバリアントが、alternative splicing/translation非依存的かつプロテアソーム分解依存的にマウスの各組織で発現していることがわかった。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
1: 当初の計画以上に進展している
理由
当初の想定を上回る興味深いデータが得られたため。
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今後の研究の推進方策 |
当初の研究計画を部分的に変更し、マウス各組織に発現する異なるタンパク質のバリアントがどのようにプロテアソーム分解依存的に発現するのか、そのメカニズムを検討する。 具体的には、当該タンパク質をモデルにしたプロテアソーム分解依存的にバリアントが産生されるレポーターを作成し、CRISPRノックアウトスクリーニングによってどの遺伝子が関与しているのか検討する。また、マウス各組織のRNA-Seqデータを利用し、当該タンパク質のバリアントと相関するような発現パターンを示す遺伝子も検討する。
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次年度使用額が生じた理由 |
当初の研究計画とは異なる実験を組む必要に迫らせたことに加え、効果的かつ効率的に高価な出費対象であるRNA-Seqや質量分析解析を削減することができたため。
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