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2023 年度 実施状況報告書

単一細胞クロマチン接近性解析に基づいた、エピゲノム編集による配偶子形成制御

研究課題

研究課題/領域番号 23K18084
研究機関東京理科大学

研究代表者

前澤 創  東京理科大学, 創域理工学部生命生物科学科, 准教授 (90548174)

研究期間 (年度) 2023-06-30 – 2026-03-31
キーワード配偶子形成 / エピゲノム / 生殖科学 / エピゲノム編集 / 分化誘導
研究実績の概要

本研究では、エピゲノム編集技術を用いて胚性幹細胞や精原細胞から、精母細胞や精子細胞への分化誘導法の確立を目指している。哺乳類の精子形成期では、精原細胞の分化開始期、減数分裂期、および半数体期においてエピゲノムやクロマチン構造が大きく変化することで、分化段階特異的な遺伝子発現が制御されている。エピゲノムやクロマチン構造が変化するゲノム領域には特徴的なDNA配列モチーフが検出されるため、それらのゲノム領域を標的にエピゲノム編集を行うこととした。
本年度は、第一に、マウス精巣を用いたscATAC-seqデータ解析からエピゲノム編集の標的領域の選定を行った。scATAC-seqデータ解析により、精子形成過程で特異的に変動するゲノム領域を同定し、さらに、特徴的なDNA配列を有する領域やエピゲノム変化が生じている領域を絞り込んだ。それらの領域に結合することが推測された転写因子の中には、精子形成での機能が未知の転写因子が存在していた。そこでdual-luciferase assayを用いて転写活性化能を検証した結果、精子形成関連遺伝子群の発現上昇に機能することが示されたため、エピゲノム編集領域の候補領域の1つとして利用した。
第二に、培養細胞を用いたレポーターアッセイにより、活性化型および抑制型のエピゲノム編集の実験系を確立した。赤色蛍光タンパク質をレポーターとした活性化型エピゲノム編集系、および緑色蛍光タンパク質をレポーターとした抑制型エピゲノム編集系を構築し、それらを同時に機能させる条件検討を実施した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

当初の予定では、エピゲノム編集の領域の選定およびレポーターアッセイによる効率測定の他に、内在性の遺伝子群を標的としてエピゲノム編集の効果を評価する予定であったため。

今後の研究の推進方策

今後、内在性の遺伝子群を標的としたエピゲノム編集を実施し、遺伝子発現の変化をRNA-seq法を用いて経時的に解析する。また、遺伝子発現変動のみられた段階におけるエピゲノムやクロマチンアクセシビリティの変化を、CUT&Tag法やATAC-seq法を用いて同定する。想定外の変化が生じた場合や十分な遺伝子発現変動がみられなかった場合には、エピゲノム制御因子に対する阻害剤添加との併用を検討する。さらに、胚性幹細胞や精原細胞に対してエピゲノム編集を行い、精子形成過程における分化誘導能を遺伝子発現変化や染色体形態変化を指標に評価する。

次年度使用額が生じた理由

23年度に予定していた、内在性の遺伝子群を標的としたエピゲノム編集の効果測定にかかる費用(試薬代および解析費用)が未使用であったため、24年度に繰り越した。24年度に当実験および解析を実施する予定である。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2023

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 5件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 5件)

  • [雑誌論文] PRC1 directs PRC2-H3K27me3 deposition to shield adult spermatogonial stem cells from differentiation2023

    • 著者名/発表者名
      Hu Mengwen、Yeh Yu-Han、Maezawa So、Nakagawa Toshinori、Yoshida Shosei、Namekawa Satoshi?H
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 52 ページ: 2306~2322

    • DOI

      10.1093/nar/gkad1203

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] CTCF-mediated 3D chromatin predetermines the gene expression program in the male germline2023

    • 著者名/発表者名
      Kitamura Yuka、Takahashi Kazuki、Maezawa So、Munakata Yasuhisa、Sakashita Akihiko、Kaplan Noam、Namekawa Satoshi H.
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1101/2023.11.30.569508

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] KRAB-zinc-finger proteins regulate endogenous retroviruses to sculpt germline transcriptomes and genome evolution2023

    • 著者名/発表者名
      Otsuka Kai、Sakashita Akihiko、Maezawa So、Schultz Richard M.、Namekawa Satoshi H.
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1101/2023.06.24.546405

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] PRC1 suppresses a female gene regulatory network to ensure testicular differentiation2023

    • 著者名/発表者名
      Maezawa So、Yukawa Masashi、Hasegawa Kazuteru、Sugiyama Ryo、Iizuka Mizuho、Hu Mengwen、Sakashita Akihiko、Vidal Miguel、Koseki Haruhiko、Barski Artem、DeFalco Tony、Namekawa Satoshi H.
    • 雑誌名

      Cell Death & Disease

      巻: 14 ページ: -

    • DOI

      10.1038/s41419-023-05996-6

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Polycomb protein SCML2 mediates paternal epigenetic inheritance through sperm chromatin2023

    • 著者名/発表者名
      Sakashita Akihiko、Ooga Masatoshi、Otsuka Kai、Maezawa So、Takeuchi Chikara、Wakayama Sayaka、Wakayama Teruhiko、Namekawa Satoshi?H
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 51 ページ: 6668~6683

    • DOI

      10.1093/nar/gkad479

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著

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公開日: 2024-12-25  

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