| 研究課題/領域番号 |
21H02351
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究機関 | 北海道大学 |
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研究代表者 |
山崎 淳平 北海道大学, 獣医学研究院, 准教授 (20732902)
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| 研究分担者 |
木之下 怜平 北海道大学, 獣医学研究院, 助教 (30761150)
松本 悠貴 アニコム先進医療研究所株式会社(研究開発課), 研究開発課, 研究員 (40831384)
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| 研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2025-03-31
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| キーワード | DNAメチル化 |
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| 研究実績の概要 |
イヌの悪性黒色腫における特異的なDNAメチル化の変化を血漿中セルフリーDNAに応用し、次世代シークエンサーを用いて微小な腫瘍細胞を検出することによってイヌの悪性黒色腫の早期発見および治療後の新規方針策定につなげるため、R5年度は以下の項目について検討を行った。
1. 腫瘍症例の臨床的評価・検体収集：北海道大学動物医療センターに来院する犬のリンパ腫および悪性黒色腫の症例、肛門嚢腺癌や移行上皮癌症例を追跡、組織サンプルを採取、また血漿を収集し凍結保存した。2. 解析候補メチル化領域の選抜：悪性黒色腫に関しては5か所のCpG配列に絞り込んである。その他の疾患については、特異的CpG配列の同定をすすめている。3. 臨床的評価との相関解析：本年度はさらに6症例延べ8個の異なる症例かつ異なる日付の血漿サンプルについて、上記5か所のDNAメチル化定量を行った。このうち、数症例において同時に評価した腫瘍の進行度とDNAメチル化レベルとの相関が見られた。4. 肛門嚢腺癌2症例における治療前・後の血漿DNAを直接ゲノムワイドDNAメチル化解析に供する試みを行ったところ、700～3000箇所のDNAメチル化レベルが変化していることが判明し、経時的なDNAメチル化の変化を捉えることが可能であることが示唆された。候補CpG領域単独よりも広範な領域をターゲットとすることで、より正確な病状変化との相関を見いだすことが可能となるかもしれない。現在、より多くのサンプルで見られるかどうかサンプル数を増やしている。5. 超早期診断への応用：一次病院における同一個体の数か月～1年毎の定期健康診断サンプルを経時的に収集中である。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
1. 血漿セルフリーDNAを用いた高深度（高カバレッジ）なDNAメチル化定量によって、期待していた病状に相関したDNAメチル化の変化が数症例において認められている。また、ゲノムワイドなDNAメチル化解析を直接応用することによって広範なDNAメチル化の変化が症例の治療前後で認められている。
2．一方で、病状との相関やが認められた症例数が少ないため、その一般性を見いだせていない。
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| 今後の研究の推進方策 |
これまでの研究成果によって、イヌの悪性黒色腫や肛門嚢腺癌における血漿セルフリーDNAの高感度なDNAメチル化定量およびゲノムワイド解析が可能となり、同一症例におけるDNAメチル化変動が病状と相関や広範なDNAメチル化の変化が認められた。今後も悪性黒色腫やその他の腫瘍症例の血漿サンプル収集も継続していき、それぞれの腫瘍に特異的なDNAメチル化変化を用いた早期診断、治療後因子の樹立を念頭におき研究を推進していく。
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