| 研究課題/領域番号 |
22H02863
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究機関 | 筑波大学 |
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研究代表者 |
森川 一也 筑波大学, 医学医療系, 教授 (90361328)
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| 研究分担者 |
尾花 望 筑波大学, 医学医療系, 助教 (00722688)
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| 研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2026-03-31
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| キーワード | 黄色ブドウ球菌 / 限定的発現遺伝子 |
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| 研究実績の概要 |
申請者らは数%以下の亜集団に発現するブドウ球菌遺伝子を見出し、限定的発現遺伝子esp (expression in minor subpopulation)と名付けた。しかし幾つかのespを除いて多くのesp遺伝子の役割は不明であり、このことは集団多様性に基づく未知のシステムが多数存在することを示唆している。本研究は、これら機能未知esp遺伝子群が担う役割を「espと同時に発現する遺伝子セット」という新たな視点から解明することを目的としており、当該年度は以下を行った。
・先行して研究が進んでいるesp15（自然形質転換における遺伝子取り込み装置関連の遺伝子）と同時に発現する遺伝子セットを明らかにしているが、その中に２種類の機能未知遺伝子が含まれてる。これら機能未知遺伝子群の破壊株を作成して、自然形質転換に影響するかどうかを検討したところ、これらは形質転換に必須ではないが効率に影響するという結果を得た。
・espの一つで、転写抑制因子と予想されている遺伝子について検討を進めた。本遺伝子は通常培養条件では数パーセント以下の発現であるが、様々な培養条件を検討したところ、特定条件でほぼ全ての細胞で発現する条件が見出された。この条件に関連する機能について、検討を開始した。
・幾つかのesp遺伝子について、レポータ強度の最適化を進めた。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
特定のesp遺伝子関連の研究は進んでいる一方で、多くのesp遺伝子についてはレポータ作成の段階であり、当初予定より遅れているため。
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| 今後の研究の推進方策 |
比較的研究が進んでいる２種類のespについては、さらに詳細な検討、すなわち自然形質転換に関するものは、同時に発現してくる遺伝子の特性解析、また誘導条件が明らかになったespについては予想される機能について、RNA-seq解析の利用なども検討して論文化をすすめる。
当初計画に沿って、その他esp遺伝子群についても改良レポータの作成を継続し、順次RNA-seqに供与して行く方針である。
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