| 研究課題/領域番号 |
22H03212
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究機関 | 大阪大学 |
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研究代表者 |
野々村 祝夫 大阪大学, 大学院医学系研究科, 教授 (30263263)
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| 研究分担者 |
柴 知史 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 特任研究員 (00797003)
山田 拓司 東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 (10437262)
谷内田 真一 大阪大学, 大学院医学系研究科, 教授 (20359920)
松下 慎 大阪大学, 大学院医学系研究科, 招へい教員 (40824785)
藤田 和利 近畿大学, 医学部, 准教授 (50636181)
波多野 浩士 大阪大学, 大学院医学系研究科, 講師 (60762234)
岡田 随象 大阪大学, 大学院医学系研究科, 教授 (70727411)
中村 昇太 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 (90432434)
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| 研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2026-03-31
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| キーワード | prostate cancer / microbiome / metagenome analysis / metabolome analysis / GWAS / lifestyle |
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| 研究実績の概要 |
現在までに、大阪大学泌尿器科および近畿大学泌尿器科を受診し、前立腺生検を受けた患者166例（生検陰性61例、前立腺癌患者107名）の直腸スワブから腸内細菌DNAを抽出し、ショットガン解析を終了している。またその150名から採取した血液よりDNAを抽出しGWAS解析を終了した。また、これらの症例における生活習慣アンケートの取得を終えている。これまでに多症例の前立腺癌患者のGWAS解析の結果が報告されており、BBJ sumstats (EAS; Sakaue et al. 2022, case = 5,672, control = 84,660)およびPRACTICAL sumstats (EUR; Schumacher et al. 2018, case = 79,194, control = 61,112)のデータを用いて多遺伝子リスクスコア（polygenetic risk score (PRS)）を統計学的に作成した。
さらに、PRSと今回の166例のGWAS結果を用いて解析を行うと、有意にPRSは前立腺癌と関連を認めた。
一方、患者から得られた直腸スワブを用いて16sRNAシーケンスを実施した。先のPRSを用いて腸内細菌叢との関連解析を行ったところ、疾患特異性SNPと特定の腸内細菌叢には明確な相関を認めなかった。これはおそらく、サンプルサイズが小さいことに起因すると考え、さらに採取献体w数を増やすため、前記2施設意外にも5施設からのサンプル供与を頂くことにした。現在さらに症例登録数を増やしている。
興味深いことに、前立腺肥大の有無と腸内細菌叢には相関が認め、Firmicutes/ Bacteroidetes (F/B) 比が有意に前立腺肥大症の患者で高いことが明らかとなった。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
当初目標としていた300例には達していないものの、生検受診者における腸内細菌叢の解析と、血液を用いたGWAS解析が行えた。GWAS解析に基づくpolygenic risk score (PRS) を作成したところ、PRSは前立腺癌と有意な相関を認めた。また、登録患者の生活習慣アンケートの取得も終了している。より研究結果の信憑性を上げるため、症例登録数の増加を図り、進めている。
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| 今後の研究の推進方策 |
当初目的の300例には達していないまでも、GWASに基づくRPSと前立腺癌には、有意な相関を認めたが、肝腎の腸内細菌叢との相関を得るまでには至らなかったため、さらに症例を追加する必要があると考える。
全国、7施設（大阪大学泌尿器科、近畿大学泌尿器科にさらに5施設を加えて）で、前立腺生検受験者の直腸スワブと生活習慣アンケートの収集を行い、更なる解析を行うこととし、すでに症例を増やしつつある。目標症例数を1000例に設定した。
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