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2022 年度 実績報告書

C1微生物代謝生理を活用した炭素循環型メタノールバイオエコノミーの構築と分子基盤

研究課題

研究課題/領域番号 22H03802
配分区分補助金
研究機関京都大学

研究代表者

由里本 博也  京都大学, 農学研究科, 准教授 (00283648)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
キーワード環境技術 / 応用微生物 / 発現制御 / メタン酸化 / メタノール誘導 / メタノール酵母
研究実績の概要

1.メタンからメタノールへの直接変換技術の開発
我々がこれまでに独自に開発したメタノールセンサー酵母を用いて、新奇メタン酸化生体触媒の開発を行うとともに、我々が見出した新奇メタン酸化菌におけるメタン酸化酵素遺伝子の同定に向けた研究を行った。これまでに開発したメタン酸化生体触媒へのランダム変異や部位特異的変異の導入を進めた。新奇メタン酸化菌における遺伝子破壊や遺伝子高発現を行うために、栄養要求性変異株の取得と分子育種系の構築を進めるとともに、メタン酸化酵素候補遺伝子を破壊するための遺伝子断片を作成した。
2.酵母メタノール誘導制御機構の分子基盤解明
メタノール酵母による異種タンパク質高生産の根幹を担う「強力なメタノール誘導性遺伝子発現」という本酵母の重要形質を制御する、各種転写因子の作用機構、メタノール濃度に応答したシグナル伝達経路に関する研究を進めた。Komagataella pfaffiiにおいて、メタノール濃度情報がプロテインキナーゼPkc1を経て転写活性化因子Mxr1に伝達され、Mxr1のリン酸化レベルがメタノール濃度に応じて変化することを明らかにした。さらにプロテインキナーゼSnf1複合体のメタノール誘導における役割について、複合体を構成するサブユニットの遺伝子破壊株構築と表現型解析を進めた。
3.植物生長促進効果をもつ葉面C1微生物の生理機能解析
葉面C1微生物の植物上での生存戦略と植物生長促進に関わる代謝生理機能を解析し、メタノールから生産するC1微生物菌体を新規微生物製剤として植物バイオマス増産に活用するための植物-微生物間相互作用の分子基盤解明に向けた研究を行った。メタノール細菌が生産するシデロフォアの役割を報告するとともに、様々な植物試料から葉面酵母の単離と生育特性の解析を進めた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

メタンからメタノールへの直接変換技術の開発については、概ね計画通りに進展しており、各種変異体や遺伝子破壊用ベクターの構築を進めている。酵母メタノール誘導制御機構の分子基盤解明については、メタノール濃度情報のシグナル伝達と転写因子Mxr1のリン酸化制御について明らかにし、原著論文として報告した。葉面C1微生物の生理機能解析についても、当初の計画通りに進展しており、葉面から複数の酵母株を単離した。

今後の研究の推進方策

メタンからメタノールへの直接変換技術の開発については、新規メタン酸化生体触媒の開発とその高発現系の構築を継続するとともに、新奇メタン酸化菌における遺伝子破壊や遺伝子発現のための宿主・ベクター系を整備する。酵母メタノール誘導制御機構の分子基盤解明については、転写因子のリン酸化制御やDNA結合に関する解析を進める。葉面C1微生物の生理機能解析については、葉面酵母の分離をさらに進めるとともに、単離した葉面酵母についての特性解析を行う。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Siderophore for Lanthanide and Iron Uptake for Methylotrophy and Plant Growth Promotion in Methylobacterium aquaticum Strain 22A2022

    • 著者名/発表者名
      Juma Patrick Otieno、Fujitani Yoshiko、Alessa Ola、Oyama Tokitaka、Yurimoto Hiroya、Sakai Yasuyoshi、Tani Akio
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 13 ページ: 921635

    • DOI

      10.3389/fmicb.2022.921635

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Phosphoregulation of the transcription factor Mxr1 plays a crucial role in the concentration‐regulated methanol induction in <i>Komagataella phaffii</i>2022

    • 著者名/発表者名
      Inoue Koichi、Ohsawa Shin、Ito Shinji、Yurimoto Hiroya、Sakai Yasuyoshi
    • 雑誌名

      Molecular Microbiology

      巻: 118 ページ: 683~697

    • DOI

      10.1111/mmi.14994

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Interaction between C1-microorganisms and plants: contribution to the global carbon cycle and microbial survival strategies in the phyllosphere2022

    • 著者名/発表者名
      Yurimoto Hiroya、Sakai Yasuyoshi
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 87 ページ: 1~6

    • DOI

      10.1093/bbb/zbac176

    • 査読あり
  • [学会発表] 葉圏C1微生物の生理・生態から明らかになる新たな炭素循環像とバイオスティミュラントとしての機能開発2023

    • 著者名/発表者名
      阪井康能、由里本博也
    • 学会等名
      日本農薬学会第48回大会
    • 招待講演
  • [学会発表] 葉面からの酵母の単離・同定と特性評価2023

    • 著者名/発表者名
      重田佳奈、白石晃將、由里本博也、阪井康能
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
  • [学会発表] Komagataella phaffiiにおける濃度依存性メタノール誘導に重要な転写因子KpMxr1のリン酸化状態の解析2023

    • 著者名/発表者名
      井上紘一、由里本博也、阪井康能
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
  • [学会発表] Komagataella phaffiiにおけるメタノール誘導性遺伝子発現に関与するSnf1複合体の機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      北山岳人、井上紘一、岡本大樹、由里本博也、阪井康能
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
  • [学会発表] Domain analyses and phospho-regulation of a transcription factor Mxr1 responsible for methanol-induced gene expression in Komagataella phaffii2022

    • 著者名/発表者名
      Koichi Inoue, Shin Ohsawa, Hiroya Yurimoto, Yasuyoshi Sakai
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies
    • 国際学会
  • [学会発表] Distribution and survival strategy of methylotrophs in the phyllosphere2022

    • 著者名/発表者名
      Yasuyoshi Sakai, Kosuke Shiraishi, Hiroya Yurimoto
    • 学会等名
      Phyllosphere 2022
    • 国際学会
  • [学会発表] Komagataella phaffiiにおける転写因子Mxr1のメタノール濃度に依存したリン酸化制御2022

    • 著者名/発表者名
      井上紘一、大澤晋、由里本博也、阪井康能
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第55回研究報告会
  • [学会発表] メチロトローフ細菌由来バイオポリマーによる稲作収量の向上2022

    • 著者名/発表者名
      由里本博也
    • 学会等名
      C1ケムバイオエコノミーシンポジウム
    • 招待講演

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公開日: 2023-12-25  

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